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状态 |
2024年5月18日公开 |
标题 |
AP-1调节TNBCⅡ的异质细胞休眠 |
有机体 |
智人 |
实验类型 |
通过高通量测序进行表达谱分析
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总结 |
慢循环细胞是一种异质性的肿瘤细胞亚群。由于其休眠性质,它们预先存在于肿瘤组织中,并通过针对有丝分裂的化学疗法来逃避杀灭。我们利用PKH26保留法标记和分离SCC,并通过RNA-seq来了解SCC的基因表达特征。在这里,我们报道了AP-1亚单位的上调通过上调CDKN1A和GADD45家族的表达作为转录因子来调节三阴性乳腺癌(TNBC)休眠。
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总体设计 |
为了研究慢循环细胞(SCCs)的基因表达特征,我们首先用PKH26标记MDA-MB-231细胞,并在完全DMEM中追逐12天。SCC在多次有丝分裂后保留更多的PKH26,这是因为它们具有慢周期性。然后我们通过FACS将PE荧光强度最高的细胞分类为SCC。我们还将荧光强度适中的细胞作为快速循环细胞(RCCs)/增殖细胞的对照。每组收集三个生物复制品。我们使用从6个样本的RNA-seq获得的数据进行了基因表达谱分析(两组,每组三个生物重复)。SCC(休眠)和RCC(增殖)RNA-seq数据的比较基因表达谱分析。
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贡献者 |
东Y,唐总经理 |
缺少引文 |
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提交日期 |
2024年5月17日 |
上次更新日期 |
2024年5月18日 |
联系人姓名 |
杨东 |
电子邮件 |
1810441@tongji.edu.cn
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电话 |
19542707574
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组织名称 |
同济大学
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街道地址 |
上海
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西蒂 |
上海 |
省/自治区 |
上海 |
邮政编码 |
200120 |
国家 |
中国 |
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平台(1) |
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样品(6)
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关系 |
生物项目 |
项目编号112806 |