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样品GSM1240488 GSM1240488的查询数据集
状态 2014年1月1日公开
标题 未经照射的WT角质形成细胞
样品类型 核糖核酸
 
源名称 Kc未辐照
有机体 小家鼠
特点 菌株:C57BL/6
细胞类型:角质形成细胞
基因型/变异:野生型
应力:控制
治疗方案 紫外线(75 mJ/cm2)照射角质形成细胞培养。照射后在37℃下培养角质形成细胞4小时。
生长方案 从新生动物中分离出小鼠原代角质形成细胞,并在37℃下培养,直至辐照。
提取的分子 总核糖核酸
提取协议 根据制造商的说明,使用Trizol(Invitrogen)提取总RNA,然后使用RNeasy MinElute Cleanup Kit(Qiagen)纯化总RNA。
标签 生物素
标签协议 基因芯片3’IVT快速标记试剂盒用于根据标准Affymetrix协议从0.2 ug总RNA制备生物素化cRNA(表达分析技术手册,2001年,Affymetix)。
 
杂交协议 片段化后,将10ug的cRNA在Affymetrix小鼠基因组430 2.0阵列上在45℃下杂交16小时。在Affymetrix Fluidics Station 400中,用链霉亲和素-藻红蛋白结合物对阵列进行清洗和染色。
扫描协议 使用Hewlett-Packard基因阵列扫描仪G2500A扫描基因芯片。
描述 未经辐射的WT角质形成细胞的基因表达数据
Kc-wt-0h-1385C克
数据处理 使用微阵列套件5.0版(MAS 5.0)分析数据,使用Affymetrix默认分析设置和全局缩放作为归一化方法。每个阵列的修剪平均目标强度被任意设置为100。
 
提交日期 2013年9月26日
上次更新日期 2014年1月1日
联系人姓名 金茂公园
电子邮件 jmpark@cbrc2.mgh.harvard.edu
电话 617-643-2328
组织名称 马萨诸塞州总医院
部门 皮肤生物学研究中心
街道地址 第十三街149号
西蒂 查尔斯顿
省/自治区 妈妈
邮政编码 02129
国家 美国
 
平台ID GPL1261型
系列(1)
GSE51206标准 角质形成细胞中p38a依赖性基因的表达

数据表标题描述
ID_REF(标识_参考)
VALUE(价值) MAS5.0信号
ABS_呼叫 指示转录本是否存在(P)、缺失(A)或边缘(M)
检测P值

数据表
ID_REF(标识_参考) VALUE(价值) ABS_呼叫 检测P值
AFFX-BioB-5_at公司 122.185 P(P) 0.0012475
AFFX-BioB-M_at公司 203.139 P(P) 9.4506e-05号
AFFX-BioB-3_at公司 112.899 P(P) 5.16732e-05号
AFFX-生物C-5_at 367.03 P(P) 8.14279e-05号
AFFX-生物C-3_at 480.275 P(P) 4.42873电子05
AFFX-BioDn-5_at公司 800.661 P(P) 7.00668e-05年
AFFX生物脱氧核糖核酸-3_at 1318.23 P(P) 0.000126798
AFFX-CreX-5_at公司 5027.2 P(P) 5.16732e-05号
AFFX-CreX-3_at公司 6658.08 P(P) 4.42873电子05
AFFX-DapX-5_at公司 0.902704 A类 0.824672
AFFX-DapX-M_at公司 8.08995 A类 0.455413
AFFX-DapX-3_at公司 17.3985 A类 0.287743
AFFX-LysX-5_at公司 1.47075 A类 0.777979
AFFX-LysX-M_at公司 8.54291 A类 0.712257
竣工楼面竣工标高-LysX-3_at 11.5305 P(P) 0.0182806
AFFX-PheX-5_at公司 1.96048 A类 0.783476
AFFX-PheX-M_at公司 2.92988 A类 0.659339
竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面竣工楼面 21.4879 A类 0.354453
AFFX-ThrX-5_at公司 19.1008 A类 0.147939
AFFX-ThrX-M_at公司 7.10357 A类 0.39692

总行数:45101

表格已截断,表格大小已满1376 KB




补充文件 大小 下载 文件类型/资源
GSM1240488_KC-WT-0H-1385C。CHP.gz公司 244.8千桶 (英尺/平方英尺)(http) 热电联产
GSM1240488_Kc-wt-0h-1385C。CEL.gz公司 3.8百万 (英尺/平方英尺)(http) CEL公司
样本表中包含的已处理数据
作为补充文件提供的处理数据

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