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状态 |
2008年9月30日公开 |
标题 |
第0天的心室组织,生物复制1,技术复制2 |
样品类型 |
核糖核酸 |
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源名称 |
第0天心动过速起搏时的心室组织
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有机体 |
家犬 |
特点 |
心动过速犬心室组织
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治疗方案 |
根据约翰·霍普金斯大学动物护理和使用委员会批准的方案,通过RV快速起搏诱发HF。通过左侧开胸手术植入VVI起搏器(Medtronics),并在无菌条件下将起搏导线固定在RV心外膜上。术后1至2天开始240 ppm快速起搏。在不同的时间点终止快速起搏,即3天、1周和2周,用于HF进展的中间阶段。通常在快速起搏4周时通过血液动力学测量验证终末期HF。通过左侧开胸手术获取心脏并将其浸泡在冰镇盐水中,组织切片在液氮中快速冷冻并保存在-80℃。
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生长方案 |
本实验中所有的狗都是雄性,年龄相匹配。
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提取的分子 |
总核糖核酸 |
提取协议 |
用Trizol试剂(GibcoBRL)和Qiagen RNeasy色谱柱(Qiangen)从犬心室组织中制备心肌RNA。
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标签 |
生物素
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标签协议 |
根据Affymetrix的规范,使用T7启动子寡核苷酸dT引物和ENZO IVT试剂盒对总RNA进行一轮扩增,用于cDNA合成(www.Affymetrix.com,GeneChip Expression Analysis,Technical Manual,2003)。
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杂交协议 |
Affymetrix在其2004年《基因芯片表达分析技术手册》中描述的45°C下旋转16小时(60rpm)。
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扫描协议 |
使用Affymetrix的基因芯片扫描仪3000和制造商在2004年《基因芯片表达分析技术手册》中描述的默认参数。
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描述 |
第0天心动过速起搏时心室组织的基因表达数据
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数据处理 |
使用GCOS 1.4,使用MAS 5.0算法和制造商规范进行图像分析。将图像全局缩放到目标强度150。
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提交日期 |
2007年12月5日 |
上次更新日期 |
2011年8月14日 |
联系人姓名 |
钟高 |
组织名称 |
约翰霍普金斯大学
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街道地址 |
罗斯844 720拉特兰大道
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西蒂 |
巴尔的摩 |
省/自治区 |
医学博士 |
邮政编码 |
21205 |
国家 |
美国 |
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平台ID |
GPL3979标准 |
系列(1) |
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