|
状态 |
2014年1月1日公开 |
标题 |
未经照射的WT角质形成细胞 |
样品类型 |
核糖核酸 |
|
|
源名称 |
Kc未辐照
|
有机体 |
小家鼠 |
特点 |
菌株:C57BL/6 细胞类型:角质形成细胞 基因型/变异:野生型 应力:控制
|
治疗方案 |
紫外线(75 mJ/cm2)照射角质形成细胞培养。照射后在37℃下培养角质形成细胞4小时。
|
生长方案 |
从新生动物中分离出小鼠原代角质形成细胞,并在37℃下培养,直至辐照。
|
提取的分子 |
总核糖核酸 |
提取协议 |
根据制造商的说明,使用Trizol(Invitrogen)提取总RNA,然后使用RNeasy MinElute Cleanup Kit(Qiagen)纯化总RNA。
|
标签 |
生物素
|
标签协议 |
基因芯片3’IVT快速标记试剂盒用于根据标准Affymetrix协议从0.2 ug总RNA制备生物素化cRNA(表达分析技术手册,2001年,Affymetix)。
|
|
|
杂交协议 |
片段化后,将10ug的cRNA在Affymetrix小鼠基因组430 2.0阵列上在45℃下杂交16小时。在Affymetrix Fluidics Station 400中,用链霉亲和素-藻红蛋白结合物对阵列进行清洗和染色。
|
扫描协议 |
使用Hewlett-Packard基因阵列扫描仪G2500A扫描基因芯片。
|
描述 |
未经辐射的WT角质形成细胞的基因表达数据 Kc-wt-0h-1385C克
|
数据处理 |
使用微阵列套件5.0版(MAS 5.0)分析数据,使用Affymetrix默认分析设置和全局缩放作为归一化方法。每个阵列的修剪平均目标强度被任意设置为100。
|
|
|
提交日期 |
2013年9月26日 |
上次更新日期 |
2014年1月1日 |
联系人姓名 |
金茂公园 |
电子邮件 |
jmpark@cbrc2.mgh.harvard.edu
|
电话 |
617-643-2328
|
组织名称 |
马萨诸塞州总医院
|
部门 |
皮肤生物学研究中心
|
街道地址 |
第十三街149号
|
西蒂 |
查尔斯顿 |
省/自治区 |
妈妈 |
邮政编码 |
02129 |
国家 |
美国 |
|
|
平台ID |
GPL1261型 |
系列(1) |
|