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GSE224395系列 GSE224395的查询数据集
状态 2024年2月1日公开
标题 CircAkt3通过调节MAPK信号通路参与大鼠骨癌疼痛进展
有机体 褐家鼠
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
通过高通量测序进行非编码RNA分析
总结 CircRNA亲本基因主要富集于MAPK和神经发育信号通路。BCP组中CircAkt3和circMap4k1显著上调。CircaAkt3可能通过上调Col8a1增加p-ERK的表达,从而进一步激活MAPK通路。
 
总体设计 我们建立了BCP大鼠模型。BCP组和假手术组之间的琼脂糖凝胶电泳和Sanger测序验证了模型中前四个差异表达的circRNAs(DECs)。根据TargetScan预测的circRNAs、microRNA(miRNA)和mRNA之间的相互作用,构建了一个circRNA-miRNA-mRNA网络。定量RT-PCR检测mRNA和circRNA表达水平。此外,进行Western Blot以确定p-ERK、ERK和Col8a1的蛋白质水平。
 
贡献者 陈雷,张X,苏Y,张Y
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提交日期 2023年2月2日
上次更新日期 2024年2月1日
联系人姓名 陈伟芬
电子邮件 chenwf0927@gmail.com
电话 13713896659
组织名称 Forevergen公司
街道地址 国际生物科技岛标准地产3单元1号楼4楼
西蒂 广州
邮政编码 510300
国家 中国
 
平台(1)
GPL25947型 Illumina NovaSeq 6000(褐家鼠)
样品(2)
GSM7021650型 业务连续性计划
GSM7021651型 伪装
关系
生物项目 项目编号:930768

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