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| 状态 |
2024年3月11日公开 |
| 标题 |
蛋白质组学特征显示雌激素信号作为无EGFR或ALK改变的从不吸烟肺腺癌患者的靶点[RNA-seq] |
| 有机体 |
智人 |
| 实验类型 |
通过高通量测序进行表达谱分析
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| 总结 |
不吸烟者肺腺癌（NSLA）在亚洲人群中普遍存在，在女性中更为常见。EGFR突变和ALK融合是NSLA中观察到的主要改变。我们关注的是无EGFR和ALK改变的NSLA（NENA），而不是有EGFR和ALK改变的NSLA（EA）。首先，我们选择了141个NSLA组织，进行了蛋白质组学分析，包括全基因组测序（WGS）、转录组、甲基化EPIC阵列、总蛋白质组和磷酸蛋白质组。然后我们排除了40例EA患者和7例NENA微卫星不稳定患者。基因组分析显示，TP53（25%）、KRAS（22%）、ROS1融合（14%）和SETD2（11%）是NENA患者中最常见的突变基因。蛋白质组学影响分析显示，STK11和ERBB2体细胞突变对NENA中的癌相关基因有更广泛的影响。通过DNA拷贝数改变分析，我们确定了22个影响转录组学和蛋白质组学变化的预后蛋白。基因集富集分析表明，雌激素信号是NENA激活的关键途径。大量蛋白质组学证据支持雌激素信号的增加，如第14和21号染色体的拷贝数缺失、STK11突变以及LLGL2和ST14的DNA低甲基化。最后，saracatinib，一种Src抑制剂，被认为是一种潜在的靶向NENA中激活的雌激素信号的药物，并使用细胞系模型在体外进行了实验验证。在这项研究中，我们通过蛋白质组学景观增强了我们对NENA NSLA病因的了解，基于此，我们提出萨拉卡提尼是一种有效的药物
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| 总体设计 |
通过高通量测序进行表达谱分析
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| 贡献者 |
公园S |
| 缺少引文 |
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| 提交日期 |
2024年2月20日 |
| 上次更新日期 |
2024年3月12日 |
| 联系人姓名 |
成镇公园 |
| 电子邮件 |
tocophobia@gmail.com
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| 组织名称 |
克里布
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| 街道地址 |
格瓦哈克罗
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| 西蒂 |
大田 |
| 邮政编码 |
74031 |
| 国家 |
韩国 |
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| 平台（1） |
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| 样品（141）
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| 关系 |
| 生物项目 |
PRJNA1078228型 |
