GEO出版物 讲义 NAR 2024（最新） NAR 2002（原件） 所有出版物 常见问题解答 MIAME公司 发送电子邮件给GEO    美国国立生物技术信息中心>地理位置>访问显示 未登录|登录 GEO帮助：鼠标悬停在屏幕元素上以获取信息。 范围：自我 站台 样品 系列 家庭   格式：HTML格式 柔软 MINiML公司   数量：简介 快  GEO加入：   GSE19426系列 GSE19426的查询数据集 状态 2010年12月6日公开 标题 富含层粘连蛋白细胞外基质前列腺癌生长和侵袭三维模型的综合表征 有机体 智人 实验类型 按数组进行表达式分析 总结 全文：富含层粘连蛋白的细胞外基质中前列腺癌生长和侵袭三维模型的综合表征 前列腺癌（PrCa）细胞在富含层粘连蛋白的细胞外基质（lrECM，Matrigel）支持下，在三维（3D）培养中进行腺泡形态发生和球体形成。我们开发了小型化3D模型系统，用于研究lrECM中正常和PrCa细胞系的形态发生和侵袭。原代和未转化的细胞系形成圆形结构，具有强烈的细胞-细胞接触和上皮极化、管腔和完整的基底层（BL）。相反，大多数PrCa细胞系要么形成缺陷的、BL不完整的“块状”球体，要么形成侵袭性的“星状”结构。全基因组mRNA表达数据的生物信息学分析揭示了3D培养中关键功能和信号通路的大规模改变，脂质和类固醇代谢、表观遗传重编程以及lrECM在所有细胞系中诱导的分化相关转录因子。在侵袭性细胞中，AKT、PI3Kinase、mTOR和刺猬信号通路被高度激活，并被专门针对关键调节分子的小分子抑制剂化合物证实。与大量或圆形/正常表型球体和单层培养相比，抗AKT和PI3激酶途径的化合物在侵袭性细胞中更有效。在PC-3和PC-3M细胞中观察到严重的形态学改变，将最初呈圆形、正常外观的上皮球体转变为快速侵入的细胞团。EMT（上皮-间充质转化）标记物在侵袭性转化前的早期、圆形球体中已经高度表达，并且在侵袭性细胞中没有进一步增加。这表明PrCa细胞可以表现出非凡的可塑性。EMT可能参与提供亚稳态基因型，允许形态转化，但不需要侵入过程本身。   总体设计 从非转化前列腺上皮细胞和在单层和三维富含层粘连蛋白的细胞外基质（生长因子诱导的Matrigel）中培养的前列腺癌细胞中获得总RNA。   贡献者 哈姆瓦夫,维塔宁J,梅克尔,半抗原A,Mpdidi J公司,克努提拉M,Kohonen P公司,Lötjönen J,Kallioniemi O公司,Nees M公司 引文 20454659 提交日期 2009年12月11日 上次更新日期 2017年3月20日 联系人姓名 马蒂亚斯·奈斯 电子邮件 matthias.nees@vtt.fi 电话 +358 40 8314 839 传真 +358 2 720 2840 统一资源定位地址 网址：http://www.vtt.fi 组织名称 芬兰VTT技术研究中心 部门 医学生物技术 街道地址 它位于Pitkäkatu 4C 西蒂 图尔库 邮政编码 20521 国家 芬兰   平台（1） GPL6883型 Illumina HumanRef-8 v3.0表达芯片 样品（54） 减少。。。            更多。。。 GSM483220标准 单层培养的PC-3细胞。代表1 GSM483221标准 单层培养PC-3细胞。代表2 GSM483222标准 PC-3细胞在GFR Matrigel中培养8天。代表1 GSM483223标准 PC-3细胞在GFR Matrigel中培养8天。代表2 GSM483224标准 PC-3细胞在GFR Matrigel中培养13天。代表1 GSM483225标准 PC-3细胞在GFR Matrigel中培养13天。代表2 GSM483226标准 PC-3细胞在GFR基质胶中培养15天。代表1 GSM483227标准 PC-3细胞在GFR Matrigel中培养15天。代表2 GSM483228标准 ALVA31细胞在GFR基质中培养11天。代表1 GSM483229标准 ALVA31细胞在GFR基质胶中培养11天。代表2 GSM483230标准 LNCaP细胞在GFR基质中培养11天。