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状态 |
2024年5月19日公开 |
标题 |
口腔鳞癌患者肿瘤炎症和基质密度的组织学模式与人口统计学和免疫肿瘤转录谱的相关性 |
有机体 |
智人 |
实验类型 |
按数组进行表达式分析
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总结 |
本研究的目的是证明口腔鳞癌(OSCC)肿瘤炎症和基质密度与患者人口统计学以及8个OSCC肿瘤组织的差异基因表达(DGE)分析的相关性。使用IO-360 nanoString平台,我们发现在转录水平上,在免疫排斥肿瘤和无瘤周间质炎症的肿瘤中观察到细胞因子信号减少和致癌途径激活。吸烟者和男性与全球免疫细胞水平下降和髓系人群占优势有关。
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总体设计 |
根据马里兰大学医学院(UMSOM)机构审查委员会(IRB)批准的方案(HP-00073603),在患者知情同意的情况下,在手术当天前瞻性地从87个OSCC收集全切除肿瘤组织。在87份组织样本中,有8份用于RNA提取,并使用nCounter Human Pan Cancer IO-360代码集+面板标准cat#XT-CSPS-HIO360-12和从nanoString Technology(西雅图,华盛顿州)购买的Master Kit-NAA-AKIT-012平台进行处理和分析。160 366480)
请注意,虽然样本与GSE163131样本相同,但由于与GSE1163131相关出版物无关的其他特性,已创建了一个新记录。
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贡献者 |
尤尼斯RH,Theofilou六世 |
引文 |
38903181 |
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提交日期 |
2022年12月13日 |
上次更新日期 |
2024年8月18日 |
联系人姓名 |
瓦西里厄斯·伊奥纳斯·西奥菲卢(Vasileios Ionas Theofilou) |
电子邮件 |
vtheofilou@umaryland.edu
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电话 |
4109006188
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组织名称 |
马里兰州大学巴尔的摩分校牙科学院
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部门 |
肿瘤学和诊断科学
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街道地址 |
巴尔的摩街西650号
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西蒂 |
巴尔的摩 |
省/自治区 |
医学博士 |
邮政编码 |
21201 |
国家 |
美国 |
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平台(1) |
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样品(8)
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关系 |
生物项目 |
PRJNA911764公司 |