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GSE260788系列 GSE260788的查询数据集
状态 2024年5月14日公开
标题 GLI1+细胞参与缺氧和香烟烟雾诱导的肺动脉高压的血管重塑
有机体 小家鼠
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 在肺动脉高压(PH)的背景下,出现在非肌肉化血管中的新形成的α-平滑肌肌动蛋白阳性(ACTA2+)细胞的确切来源仍有争议,尽管人们认为它们主要来源于预先存在的血管平滑肌细胞(VSMCs)。这里是Gli1Core-ERT2;tdTomatoflox小鼠在PH环境下使用两种独立的血管重塑(VR)和反向重塑(RR)模型(缺氧和吸烟暴露(SE))进行血统追踪GLI1+细胞。使用血流动力学测量、右心室肥厚评估、流式细胞术和厚肺切片的组织学分析,然后使用Imaris软件进行最先进的3D重建和量化,以研究GLI1+细胞对肺血管新生肌肉化的贡献。数据表明,在稳定状态下,GLI1+细胞在远端非肌化血管周围大量存在,这种谱系约占这些正常非肌化管道周围新形成ACTA2+细胞的50%。在RR期间,来自GLI1+谱系的细胞在逆转肌肉化的同时被大量清除。部分消融GLI1+细胞可显著阻止VR对缺氧的反应,并减弱RVSP的增加和右心肥厚。在分类的谱系标记GLI1+细胞上进行的单细胞RNA测序(scRNA-seq)显示,Acta2高比例的细胞具有癌症通路和MAPK信号,是VR期间对这些细胞重新编程的潜在参与者。对人肺来源物质的分析表明,GLI1信号在第1组和第3组PH中都被过度激活,并且可以促进增殖和肌源性分化。我们的数据强调GLI1+细胞是PH中VSMC的替代细胞来源,并表明这些细胞和相关信号通路是进一步研究的重要治疗靶点。
 
总体设计 新鲜流式细胞术分选Gli1CreERT2中GLI1+细胞;然后将缺氧条件下的tdTomatoflox小鼠肺组织加工成scRNA-seq
 
贡献者 楚X,贝卢西S,埃尔阿加E,Bartkuhn M公司
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提交日期 2024年3月4日
上次更新日期 2024年5月15日
联系人姓名 马雷克·巴特库恩
电子邮件 marek.bartkuhn@gen.bio.uni-giessen.de
组织名称 吉森Justus Liebig大学
部门 生物医学信息学和系统医学
街道地址 Aulweg奥威132
西蒂 吉森
省/自治区 黑森州
邮政编码 35392
国家 德国
 
平台(1)
GPL13112型 Illumina HiSeq 2000(小家鼠)
样品(1)
GSM8124625型 低氧小鼠肺GLI1+细胞
关系
生物项目 PRJNA1083504项目

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补充文件 尺寸 下载 文件类型/资源
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