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GSE267759系列 GSE267759的查询数据集
状态 2024年5月18日公开
标题 AP-1调节TNBCⅡ的异质细胞休眠
有机体 智人
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 慢循环细胞是一种异质性的肿瘤细胞亚群。由于其休眠性质,它们预先存在于肿瘤组织中,并通过针对有丝分裂的化学疗法来逃避杀灭。我们利用PKH26保留法标记和分离SCC,并通过RNA-seq来了解SCC的基因表达特征。在这里,我们报道了AP-1亚单位的上调通过上调CDKN1A和GADD45家族的表达作为转录因子来调节三阴性乳腺癌(TNBC)休眠。
 
总体设计 为了研究慢循环细胞(SCCs)的基因表达特征,我们首先用PKH26标记MDA-MB-231细胞,并在完全DMEM中追逐12天。SCC在多次有丝分裂后保留更多的PKH26,这是因为它们具有慢周期性。然后我们通过FACS将PE荧光强度最高的细胞分类为SCC。我们还将荧光强度适中的细胞作为快速循环细胞(RCCs)/增殖细胞的对照。每组收集三个生物复制品。我们使用从6个样本的RNA-seq获得的数据进行了基因表达谱分析(两组,每组三个生物重复)。SCC(休眠)和RCC(增殖)RNA-seq数据的比较基因表达谱分析。
 
贡献者 东Y,唐总经理
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提交日期 2024年5月17日
上次更新日期 2024年5月18日
联系人姓名 杨东
电子邮件 1810441@tongji.edu.cn
电话 19542707574
组织名称 同济大学
街道地址 上海
西蒂 上海
省/自治区 上海
邮政编码 200120
国家 中国
 
平台(1)
GPL11154号机组 Illumina HiSeq 2000(智人)
样品(6)
GSM8275232 MDA-MB-231细胞、SCC、rep1
通用斯迈8275233 MDA-MB-231细胞、SCC、rep2
GSM8275234 MDA-MB-231细胞、SCC、rep3
关系
生物项目 项目编号112806

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