|
| 状态 |
2014年3月16日公开 |
| 标题 |
70岁男性 |
| 样品类型 |
核糖核酸 |
| |
|
| 源名称 |
70岁男性
|
| 有机体 |
智人 |
| 特点 |
年龄：70岁
性别：男
|
| 生长方案 |
尸检脑组织样本在年龄上属于神经病理学正常，来源于非痴呆患者。组织是根据机构指南采购的。从额叶极（Brodmann区域9、10）解剖人类皮层灰质样品，并在液氮中快速冷冻并储存于-85℃。组织pH值>6.5的人脑样本用于排除长期的终末缺氧
|
| 提取的分子 |
总核糖核酸 |
| 提取协议 |
根据制造商的说明，对总RNA进行三唑提取。
|
| 标签 |
生物素
|
| 标签协议 |
将解剖的皮质灰质在冷冻状态下切成小块，立即在Trizol（Gibco）中均匀化~70 mg，并分离RNA。使用电泳完整且A260/A280比率≥1.9的RNA进行cDNA合成。根据Affymetrix协议（Affymetix基因芯片表达分析技术手册）进行cDNA合成、cRNA合成和片段化以及杂交鸡尾酒的制备
|
| |
|
| 杂交协议 |
在基因芯片杂交中，在45ºC条件下，在640（60vrpm）以上进行16小时的杂交。然后在GeneChip软件按照适当的射流协议操作的GeneChip-Fuidics Station 400中对探针阵列进行清洗和染色。
|
| 扫描协议 |
Affymetrix微阵列套件5.0用于生成Affymetrix存在/不存在调用。探针级线性模型（PLM）用于在探针级规范化阵列，并使用仅PM模型计算基于模型的表达式值。dChip软件www.dChip.org[3]用于集群可视化。
|
| 描述 |
70岁男性
|
| 数据处理 |
使用微阵列套件5.0版（MAS 5.0）分析数据，使用Affymetrix默认分析设置和全局缩放作为归一化方法。每个阵列的修剪平均目标强度被任意设置为100。
|
| |
|
| 提交日期 |
2014年1月8日 |
| 上次更新日期 |
2019年6月26日 |
| 联系人姓名 |
Tun-Hsiang Yang先生 |
| 电子邮件 |
yangth@gmail.com
|
| 组织名称 |
HMS系统
|
| 部门 |
遗传学
|
| 门诊化验室 |
扬克纳
|
| 街道地址 |
路易斯·巴斯德大道77号
|
| 西蒂 |
波士顿 |
| 省/自治区 |
妈妈 |
| 邮政编码 |
02115 |
| 国家 |
美国 |
| |
|
| 平台ID |
GPL570型 |
| 系列（1） |
|
| 关系 |
| 重新分析人 |
GSE133349标准 |
