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| 状态 |
2015年1月15日公开 |
| 标题 |
6_悬架Scrofa |
| 样品类型 |
SRA公司 |
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| 源名称 |
皮下脂肪组织
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| 有机体 |
苏斯克罗法 |
| 特点 |
组织：皮下脂肪
biologial_state：低
性别：f
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| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
Rneasy脂质迷你套件
TruSeq RNA样品制备（Illumina）
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| 图书馆战略 |
RNA-Seq号 |
| 库源 |
转录组学的 |
| 库选择 |
cDNA |
| 仪器型号 |
Illumina HiSeq 2500公司 |
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| 数据处理 |
对齐方式：STAR
过滤：SAM标志1792（非主要校准，读取未通过平台/供应商质量检查，读取为PCR或光学副本）
读取计数：HTSeq
库大小因子估计：DESeq
读数标准化：voom（limma），样本性别校正
表达式小于5的读取筛选
基因组构建：SScrofa10.2.72
补充文件_format_and_content：以逗号分隔的文件，包含原始计数和规范化计数
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| 提交日期 |
2014年9月9日 |
| 上次更新日期 |
2019年5月15日 |
| 联系人姓名 |
哈贾·N·卡达尔米丁 |
| 电子邮件 |
hajak@dtu.dk
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| 组织名称 |
丹麦技术大学
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| 部门 |
应用数学与计算机科学系
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| 门诊化验室 |
定量基因组学、生物信息学和计算生物学（QBC）小组
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| 街道地址 |
Richard Petersens Plads，324号楼
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| 西蒂 |
康根斯·林比 |
| 邮政编码 |
2800 |
| 国家 |
丹麦 |
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| 平台ID |
GPL19176型 |
| 系列（1） |
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| 关系 |
| SRA公司 |
SRX698204型 |
| 生物样品 |
SAMN03031517号 |
