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| 状态 |
2024年5月14日公开 |
| 标题 |
大鼠胰岛mt-tRF-LeuTAA片段的沉默及该片段激活下游机制的RNA测序研究 |
| 有机体 |
褐家鼠 |
| 实验类型 |
通过高通量测序进行表达谱分析
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| 总结 |
在这项研究中，我们发现了由tRNA和mt-tRNA裂解产生的细胞溶质和线粒体片段，这些片段可能充当细胞和代谢功能的新调节器。我们选择mt-tRF-LeuTAA片段进行进一步研究，因为其在胰岛糖尿病易感动物模型中的水平发生了改变，同时富含ß细胞。mt-tRF-LeuTAA片段来自线粒体基因组编码的tRNA-LeuTAA的裂解。我们证明mt-tRF-LeuTAA是线粒体OXPHOS功能、线粒体膜电位、ß细胞胰岛素分泌能力和肌管肌细胞胰岛素敏感性的关键调节器。为了获得全面了解，我们对沉默mt-tRF-LeuTAA 72小时的大鼠胰岛进行了转录组学和蛋白质组学分析。我们用反义寡核苷酸转染大鼠胰岛细胞（与对照寡核苷酸相比，反义寡核苷酸可降低mt-tRF-LeuTAA水平）。这些寡核苷酸可将片段（抗RF-LeuTAA）水平特异性降低95%以上，而不会影响宿主全长tRNA mt-tRNA-LeuTAA。抑制mt-tRF-LeuTAA导致4843 mRNA转录物的显著差异表达，截止值调整后P≤0.05。为了进一步研究与mt-tRF-LeuTAA抑制相关的细胞重排，我们使用基因本体论分子功能术语对RNA测序进行了富集分析。在转录组水平上，当线粒体片段在大鼠胰岛中受到抑制时，我们观察到与离子转运和各种酶活性（包括线粒体氧化还原酶活性）相关的途径丰富。
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| 总体设计 |
为了表征mt-tRF-LeuTAA抑制后大鼠胰岛细胞的基因表达谱，我们用反义寡核苷酸转染分散的大鼠胰脏细胞72小时，以降低mt-tRF-LeuTAA水平（反义寡聚核苷酸n=6），而对照寡聚物（反控寡聚肽n=6）。然后我们分离出总RNA并进行RNA测序。
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| 贡献者 |
贾埃米蒂C,唐纳利C,梅努德五世,苏莱曼M,科森蒂诺C,索贝尔J,吴凯（Wu K）,Bouzakri K公司,马切蒂·P,瓜伊岛C,凯泽B,雷加齐R |
| 引文 |
38704026 |
| 提交日期 |
2023年8月8日 |
| 上次更新日期 |
2024年6月5日 |
| 联系人姓名 |
塞西尔·贾埃韦蒂 |
| 电子邮件 |
Cecile.Jaaventi@unil.ch
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| 电话 |
+41216925281
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| 组织名称 |
洛桑大学
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| 部门 |
基础神经科学
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| 街道地址 |
布农街9号
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| 西蒂 |
洛桑 |
| 邮政编码 |
1005 |
| 国家 |
瑞士 |
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| 平台（1） |
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| 样品（12）
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| 关系 |
| 生物项目 |
项目编号：PRJNA1003495 |
