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GSE54002系列 GSE54002的查询数据集
状态 2014年9月16日公开
标题 LCM捕获乳腺癌细胞的基因表达谱分析
有机体 智人
实验类型 按数组分析表达式
总结 本研究的目的是获得乳腺癌的综合基因表达谱。采用激光捕获显微切割(LCM)技术从433个临床组织样本中特异性分离出乳腺细胞。从LCM捕获的样品中提取总RNA。我们使用Affymetrix基因芯片研究了417例乳腺癌患者和16例非肿瘤组织作为正常对照的基因表达谱。
 
总体设计 采用LCM技术从乳腺癌患者的临床组织中捕获乳腺细胞。使用GeneChip Human Genome U133 Plus 2.0(Affymetrix,Santa Clara,CA)获得417个肿瘤和16个非肿瘤样本的基因表达谱。利用R统计软件和BioConductor软件包,使用稳健的多阵列平均(RMA)方法将微阵列数据集归一化并转换为log2值。
 
贡献者 米奇·Y,松浦M,野田佳彦
引文 25214461
提交日期 2014年1月11日
上次更新日期 2019年3月25日
联系人姓名 团泽坦
电子邮件 csittz@nus.edu.sg
组织名称 新加坡国立大学
部门 新加坡癌症科学研究所
街道地址 新加坡,#11-01,Medical Drive 14号
西蒂 新加坡
邮政编码 117599
国家 新加坡
 
平台(1)
GPL570型 [HG-U133_Plus_2]Affymetrix人类基因组U133 Plus 2.0阵列
样品(433)
GSM1305324标准 肿瘤1M002TT1
GSM1305325克 肿瘤1M003TT1
GSM1305326标准 肿瘤1M004TT1
关系
生物项目 项目编号:234318

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