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GSE65812系列 GSE65812的查询数据集
状态 2015年4月24日公开
标题 SMCs依赖KLF4的表型调制在调节斑块发病机制中起关键作用
有机体 肌肉
实验类型 高通量测序的基因组结合/占有率分析
总结 心血管疾病是发达国家的主要死亡原因,有令人信服的证据表明,这些死亡大多是继发于不稳定动脉粥样硬化斑块破裂。然而,控制斑块稳定性的机制尚不清楚,尽管人们普遍认为,相对于巨噬细胞标记物,ACTA2等平滑肌细胞(SMC)标记物阳性细胞比例降低的斑块更有可能破裂。在此,我们使用Myh11-CreERT2 ROSA floxed STOP eYFP Apoe-/-小鼠追踪SMC谱系,并表明基于ACTA2等SMC标记物免疫染色的传统SMC检测方法无法检测到82%的晚期动脉粥样硬化病变中的SMC衍生细胞。此外,我们发现这些晚期病变中的SMC衍生细胞表现出多种表型,包括巨噬细胞、间充质干细胞(MSC)和肌成纤维细胞(MF)的多种标记物的激活。重要的是,基于电子显微镜YFP免疫标记,我们表明SMC衍生的巨噬细胞样细胞是吞噬细胞。此外,我们实验室开发的单细胞表观遗传学分析结果表明,人类皮损内近20%的巨噬细胞样细胞是SMC非髓源性细胞。这些表型转变似乎在病变发病机制中至关重要,因为我们表明,多能性因子KLüppel-like factor 4(KLF4)的SMC特异性条件敲除(KO)导致病变大小显著减小,斑块稳定性的多项指标增加,减少SMC衍生MSC和巨噬细胞样细胞的数量。最后,我们发现培养SMC的胆固醇负荷与巨噬细胞和MSC的多个标记物的激活、促炎细胞因子的分泌以及吞噬作用的增加有关,所有这些都是Klf4依赖性的。综上所述,结果表明,SMC在动脉粥样硬化斑块中的作用被大大低估,SMC中Klf4的缺失导致SMC表型和功能的重大变化,在病变发病机制中起着重要作用。
 
总体设计 动脉粥样硬化环境中KLF4转录因子的检测
 
贡献者 香克曼LS,戈麦斯D,三文鱼M,Cherepanova办公自动化,阿伦卡尔GF,Swiatlowska P公司,哈斯金斯RM,纽曼AA,格林ES,斯特劳布A,伊萨克森B,伦道夫GJ,欧文斯GK
引文 25985364
提交日期 2015年2月10日
上次更新日期 2019年5月15日
联系人姓名 加里·欧文斯
组织名称 弗吉尼亚大学
街道地址 415 Lane Road MR5 Building 1322室
西蒂 夏洛茨维尔
省/自治区 弗吉尼亚州
邮政编码 22908
国家 美国
 
平台(1)
GPL13112型 Illumina HiSeq 2000(小家鼠)
样品(2)
GSM1606674标准 KLF4_ChIPSeq_WT
GSM1606675型 KLF4_ChIPSeq_KO
关系
生物项目 邮编:175126
SRA公司 SRP053434号文件

下载系列 格式
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补充文件 大小 下载 文件类型/资源
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SRA中有原始数据
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