GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508224 查询GSM508224的数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 231387 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 231387 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K-14696-7503 i-spy编号：1148 实验名称：231387 研究：ISPY 年龄：50.81岁 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：2 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：4.5 临床t期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：2 er（0=阴性；1=阳性；）：0 pgr（0=阴性；1=阳性；）：0 her2（0=阴性；1=阳性；）：1 pam50的固有亚型：富含Her2 新辅助化疗*（1=仅ac；2=ac+t；3=ac+t+赫赛汀；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：是 rcb类：0=rcb索引0 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：1646 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：1646 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：7 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 231387 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 .313 44290 42 8 34 9 81 33 69 28 481 80 60 70 8 10 .322 .1 0 .313 2 .78 44084 40 6 34 9 80 31 68 27 431 80 59 69 6 11 .737 .08 0 .78 三 1.085 43878 61 12 34 9 123 48 67 28 390 80 58 106 26 56 .83 .45 0 1.085 4 -.584 43672 62 11 34 9 85 35 65 28 389 80 56 73 28 19 -.72 .11 0 -.584 5 -.602 43466 97 22 34 9 106 38 67 29 399 80 58 92 61 40 -.889 .33 0 -.602 6 -.15 43260 47 9 34 9 81 37 67 29 398 80 58 70 14 12 -.116 .15 0 -.15 7 .82 43054 41 7 34 9 83 40 68 27 378 80 59 72 7 13 .893 .04 0 .82 8 .133 42848 42 7 33 9 78 31 66 32 398 80 57 67 9 10 .152 .16 0 .133 9 1.038 42642 51 9 34 9 103 40 66 30 412 80 57 89 17 35 .912 .33 0 1.038 10 1.165 42436 47 11 34 8 99 41 67 26 336 80 58 86 13 30 1.107 .4 0 1.165 11 .757 42230 44 8 34 10 84 30 64 29 364 80 55 73 10 18 .848 .1 0 .757 12 -.121 42024 428 121 34 9 430 149 68 29 396 80 59 373 393 362 -.327 .9 0 -.121 13 .775 41818 47 8 34 10 92 39 67 30 382 80 58 80 13 23 .759 .21 0 .775 14 .618 41612 42 7 34 9 82 25 67 28 393 80 58 71 8 13 .7 .07 0 .618 15 -.225 41406 40 7 34 9 72 32 67 28 370 80 58 62 5 5 -.584 .03 0 -.225 16 1.272 41200 40 5 35 10 79 26 65 27 379 80 56 68 5 13 1.263 -1 0 1.272 17 .735 40994 52 8 34 8 99 41 67 29 330 52 58 86 18 30 .638 .29 0 .735 18 1.2 40788 79 15 34 9 161 63 66 28 436 80 57 140 43 99 .883 .7 0 1.2 19 -.26 40582 275 90 34 9 258 98 64 28 398 80 55 224 236 197 -.513 .83 0 -.26 20 -.96 40376 136 31 34 9 114 42 66 29 419 80 57 99 97 50 -1.279 .44 0 -.96 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3401 KB. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|