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GSE266252系列 GSE266252的查询数据集
状态 2024年5月17日公开
标题 PRMT2缺失对HL-60急性髓系白血病细胞株基因表达的影响
有机体 智人
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 精氨酸甲基化由蛋白精氨酸甲酯转移酶(PRMT)催化,并参与各种细胞过程,包括癌症的发展。尽管PRMT2在急性髓细胞白血病(AML)中的作用尚不清楚,但在几种癌症类型中表达增加。在这里,我们研究了PRMT2在AML患者队列、PRMT2敲除AML细胞系以及PRMT2敲除小鼠模型中的作用。在患者中,低PRMT2表达者富含炎症信号,包括NF-κB途径,并显示出较差的生存率。与PRMT2在控制炎症信号传导中的作用一致,来自PRMT2-KO小鼠的骨髓衍生巨噬细胞在LPS治疗后表现出增加的促炎细胞因子信号传导。在PRMT2缺失的AML细胞系中,异常的炎症信号与IL6的过度产生有关,IL6的产生是由于NF-κB信号通路的放松调节所致,因此导致STAT3的过度激活。总之,这些发现确定了PRMT2是AML炎症的关键调节因子。
 
总体设计 为了研究PRMT2在AML中的作用,我们在HL-60细胞上使用CRISPR-Cas9编辑策略来生成稳定的PRMT2敲除AML细胞株。我们对编辑过的单元格执行了单单元格排序。然后,在所有克隆上筛选PRMT2基因和蛋白表达。选择并制备了最佳的KO克隆(命名为“AA13”和“AA14”)用于批量RNA测序,并将野生型(WT)HL-60细胞系作为对照。所有3个样品均以三份为一份。
 
贡献者 卡米尔S罗曼A劳伦特·D西里尔F
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提交日期 2024年4月30日
上次更新日期 2024年5月29日
联系人姓名 劳伦特·德尔瓦
电子邮件 laurent.delva@u-bourgone.fr
组织名称 勃艮第大学
部门 昆虫U1231(CTM)
门诊化验室 Epi2THM系列
街道地址 Jeanne d'Arc大道7号
西蒂 第戎
邮政编码 21000
国家 法国
 
平台(1)
GPL24676型 Illumina NovaSeq 6000(智人)
样品(9)
GSM8243836型 HL-60 PRMT2 KO,AA13克隆,复制1
GSM8243837型 HL-60 PRMT2 KO,AA13克隆,复制2
GSM8243838型 HL-60 PRMT2 KO,AA13克隆,复制品3
关系
生物项目 邮编106447

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