GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508219 GSM508219的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 225866 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 225866 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K14696-7441 i-spy编号：1112 实验名称：225866 研究：ISPY 年龄：46.06 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：3 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）：3.5 临床t期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：2 er（0=阴性；1=阳性；）：0 pgr（0=阴性；1=阳性；）：0 her2（0=阴性；1=阳性；）：1 pam50的固有亚型：富含Her2 新辅助化疗*（1=仅ac；2=ac+t；3=ac+t+赫赛汀；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：是 rcb类：0=rcb索引0 无复发生存时间-从化疗开始日期到最早的时间：局部或远处进展或死亡（时间单位为天）：1510 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：0 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：1510 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：7 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 225866 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 -.31 44290 47 9 36 9 82 35 73 31 443 80 62 70 11 8 -.46 .04 0 -.31 2 0 44084 45 9 35 10 69 29 70 32 344 80 60 59 0 0 0 .06 0 0 三 -.177 43878 67 17 35 10 103 41 71 29 322 80 61 88 34 30 -.245 .37 0 -.177 4 -.49 43672 129 379 35 10 141 234 69 32 352 80 59 121 97 69 -.599 .64 0 -.49 5 .268 43466 134 28 35 10 197 82 71 32 341 80 61 169 101 122 .126 .74 0 .268 6 -.242 43260 62 17 35 10 95 48 69 33 350 80 59 81 28 24 -.295 .22 0 -.242 7 -.603 43054 48 10 35 10 82 35 73 37 341 80 62 70 13 8 -.701 .34 0 -.603 8 -.436 42848 46 9 35 10 80 34 72 31 360 80 62 68 10 8 -.876 .05 0 -.436 9 .745 42642 62 9 36 9 121 47 72 34 313 52 62 104 27 46 .692 .42 0 .745 10 .25 42436 73 22 36 2766 118 56 69 2728 381 80 59 101 39 46 .183 .7 0 .25 11 .465 42230 51 11 37 2877 93 40 71 2838 352 80 61 80 14 20 .44 .19 0 .465 12 1.065 42024 820 184 36 10 1712 718 72 35 341 80 62 1475 783 1640 .85 .92 0 1.065 13 -.077 41818 60 20 35 10 93 42 66 32 337 80 56 80 26 25 -.059 .17 0 -.077 14 -.672 41612 79 188 35 11 101 62 70 31 321 80 60 87 46 29 -.704 .13 0 -.672 15 -1.028 41406 472 3046 35 10 288 1208 69 34 344 80 59 248 441 216 -1.211 .77 0 -1.028 16 -.597 41200 81 185 35 10 106 198 72 36 349 80 62 91 48 32 -.667 .4 0 -.597 17 .208 40994 84 84 36 10 128 65 67 34 337 80 57 110 50 58 .143 .4 0 .208 18 2.076 40788 129 39 36 9 470 188 66 31 324 80 56 405 94 398 1.908 .87 0 2.076 19 1.591 40582 518 163 35 11 1537 459 66 32 324 80 56 1325 485 1463 1.393 .94 0 1.591 20 .394 40376 243 70 35 10 345 123 65 31 344 80 56 297 210 276 .213 .85 0 .394 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3417 KB. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|