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样品GSM1502417 GSM1502417的查询数据集
状态 2014年9月23日公开
标题 大鼠海马,低维生素D,18个月大,无标记,受试者6
样品类型 核糖核酸
 
源名称 低维生素D_18个月大_无标记
有机体 褐家鼠
特点 应变:Fisher 344
性别:男
饮食组:低维生素D
组织:海马
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 如前所述(Blalock等人,2003年;Kadish等人,2009年;Rowe等人,2007年),使用TRIzol(Invitrogen)提取每个海马组织块中的RNA,然后进行乙醇沉淀,并在无RNase水(标准Affymetrix)中重建
标签 生物素
标签协议 对于每个样品,根据制造商的说明,从5μg总RNA中生成20μg生物素标记的cRNA(标准Affymetrix)。
 
杂交协议 标准Affymetrix-20μg生物素标记的cRNA应用于Affymotrix大鼠基因1.0 ST阵列进行杂交(每只动物一个芯片)。
扫描协议 标准Affymetrix协议
说明 洛-8u_080510_(RaGene-1_0-st-v1)
数据处理 在Partek(v.6.6)中进行了质量控制和信号强度计算,并在RMAexpress中进行了额外的残差图像分析。gcRMA探针水平汇总算法用于使用Partek的默认设置估计基因(而非外显子)水平的信号强度。
 
提交日期 2014年9月11日
上次更新日期 2014年9月23日
联系人姓名 埃里克·布莱克
电子邮件 eric.blalock@uky.edu
电话 859-323-8033
组织名称 肯塔基大学
部门 分子和生物医学药理学
门诊化验室 布拉洛克
街道地址 玫瑰街800号。
西蒂 列克星敦
省/自治区 肯塔基州
邮政编码 40475
国家 美国
 
平台ID GPL6247标准
系列(1)
GSE61326标准 维生素D预防衰老大鼠认知功能下降并增强海马突触功能

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) RMA计算信号强度

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值)
10700001 12.2429
10700002 5.58791
10700003 10.1258
10700004 5.63344
10700005 9.0481
10700006 6.40386
10700007 5.13173
10700008 7.86487
10700009 7.18941
10700010 4.75802
10700011 4.77723
10700012 4.72909
10700013 11.4453
10700014 10.1887
10700015 7.63183
10700016 6.35513
10700017 5.26256
10700018 8.07513
10700019 5.59015
10700020 12.4059

总行数:29214

表格已截断,表格大小已满481 KB.




补充文件 大小 下载 文件类型/资源
GSM1502417_Lo-8u_080510_转基因-1_0-st-v1_。CEL.gz公司 4.5百万 (英尺/平方英尺)(http) CEL公司
样本表中包含的已处理数据

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