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样品GSM488125 查询GSM488125的数据集
状态 2010年8月19日公开
职务 脑(迷走神经背侧运动核)_帕金森病_病例4
样品类型 核糖核酸
 
源名称 大脑(迷走神经背侧运动核)_帕金森病患者_#4
有机体 智人
特点 样品:#19
主题:PD案例#4
大脑:T-9
年龄:74岁
性别:男
区域:迷走神经背侧运动核
生物材料供应商 纽约智库
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 根据制造商的协议,使用Invitrogen的TRIzol试剂提取总RNA,并使用RNeasy微型柱(Qiagen)纯化总RNA。


标签 生物素
标签协议 生物素化cRNA是根据总RNA的标准Affymetrix协议(基因芯片表达分析技术手册,Affymetix)制备的。
 
杂交协议 片段化后,在Affymetrix Human Genome U133A 2.0表达阵列上,将10 ug cRNA在45℃下杂交16小时。
扫描协议 在Affymetrix的基因芯片扫描仪3000 7G上扫描Affymetix人类基因组U133A 2.0阵列,并进行质量控制审查。
描述 帕金森病患者迷走神经背侧运动核的基因表达数据。
数据处理 使用Affymetrix microarray Suite v5.0和GeneSpring v5.0.3(Silicon Genetics)软件分析HG-U133A 2.0微阵列。
 
提交日期 2009年12月20日
上次更新日期 2010年6月9日
联系人姓名 斯科特·斯莫尔
组织名称 哥伦比亚大学
街道地址 630 W第168街
西蒂 纽约
省/自治区 纽约州
邮政编码 10032
国家 美国
 
平台ID GPL571型
系列(1)
GSE19587 图像引导微阵列:识别帕金森病发病机制中的分子标记

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) MAS 5.0信号
ABS_呼叫
检测P值

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值) ABS_呼叫 检测P值
AFFX生物B-5_at 1143.74 0.000340305
AFFX-BioB-M_at公司 1892.79 5.16732e-05号
AFFX-BioB-3_at公司 987.834 9.4506e-05号
AFFX-生物C-5_at 3054.54 4.42873电子-05
AFFX-生物C-3_at 3302.69 5.16732e-05号
AFFX-BioDn-5_at公司 7979.72 4.42873电子05
AFFX-BioDn-3_at公司 13429.2 4.42873电子05
AFFX-CreX-5_at公司 20070.4 4.42873电子05
AFFX-CreX-3_at公司 20140.5 4.42873电子05
AFFX-DapX-5_at公司 51.4297 A类 0.287743
AFFX-DapX-M_at公司 23.1113 A类 0.824672
AFFX-DapX-3_at公司 9.30178 A类 0.891021
AFFX-LysX-5_at公司 19.7122 A类 0.631562
AFFX-LysX-M_at公司 27.1947 A类 0.659339
AFFX-LysX-3_at公司 110.23 0.0219019
AFFX-PheX-5_at公司 54.4808 A类 0.300606
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AFFX-ThrX-M_at公司 17.2376 A类 0.897835

总行数:22277

表格已截断,表格大小已满663 KB.




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GSM488125.CEL.gz公司 2.0兆字节 (英尺/平方英尺)(http) CEL公司
GSM488125.CHP.gz公司 120.6千比特 (英尺/平方英尺)(http) 热电联产
样本表中包含的已处理数据
作为补充文件提供的处理数据

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