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GSE261348系列 GSE261348的查询数据集
状态 2024年4月9日公开
职务 广泛期小细胞肺癌化疗免疫治疗结果的空间保留多区域转录组亚型和生物标记物[IMfirst_DSP队列]
有机体 智人
实验类型 其他
总结 转录组亚型有望用于广泛期小细胞肺癌(ES-SCLC)的个性化治疗。在这项研究中,我们旨在评估肿瘤内转录组亚型的多样性,并确定与人类ES-SCLC长期化学免疫治疗益处相关的生物标记物。我们的工作强调,肿瘤内高度异质性、与结果缺乏一致性关联以及亚型特异性靶点表达不明确是SCLC亚型精确肿瘤学面临的主要挑战。预先存在的干扰素驱动免疫和线粒体代谢似乎与ES-SCLC化疗免疫治疗的长期疗效密切相关。
 
总体设计 我们使用来自IMfirst临床试验(EudraCT编号:2019-002784-10)中登记的32名ES-SCLC患者的肿瘤样本,并使用足够的肿瘤材料进行空间保存的转录组学分析。IMfirst研究是一项IIIb期单臂多中心试验,评估PD-L1阻断剂(阿替佐单抗)联合足叶乙甙铂作为ES-SCLC患者一线治疗的安全性和有效性。
我们检索了预处理、福尔马林固定和石蜡包埋(FFPE)的肿瘤标本,这些标本由12 de Octubre研究机构(西班牙马德里)的专家病理学家进行了集中审查。
使用GeoMx数字空间分析(DSP)系统(NanoString)进行空间mRNA分析。在本研究中,我们使用了一种mRNA分析,该分析包含寡核苷酸标记、可光解的RNA-结合探针,靶向与癌症途径和抗肿瘤免疫相关的约1800个基因的表达(癌症转录组图谱、CTA、NanoString)加上额外的定制探针,靶向CTA面板中未包括的三种SCLC亚型定义转录因子(NEUROD1、POU2F3和YAP1)的表达。
 
贡献者 Zugazagoitia杂志
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提交日期 2024年3月11日
上次更新日期 2024年4月10日
联系人姓名 乔恩·祖加扎戈提亚
电子邮件 j.zugazagoitia.imas12@h12o.es
组织名称 医院大学10月12日
部门 医学肿瘤学
门诊化验室 肿瘤微环境与免疫治疗
街道地址 科尔多瓦大街
西蒂 马德里
邮政编码 28041
国家 西班牙
 
平台(1)
GPL30173标准 NextSeq 2000(智人)
样品(175)
GSM8140998 患者IMF002 ROI 001
GSM8140999 患者IMF003 ROI 005
GSM8141000 患者IMF003 ROI 006
关系
生物项目 PRJNA1086533项目

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