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| 状态 |
2024年5月18日公开 |
| 标题 |
系统性硬化症中淋巴ERG和FLI1缺乏与皮肤血液和淋巴血管稀少有关 |
| 有机体 |
智人 |
| 实验类型 |
按数组进行表达式分析
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| 总结 |
ERG和FLI1是血管生成的重要调节因子，但它们在淋巴管系统中的作用尚不清楚。本研究的目的是确定ERG和FLI1在产后淋巴管生成中的作用及其与SSc淋巴系统缺陷的关系。IF用于检测SSc和健康对照（HC）皮肤活检中的ERG和FLI1。采用人淋巴管内皮细胞（LECs）进行细胞培养实验。分别使用微阵列和ATAC-seq对ERG或FLI1沉默的LEC进行转录和染色质分析。用Matrigel法检测ERG和FLI1缺陷对体外小管生成的影响。生成Erg和Fli1内皮特异性敲除物（ErgCKO和Fli1CKO）和淋巴特异性敲除了物（ProxErgCK0和ProxFli1CXO）以检查血管再生。SSc皮肤活检中血液和淋巴管中ERG和FLI1蛋白水平降低。ERG和FLI1被证明可以调节与淋巴管规范相关的基因，包括VEGFR3/FLT4、LYVE-1和PROX1，这种影响至少部分是由于染色质重塑。ERG/FLT4通路调节LECs体外小管生成。Erg和Fli1的缺乏使伤口愈合过程中的血液和淋巴管功能受损。ERG和FLI1是血液和淋巴管再生的重要调节因子。SSc内皮细胞ERG和FLI1缺乏可能导致SSc患者的血液和淋巴血管稀少。
微阵列分析在波士顿大学微阵列核心设施进行。使用Bioconductor软件套件（2.12版）中包含的affy包（1.36.1版）中的鲁棒多阵列平均（RMA）和BrainArray（16.0.0版）的Entrez基因特异性探针集映射，将Affymetrix CEL文件标准化以产生基因水平表达值。RLE和NUSE质量指标使用affy PLM Bioconductor软件包（版本1.34.0）进行计算。所有微阵列分析均使用R环境进行统计计算（版本2.15.1）。
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| 总体设计 |
将10 nM的干扰siRNA（siSCR）或抗ERG（siERG）、FLI1（siFLI1）或ERG和FLI1两者（siERG-siFLI2）的siRNA转染人淋巴内皮细胞（LECs）24小时。转染后，用TRI试剂（MRC公司，俄亥俄州辛辛那提）提取总RNA。将每个siRNA治疗组的3个样本与人类基因2.0 ST阵列进行比较。
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| 贡献者 |
特洛伊诺斯卡M,Takashi Y公司 |
| 引文缺失 |
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| 提交日期 |
2024年5月13日 |
| 上次更新日期 |
2024年5月18日 |
| 联系人姓名 |
玛丽亚·特罗亚诺夫斯卡 |
| 电子邮件 |
trojanme@bu.edu
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| 电话 |
6173587697
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| 组织名称 |
波士顿大学
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| 部门 |
关节炎和自身免疫疾病研究中心
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| 门诊化验室 |
特洛伊诺斯卡实验室
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| 街道地址 |
牛顿街东75号。
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| 西蒂 |
波士顿 |
| 省/自治区 |
妈妈 |
| 邮政编码 |
02118 |
| 国家 |
美国 |
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| 平台（1） |
| GPL17930型 |
[HuGene-2_0-st]Affymetrix人类基因2.0 st阵列[HuGene20stv1_Hs_ENTREZG_17.0.0] |
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| 样品（12）
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| 关系 |
| 生物项目 |
项目编号111113 |
