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样品GSM247298 GSM247298的查询数据集
状态 2008年9月30日公开
标题 第0天的心室组织,生物复制2,技术复制1
样品类型 核糖核酸
 
源名称 第0天心动过速起搏时的心室组织
有机体 家犬
特点 心动过速犬心室组织
治疗方案 根据约翰·霍普金斯大学动物护理和使用委员会批准的方案,通过RV快速起搏诱发HF。通过左侧开胸手术植入VVI起搏器(Medtronics),并在无菌条件下将起搏导线固定在RV心外膜上。术后1至2天开始240 ppm快速起搏。在不同的时间点终止快速起搏,即3天、1周和2周,用于HF进展的中间阶段。通常在快速起搏4周时通过血液动力学测量验证终末期HF。通过左侧开胸手术获取心脏并将其浸泡在冰镇盐水中,组织切片在液氮中快速冷冻并保存在-80℃。
生长方案 本实验中所有的狗都是雄性,年龄相匹配。
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 用Trizol试剂(GibcoBRL)和Qiagen RNeasy色谱柱(Qiangen)从犬心室组织中制备心肌RNA。
标签 生物素
标签协议 根据Affymetrix的规范,使用T7启动子寡核苷酸dT引物和ENZO IVT试剂盒对总RNA进行一轮扩增,用于cDNA合成(www.Affymetrix.com,GeneChip Expression Analysis,Technical Manual,2003)。
 
杂交协议 Affymetrix在其2004年《基因芯片表达分析技术手册》中描述的45°C下旋转16小时(60rpm)。
扫描协议 使用Affymetrix的基因芯片扫描仪3000和制造商在2004年《基因芯片表达分析技术手册》中描述的默认参数。
描述 第0天心动过速起搏时心室组织的基因表达数据
数据处理 使用GCOS 1.4,使用MAS 5.0算法和制造商规范进行图像分析。将图像全局缩放到目标强度150。
 
提交日期 2007年12月5日
上次更新日期 2011年8月14日
联系人姓名 钟高
组织名称 约翰霍普金斯大学
街道地址 罗斯844 720拉特兰大道
西蒂 巴尔的摩
省/自治区 医学博士
邮政编码 21205
国家 美国
 
平台ID GPL3979标准
系列(1)
GSE9794标准 心动过速致心力衰竭的研究进展

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) 信号
ABS_呼叫 指示转录本是否存在(P)、缺失(A)或边缘(M)
检测P值

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值) ABS_呼叫 检测P值
AFFX-BioB-5_at公司 319.351 P(P) 0.000509415
AFFX生物B-M_at 438.88 P(P) 4.42873电子05
AFFX-BioB-3_at公司 288.737 P(P) 7.00668e-05年
AFFX-生物C-5_at 735.038 P(P) 0.000126798
AFFX-生物C-3_at 673.887 P(P) 4.42873电子05
AFFX-BioDn-5_at公司 878.38 P(P) 4.42873电子05
AFFX-BioDn-3_at公司 3479.59 P(P) 0.000126798
AFFX-CreX-5_at公司 7079.27 P(P) 5.16732e-05号
AFFX-CreX-3_at公司 8467.02 P(P) 4.42873电子05
AFFX-DapX-5_at公司 12.0146 P(P) 0.0464673
AFFX-DapX-M_at公司 10.7966 A类 0.425962
AFFX-DapX-3_at公司 6.59958 A类 0.772364
AFFX-LysX-5_at公司 3.98018 A类 0.631562
AFFX-LysX-M_at公司 11.0309 A类 0.760937
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AFFX-ThrX-5_at公司 5.48845 A类 0.686277
AFFX-ThrX-M_at公司 7.67313 A类 0.327079

总行数:23913

表格已截断,表格大小已满722 KB.




补充文件 尺寸 下载 文件类型/资源
GSM247298.CEL.gz标准 1.9兆字节 (英尺/平方英尺)(http) CEL公司
GSM247298.CHP.gz标准 270万 (英尺/平方英尺)(http) 热电联产
样本表中包含的已处理数据

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