GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508240 GSM508240的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 243504 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 243504 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K14696-7907 i-spy编号：1219 实验名称：243504 研究：ISPY 年龄：45.98 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：2 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：5.5 临床t分期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：3 er（0=负；1=正；）：1 pgr（0=阴性；1=阳性；）：1 pam50的固有亚型：Luminal A 新辅助化疗*（1=ac仅；2=ac+t；3=ac+t+herceptin；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：1 病理完全应答（pcr）：否 rcb等级：II=rcb指数大于1.36或等于3.28 无复发生存时间–从化疗开始到最早：局部或远处进展或死亡的时间（时间单位为天）：1183 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：1140 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：7 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 243504 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 .327 44290 80 22 39 14 94 27 55 18 345 80 54 93 35 44 -.072 .46 0 .327 2 .24 44084 63 16 40 16 63 23 53 18 246 80 52 62 13 16 -1.201 .13 0 .24 三 .084 43878 130 37 38 15 154 56 55 21 223 80 54 152 92 98 .091 .75 0 .084 4 .002 43672 118 30 39 16 133 39 56 18 253 80 55 131 77 78 -.056 .67 0 .002 5 .471 43466 164 54 39 16 246 94 57 19 224 80 56 243 130 180 .581 .86 0 .471 6 -.08 43260 74 26 39 15 75 27 56 18 252 80 55 74 26 25 -.881 .29 0 -.08 7 .372 43054 79 20 39 15 95 33 56 20 266 80 55 94 34 44 -.037 .5 0 .372 8 -.329 42848 69 18 40 16 65 25 56 21 242 80 55 64 18 14 -1.69 .03 0 -.329 9 .245 42642 108 25 40 15 133 39 56 21 242 80 55 131 66 78 .161 .72 0 .245 10 .444 42436 97 22 38 15 131 45 56 19 251 80 55 129 57 77 .327 .65 0 .444 11 -.159 42230 79 22 39 15 81 26 58 20 262 80 57 80 32 28 -.798 .44 0 -.159 12 .629 42024 776 194 39 15 1404 321 58 18 251 80 57 1390 801 1238 .855 .93 0 .629 13 -.084 41818 84 18 39 15 87 29 56 19 250 80 55 86 38 36 -.537 .46 0 -.084 14 .122 41612 80 21 39 15 87 29 55 19 260 80 54 86 34 37 -.358 .47 0 .122 15 1.063 41406 65 16 40 15 86 29 54 20 257 80 53 85 19 40 .356 .38 0 1.063 16 .192 41200 66 17 40 15 67 24 54 20 243 80 53 66 17 19 -1 .14 0 .192 17 -.049 40994 118 26 39 15 130 39 56 19 261 80 55 128 77 75 -.114 .69 0 -.049 18 .494 40788 202 61 39 15 310 89 55 19 258 80 54 306 171 241 .629 .91 0 .494 19 1.971 40582 487 159 39 15 2126 559 55 19 249 80 54 2104 486 1907 2.194 .94 0 1.971 20 -.401 40376 261 60 41 16 242 61 57 19 243 80 56 239 231 175 -.265 .87 0 -.401 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3468千字节. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|