GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508229 GSM508229的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 238715 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 238715 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K14696-7889 i-spy编号：1199 实验名称：238715 研究：ISPY 年龄：37.68 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：3 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：8 临床t分期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：3 er（0=阴性；1=阳性；）：0 pgr（0=阴性；1=阳性；）：0 her2（0=负；1=正；）：0 pam50的固有亚型：类Basal 新辅助化疗*（1=仅ac；2=ac+t；3=ac+t+赫赛汀；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：否 rcb等级：III=rcb指数大于3.28 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：274 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：1 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：476 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：8 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 238715 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 .081 44290 87 17 38 7 77 21 49 16 520 80 57 90 36 38 -.571 .5 0 .081 2 -.58 44084 62 14 38 7 54 15 51 17 439 80 60 63 10 6 -3 .15 0 -.58 三 .011 43878 182 30 37 9 169 50 49 15 384 80 57 198 131 132 -.041 .84 0 .011 4 .351 43672 141 37 37 7 153 64 49 14 385 80 57 180 92 117 .242 .82 0 .351 5 .261 43466 264 50 37 6 291 77 48 15 402 80 56 342 214 257 .333 .91 0 .261 6 .083 43260 91 25 38 7 81 38 49 15 365 80 57 95 40 42 -.48 .56 0 .083 7 .295 43054 86 17 38 23 82 22 49 19 436 80 57 96 35 44 -.3 .58 0 .295 8 -.181 42848 73 14 38 16 60 19 49 16 365 80 57 70 20 18 -1.431 .49 0 -.181 9 .456 42642 128 22 38 7 142 35 48 16 415 80 56 167 78 107 .302 .81 0 .456 10 .208 42436 215 41 38 7 222 55 46 15 389 80 54 261 164 189 .225 .9 0 .208 11 .083 42230 107 26 38 7 97 30 49 15 385 80 57 114 55 59 -.276 .31 0 .083 12 .65 42024 912 285 38 7 1446 539 49 14 358 80 57 1701 882 1384 .911 .95 0 .65 13 .316 41818 88 24 38 7 84 29 48 15 378 80 56 98 38 47 -.252 .59 0 .316 14 .352 41612 92 22 38 8 90 26 48 20 437 80 56 105 42 53 -.141 .55 0 .352 15 .721 41406 70 14 38 7 72 19 48 15 306 52 56 84 21 35 -.193 .4 0 .721 16 .982 41200 59 18 38 7 61 20 48 15 429 80 56 71 11 23 -.486 .28 0 .982 17 .061 40994 195 55 38 11 185 66 48 15 367 80 56 217 143 149 .036 .85 0 .061 18 .471 40788 271 75 38 11 341 107 49 16 320 80 57 401 221 307 .562 .92 0 .471 19 .845 40582 518 315 38 7 893 532 49 15 448 120 57 1050 474 852 1.049 .96 0 .845 20 .101 40376 291 65 38 6 290 69 46 14 397 80 54 341 239 257 .181 .9 0 .101 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3508 KB. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|