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| 状态 |
2014年9月23日公开 |
| 标题 |
大鼠海马体，低维生素D，18个月大，有标记，受试者3 |
| 样品类型 |
核糖核酸 |
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| 源名称 |
低维生素D_18个月大_标记
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| 有机体 |
褐家鼠 |
| 特点 |
应变：Fisher 344
性别：男
饮食组：低维生素D
组织：海马
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
如前所述（Blalock等人，2003年；Kadish等人，2009年；Rowe等人，2007年），使用TRIzol（Invitrogen）提取每个海马组织块中的RNA，然后进行乙醇沉淀，并在无RNase水（标准Affymetrix）中重建
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| 标签 |
生物素
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| 标签协议 |
对于每个样品，根据制造商的说明，从5μg总RNA中生成20μg生物素标记的cRNA（标准Affymetrix）。
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| 杂交协议 |
标准Affymetrix-20μg生物素标记的cRNA应用于Affymotrix大鼠基因1.0 ST阵列进行杂交（每只动物一个芯片）。
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| 扫描协议 |
标准Affymetrix协议
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| 说明 |
Lo-5m_080510_（RaGene-1_0-st-v1）
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| 数据处理 |
在Partek（v.6.6）中进行了质量控制和信号强度计算，并在RMAexpress中进行了额外的残差图像分析。gcRMA探针水平汇总算法用于使用Partek的默认设置估计基因（而非外显子）水平的信号强度。
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| 提交日期 |
2014年9月11日 |
| 上次更新日期 |
2014年9月23日 |
| 联系人姓名 |
埃里克·布莱克 |
| 电子邮件 |
eric.blalock@uky.edu
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| 电话 |
859-323-8033
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| 组织名称 |
肯塔基大学
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| 部门 |
分子和生物医学药理学
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| 门诊化验室 |
布拉洛克
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| 街道地址 |
玫瑰街800号。
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| 西蒂 |
列克星敦 |
| 省/自治区 |
肯塔基州 |
| 邮政编码 |
40475 |
| 国家 |
美国 |
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| 平台ID |
GPL6247标准 |
| 系列（1） |
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