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样品GSM440244 GSM440244的查询数据集
状态 2009年12月1日公开
标题 脐血19,生物复制品5
样品类型 核糖核酸
 
源名称 脐血网状细胞
有机体 智人
特点 组织:脐带血
细胞类型:网织红细胞
治疗方案 通过离心和过滤方法去除血浆、血小板和有核细胞,从血液样本中制备富含网织细胞的池。
增长协议 不适用
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 根据制造商的说明,对总RNA进行三唑提取。
标签 生物素
标签协议 根据标准Affymetrix协议,从6 ug总RNA中制备生物素化cRNA(表达分析技术手册,2001年,Affymotrix)。
 
杂交协议 片段化后,将10 ug cRNA在HG-U133Plus 2.0阵列上在45℃下杂交16小时。基因芯片在Affymetrix Fluidics Station 450进行清洗和染色。
扫描协议 使用Hewlett-Packard基因阵列扫描仪7G 3000扫描基因芯片。
描述 脐血网织红细胞的基因表达数据。
数据处理 使用微阵列套件5.0版(MAS 5.0)分析数据,使用Affymetrix默认分析设置和全局缩放作为归一化方法。每个阵列的修剪平均目标强度被任意设置为500。
 
提交日期 2009年8月13日
上次更新日期 2018年8月28日
联系人姓名 杰弗里·林恩·米勒
电子邮件 jm7f@nih.gov
电话 301-480-1908
传真 301-435-5148
组织名称 NIH/NIDDK医院
部门 分子医学分支
门诊化验室 分子生物学和遗传学科
街道地址 10中央驱动
西蒂 贝塞斯达
省/自治区 医学博士
邮政编码 20892
国家 美国
 
平台ID GPL570型
系列(1)
GSE17639 人网织红细胞转录组(HG-U133_Plus2.0)
关系
重新分析人 GSE119087标准

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) MAS5.0信号强度
ABS_呼叫 绝对分析中的调用,指示转录本是否存在(P)、不存在(A)或边缘(M)
检测P值 p值,指示检测调用的重要性级别

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值) ABS_呼叫 检测P值
1007_秒_秒 2064 A类 0.204022
1053_处 79 A类 0.781017
117_吨 263.1 A类 0.67917
121_吨 9034.1 P(P) 0.009985
1255_克_吨 72.8 A类 0.697453
1294_吨 491.9 A类 0.581931
1316_天 337.9 P(P) 0.006532
1320_吨 199.7 A类 0.660442
1405_i_at(_安) 120.2 A类 0.945289
1431_at(公元1431年) 258.5 A类 0.204022
1438_天 710.7 A类 0.397994
1487_安 1086.1 A类 0.438361
1494_频率 1482.1 A类 0.284747
1552256_阿特 243.2 A类 0.533936
1552257_阿特 1407.2 A类 0.219482
1552258_吨 1989.1 A类 0.246094
1552261_at 411.3 A类 0.432373
1552263_安 427.8 A类 0.5
1552264_a_阿特 2714 P(P) 0.001221
1552266_安 91.1 A类 0.533936

总行数:54675

表格已截断,表格大小已满1456 KB.




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