|
| 状态 |
2019年4月23日公开 |
| 标题 |
清管器5 DP |
| 样品类型 |
SRA公司 |
| |
|
| 源名称 |
膝关节软骨
|
| 有机体 |
苏斯克罗法 |
| 特点 |
组织：膝关节软骨
发育阶段：成人
细胞类型：ITGA4和BMPR1B阳性分选细胞
|
| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
Qiagen Micro试剂盒
使用Nugen SoLo mRNA-Seq试剂盒准备文库
|
| |
|
| 图书馆战略 |
RNA-Seq号 |
| 库源 |
转录组学的 |
| 库选择 |
cDNA |
| 仪器型号 |
Illumina HiSeq 2500公司 |
| |
|
| 数据处理 |
使用STAR将读数映射到猪基因组（Ensembl 84）
使用Partek E/M进行转录估算
使用方差分析进行差异表达
基因组构建：Sus scrofa乐团84
|
| |
|
| 提交日期 |
2018年3月14日 |
| 上次更新日期 |
2019年4月23日 |
| 联系人姓名 |
丹尼斯·埃夫申科 |
| 电子邮件 |
evseenko@usc.edu
|
| 电话 |
323-219-0234
|
| 组织名称 |
南加州大学
|
| 部门 |
骨科手术
|
| 门诊化验室 |
Evseenko实验室
|
| 街道地址 |
Biggy街1450号
|
| 西蒂 |
洛杉矶 |
| 省/自治区 |
加利福尼亚州 |
| 邮政编码 |
90033 |
| 国家 |
美国 |
| |
|
| 平台ID |
9176英镑 |
| 系列（1） |
|
| 关系 |
| 生物样品 |
SAMN08713005号 |
| SRA公司 |
SRX3791899型 |
