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样品GSM421886 GSM421886的查询数据集
状态 2009年7月13日公开
标题 SUM44PE系列
样品类型 核糖核酸
 
源名称 乳腺癌细胞系
有机体 智人
特点 细胞系:SUM44PE
细胞类型:乳腺癌
形态:非主轴
生长方案 细胞系在补充有10%FBS的RPMI 1640中于37℃生长至最佳细胞密度。RNA分离前24小时更换培养基。
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 细胞在分离前用PBS在37℃下清洗。使用来自Qiagen的Rneasy试剂盒分离总RNA。用PBS洗涤后直接在培养瓶中进行细胞裂解。总RNA在37℃下DNAseI处理1小时。使用安捷伦科技2100生物分析仪进行RNA质控。
标签 生物素
标签协议 根据标准Affymetrix协议,从10 ug总RNA中制备生物素化cRNA。
 
杂交协议 标准Affymetrix协议。
扫描协议 标准Affymetrix协议。
描述 SUM44PE的基因表达。
数据处理 使用GCOS 1.1规定的全球标准化因子对所有基因的强度值进行缩放。
 
提交日期 2009年6月24日
上次更新日期 2016年9月1日
联系人姓名 安托瓦内特·霍利斯泰尔
电子邮件 a.hollestelle@erasmusmc.nl
电话 +31-10-7044372
传真 +31-10-7044377
组织名称 斯大学医学中心
部门 医学肿瘤学
门诊化验室 乳腺癌的基因组学和蛋白质组学
街道地址 Molenwaterplein博士50
西蒂 鹿特丹
邮政编码 通用电气3015
国家 荷兰
 
平台ID GPL96型
系列(1)
GSE16795标准 39株人乳腺癌细胞Affymetrix HG-U133A基因表达谱
关系
重新分析人 GSE86363标准

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) GCOS1.1信号强度

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值)
1007_秒_秒 2650.4
1053_吨 142.4
117_吨 17
121_吨 424.7
1255_g_时间 13.3
1294_吨 63.1
1316_天 36.9
1320_吨 74.4
1405_i_at(_安) 5.6
1431_at(公元1431年) 16.1
1438_天 107.4
1487_安 330.9
1494年_月_日 90.5
1598_克_阿特 228.4
160020_吨 93.9
1729_天 101.5
1773_吨 18
177_吨 65.1
179_安 442.4
1861年 122.5

总行数:22283

表格已截断,表格大小已满348 KB.




补充文件 大小 下载 文件类型/资源
GSM421886.细胞.gz 2.2兆字节 (英尺/平方英尺)(http) CEL公司
样本表中包含的已处理数据

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