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GSE253782系列 GSE253782的查询数据集
状态 2024年2月28日公开
标题 全血转录组学揭示G-CSF是体外循环诱导的全身炎症反应综合征的介质
有机体 智人
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 目的:全身炎症反应综合征(SIRS)是体外循环(CPB)的常见并发症。SIRS与显著的发病率和死亡率相关,但其发病机制尚不完全清楚,因此缺乏生物标记物,治疗仍具有预期性和支持性。本研究旨在了解CPB诱导SIRS的病理生理机制,并确定可能减少全身炎症并改善患者预后的新治疗靶点。方法:选择21例接受心脏手术和体外循环的患者,在手术前、中、后进行血液采样。SIRS是根据美国胸科医师学会/重症监护医学会标准定义的。我们进行了免疫细胞分析、全血转录组学和测量血浆/血清中的单个介质,以表征CPB诱导的SIRS。结果:19名患者符合SIRS标准,平均持续时间为2.7天。CPB后中性粒细胞数量迅速增加,并在至少48小时后保持升高。CPB期间,与中性粒细胞活化和脱颗粒相关的转录特征得到了丰富。我们确定了控制这些转录变化的细胞因子网络,包括粒细胞集落刺激因子(G-CSF),它是中性粒细胞生成和功能的调节器。结论:我们确定中性粒细胞和G-CSF是CPB诱导的全身炎症的主要调节因子。G-CSF的短期靶向性可能为限制中性粒细胞介导的CPB诱导的SIRS炎症和组织损伤提供一种新的治疗策略。
 
总体设计 术前和术后采集静脉血,CPB 60分钟后采集静脉和动脉血。将血液收集到PAXgene Blood RNA收集管(PreAnalytiX GmbH,Hombrechtikon,Switzerland)中,在提取RNA之前将其储存在−20°C下
组:PRE、Day_1、60A(动脉线)、60V(静脉线)。
 
贡献者 马丁·K·R,加梅尔C,博内利R,戴东原,汉森J,塔图利斯J,Alhamdoosh M公司,威尔逊N,维克斯I
引文 38375330
提交日期 2024年1月20日
上次更新日期 2024年2月28日
联系人姓名 凯瑟琳·马丁
电子邮件 martin.k@wehi.edu.au
组织名称 WEHI公司
部门 约翰·T·里德信托实验室
街道地址 1G皇家游行!
西蒂 帕克维尔
省/自治区 维多利亚州
邮政编码 3052
国家 澳大利亚
 
平台(1)
GPL24676型 Illumina NovaSeq 6000(智人)
样品(77)
GSM8027807 N1_PRE(注1)
GSM8027808 N2_预处理
GSM8027809 N2_60年
关系
生物项目 PRJNA1067125型

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