NCBI徽标
GEO徽标
   美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示帮助 未登录|登录帮助
GEO帮助:将鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。
        去吧
GSE235692系列 GSE235692的查询数据集
状态 2024年1月25日公开
标题 NRF2通过MAPK p38-ETS1诱导的依赖性铁触发信号调节LSEC Bmp6 mRNA表达[I]
有机体 小家鼠
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
摘要 BMP6是一种由肝窦内皮细胞(LSEC)产生的铁感应细胞因子。转录因子NRF2被提议诱导Bmp6表达以应对铁触发的氧化应激,而NRF2基因敲除小鼠被证明不能调节Bmp6以应对大量饮食合成的铁超载。然而,血色素沉着症小鼠模型中LSEC Bmp6的表达水平反映的是肝细胞铁含量,而不是内皮细胞铁含量。因此,铁信号如何转化为Bmp6 mRNA水平的改变尚未完全解决。为了进一步探讨Bmp6的调节机制,我们使用了10-11个月龄的雌性小鼠,这些小鼠的特征是肝细胞铁蓄积,而不是LSEC铁蓄积和转铁蛋白饱和度降低,这表明没有系统性铁超载。我们发现,与年轻对照组相比,老年小鼠的LSEC表现出Bmp6水平增加,但在FACS分类的LSEC中没有表现出氧化应激或NFR2介导的激活信号的转录特征。我们进一步观察到,来自野生型和NRF2敲除小鼠的初级小鼠LSEC诱导Bmp6对急性铁暴露作出反应。通过分析老龄小鼠与年轻小鼠FACS分类LSEC的RNA序列数据,以及年轻小鼠急性注射柠檬酸铁后,我们确定ETS1是参与Bmp6调节的候选转录因子。通过在初级LSEC中进行siRNA-介导的敲除和小分子处理,我们发现Bmp6转录通过ETS1以NRF2诱导的依赖方式进行调节,ETS1在p38 MAP激酶介导的信号下游激活。这一知识扩展了对铁触发氧化应激和在与LSEC活性氧物种水平不偶联的条件下Bmp6转录控制的理解。
 
总体设计 我们分析了分别从静脉注射柠檬酸缓冲液或柠檬酸铁溶液(150 ug)的年轻雌性Balb/c小鼠中获得的FAC分类LSEC的5个和5个RNA样本。
 
贡献者 祖拉斯卡G,乔奇A,萨斯Z,鲁米恩奇克一世,库莱卡M,皮沃卡K,Rygiel T公司,米库拉·M,Mleczko-Sanecka K公司
引文 38293789
提交日期 2023年6月23日
上次更新日期 2024年4月25日
联系人姓名 米查?米库拉
电子邮件 mikula.michal@gmail.com
电话 +48225462655
组织名称 Maria Skłodowska-Curie国家肿瘤研究所
部门 遗传学
街道地址 伦琴5
西蒂 华沙
邮政编码 02781
国家 波兰
 
平台(1)
GPL18635型 离子激流质子(小家鼠)
样品(8)
GSM7507976 LSEC;枸橼酸盐缓冲注射小鼠,代表1
GSM7507977 LSEC;枸橼酸盐缓冲注射小鼠,代表2
克/平方米7507978 LSEC;柠檬酸盐缓冲注射小鼠,代表3
此子系列是超级系列的一部分:
GSE235976标准 NRF2通过MAPK p38-ETS1依赖性铁触发信号调节LSEC Bmp6 mRNA表达
关系
生物项目 1986年9月9日

下载系列 格式
SOFT格式的族文件 柔软帮助
MINiML格式的族文件 MINiML公司帮助
系列矩阵文件 TXT公司帮助

补充文件 大小 下载 文件类型/资源
GSE235692_RAW.tar标准 810.0千桶 (http)(自定义) TAR(TXT的)
SRA运行选择器帮助
SRA中有原始数据
作为补充文件提供的处理数据

|国家土地管理局|国家卫生研究院|GEO帮助|免责声明|无障碍|
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap