GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 迈阿密 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   样品GSM508190 GSM508190的查询数据集 状态 2012年1月13日公开 标题 218367 样品类型 核糖核酸   通道1 源名称 人类参考B 有机体 智人 特点 参考文献：Stratagene Human Universal reference包含1/10添加的MCF7和ME16C RNA 生物材料供应商 斯特拉赫纳 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 stratagene分离的总RNA 标签 Cy3（Cy3） 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124   频道2 源名称 218367 有机体 智人 特点 幻灯片名称：A44K10530-27304 i-spy编号：1057 实验名称：218367 研究：ISPY 年龄：44.24岁 组织学分级（1=i级（低）；2=二级（中级）；3=等级iii（高）；4=不确定）：2 组织学（1=坏死；2=导管癌；3=小叶；4=导管/小叶混合癌；5=其他6=无侵袭性肿瘤；）：2 临床肿瘤大小（化疗前），cm（-1=n/a）:99 临床t分期（化疗前）（1=<=2cm；2=>2-5cm；3=>5cm）：3 er（0=阴性；1=阳性；）：0 pgr（0=阴性；1=阳性；）：0 her2（0=负；1=正；）：0 pam50的固有亚型：类Basal 新辅助化疗*（1=仅ac；2=ac+t；3=ac+t+赫赛汀；4=ac+t+其他；）：A=阿霉素，C=环磷酰胺，t=紫杉烷：2 病理完全应答（pcr）：否 rcb等级：II=rcb指数大于1.36或等于3.28 无复发生存时间–从化疗开始到最早：局部或远处进展或死亡的时间（时间单位为天）：179 无复发生存指标（1=事件；局部或远期进展或死亡，0=最后随访时检查）：1 总生存期-从研究化疗开始日期到死亡或最后随访的时间；（时间单位为天）：314 生存状态（7=存活；8=死亡，9=丢失）：8 提取的分子 总核糖核酸 提取协议 Qiagen Rneasy试剂盒 标签 Cy5细胞 标签协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124     杂交协议 Hu等人，2005，《生物技术》，38:121-124 扫描协议 使用GenePix 4000B荧光扫描仪采集Cy3和Cy5的荧光阵列图像，并使用GenePix Pro 5.1分析软件提取图像强度数据并进行分析。 描述 218367 数据处理 两个通道的数据均为低标准化，然后取对数（2）比   提交日期 2010年2月10日 上次更新日期 2015年7月17日 联系人姓名 查尔斯·佩罗 电子邮件 cperou@med.unc.edu 组织名称 北卡罗来纳大学教堂山分校 部门 遗传学、病理学和检验医学教授；综合癌症中心 街道地址 12-044 Lineberger综合癌症中心CB#7295 西蒂 教堂山 省/自治区 数控 邮政编码 27599-7264 国家 美国   平台ID GPL1708型 系列（1） GSE22226标准 新辅助性乳腺癌化疗反应的异质性和无复发生存率：来自I-SPY 1试验的结果 数据表表头说明 ID_REF（标识_参考） 点参考ID VALUE（价值） 与UNF_VALUE相同，但删除了标记值 现场 阵列上的点编号 CH1_平均值 CH1_SD公司 通道1强度的标准偏差 CH1_BKD_媒体 通道1背景中值强度 CH1_BKD_SD公司 通道1背景中值强度的标准偏差 CH2_平均值 通道2平均强度 CH2_SD公司 通道2强度的标准偏差 CH2_BKD_媒体 通道2背景中值强度 CH2_BKD_SD公司 通道2背景中值强度的标准偏差 TOT_BPIX公司 背景像素数 TOT_SPIX公司 点像素数 CH2BN_媒体 通道2归一化背景中值强度 CH2IN_MEAN公司 通道2归一化平均强度 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） 通道1低标准化平均强度 CH2DL_平均值 通道2低标准化平均强度 日志_RAT2N_MEAN log2_通道2相对于通道1的归一化比率（全局归一化） 腐蚀，腐蚀 像素间相关系数 旗帜 现场标志。0：未标记；阴性：标记为不良点；正面：标记为好点 UNF_价值 log2_ CH2DL_MEAN与CH1DL_MEAN的比值（LOG_RAT2L_MEAN） 数据表 ID_REF（标识_参考） VALUE（价值） 现场 CH1_平均值 CH1_SD公司 CH1_BKD_媒体 CH1_BKD_SD公司 CH2_平均值 CH2_SD公司 CH2_BKD_媒体 CH2_BKD_SD公司 TOT_BPIX公司 TOT_SPIX公司 CH2BN_媒体 CH2IN_MEAN公司 CH1DL_MEAN（甲烷平均值） CH2DL_平均值 日志_RAT2N_MEAN 腐蚀，腐蚀 旗帜 UNF_价值 1 -.342 44290 47 11 35 9 91 57 67 47 289 52 54 73 19 15 .663 .42 0 -.342 2 .429 44084 44 15 35 6 93 52 62 46 410 80 50 75 14 19 1.474 .21 0 .429 三 .961 43878 73 25 34 7 165 105 62 43 418 80 50 133 45 88 1.089 .58 0 .961 4 1.217 43672 67 22 35 10 172 102 67 45 410 80 54 138 38 88 1.392 .56 0 1.217 5 .965 43466 117 59 36 5 237 154 64 41 421 80 51 191 84 165 .789 .81 0 .965 6 .486 43260 45 13 37 10 94 67 64 49 156 32 51 75 13 18 1.585 .37 0 .486 7 -2.962 43054 44 11 37 12 76 46 72 56 167 32 58 61 14 1 -1.221 .31 0 -2.962 8 .47 42848 48 14 35 22 109 72 70 73 439 80 56 87 19 26 1.254 .28 0 .47 9 1.669 42642 67 23 36 8 201 133 68 47 423 80 54 162 36 114 1.801 .65 0 1.669 10 .79 42436 93 25 35 17 183 99 61 46 459 80 49 147 63 110 .757 .65 0 .79 11 .167 42230 50 7 37 11 108 62 75 53 152 32 60 87 19 21 1.055 .2 0 .167 12 1.472 42024 412 119 35 6 1052 530 67 43 418 80 54 848 365 1014 1.075 .9 0 1.472 13 .172 41818 58 9 36 11 111 68 65 47 230 32 52 89 29 33 .75 .44 0 .172 14 -.263 41612 45 10 37 13 91 52 71 54 174 32 57 73 13 11 1 .33 0 -.263 15 .146 41406 43 6 35 4 86 44 61 46 438 80 49 69 13 14 1.322 .04 0 .146 16 4.503 41200 46 14 35 9 409 349 66 79 287 52 53 329 12 292 4.649 .72 0 4.503 17 .732 40994 84 19 35 4 174 90 69 42 404 80 55 140 55 92 .795 .61 0 .732 18 .941 40788 142 54 36 17 280 153 68 51 301 52 54 225 108 207 .69 .76 0 .941 19 .857 40582 530 203 35 11 905 562 61 43 462 80 49 729 480 869 .458 .9 0 .857 20 .553 40376 215 73 36 20 331 164 70 47 258 52 56 266 178 261 .23 .78 0 .553 总行数：44290 表格已截断，表格大小已满3432 KB. 未提供补充数据文件 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|无人机|GEO帮助|免责声明|无障碍|