代表1 GSM483231标准 LNCaP细胞在GFR基质中培养11天。代表2 GSM483232标准 EP156T细胞在GFR Matrigel中培养11天。代表1 埃及镑483233 EP156T细胞在GFR Matrigel中培养11天。代表2 GSM483234标准 RWPE-1细胞在GFR Matrigel中培养11天。代表1 GSM483235标准 RWPE-1细胞在GFR Matrigel中培养11天。代表2 GSM483236标准 22rv1细胞在GFR Matrigel中培养11天。代表1 GSM483237标准 22rv1细胞在GFR Matrigel中培养11天。代表2 GSM483238标准 在GFR Matrigel中培养11天的DU145细胞。代表1 总人口483239 在GFR Matrigel中培养11天的DU145细胞。代表2 GSM483240型 RWPE-2/w99细胞在GFR基质中培养11天。代表1 GSM483241标准 RWPE-2/w99细胞在GFR基质中培养11天。代表2 总人口483242 22rv1细胞单层培养。代表1 GSM483243标准 22rv1细胞单层培养。代表2 GSM483244标准 单层培养DU145细胞。代表1 GSM483245标准 单层培养DU145细胞。代表2 GSM483246标准 ALVA31细胞单层培养。代表1 GSM483247标准 ALVA31细胞单层培养。代表2 GSM483248标准 单层培养LNCaP细胞。代表1 GSM483249标准 单层培养LNCaP细胞。代表2 GSM483250型 RWPE-2/w99细胞单层培养。代表1 GSM483251标准 RWPE-2/w99细胞单层培养。代表2 GSM483252标准 RWPE-1细胞单层培养。代表1 GSM483253标准 RWPE-1细胞单层培养。代表2 GSM483254标准 EP156T细胞单层培养。代表1 GSM483255标准 EP156T细胞单层培养。代表2 GSM483256型 PC-3细胞在GFR Matrigel中培养4天。代表1 GSM483257标准 PC-3细胞在GFR Matrigel中培养4天。代表2 GSM483258标准 单层培养的PC-3M细胞。代表1 GSM483259标准 单层培养PC-3M细胞。代表2 GSM483260标准 PC-3M细胞在GFR基质中培养4天。代表1 GSM483261标准 PC-3M细胞在GFR基质中培养4天。代表2 GSM483262标准 PC-3M细胞在GFR基质中培养11天。代表1 GSM483263标准 PC-3M细胞在GFR基质中培养11天。代表2 GSM483264标准 RWPE-1细胞在GFR基质胶中培养5天。代表1 GSM483265标准 RWPE-1细胞在GFR Matrigel中培养5天。代表2 GSM483266标准 EP156T细胞在GFR基质中培养5天。代表1 GSM483267标准 EP156T细胞在GFR基质胶中培养5天。代表2 GSM483268标准 单层培养的原代前列腺上皮细胞（PrEC）。代表1 GSM483269标准 单层培养的原代前列腺上皮细胞（PrEC）。代表2 GSM483270型 在GFR Matrigel中培养5天的PrEC细胞。代表1 埃及镑488271 在GFR Matrigel中培养5天的PrEC细胞。代表2 GSM483272标准 在GFR Matrigel中培养12天的PrEC细胞。代表1 GSM483273标准 在GFR Matrigel中培养12天的PrEC细胞。代表2 关系 生物项目 项目编号122291 下载家庭 格式 SOFT格式的族文件 柔软 MINiML格式的族文件 MINiML公司 系列矩阵文件 TXT公司 补充文件 大小 下载 文件类型/资源 GSE19426_RAW.tar公司 3.9兆字节 （http）（自定义） 焦油 GSE19426_非标准化.txt.gz 8.0兆字节 （ftp）（http） TXT公司 样本表中包含的已处理数据 |国家土地管理局|国家卫生研究院|GEO帮助|免责声明|无障碍|