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GSE18864系列 GSE18864的查询数据集
状态 2009年11月4日公开
标题 三阴性乳腺癌患者顺铂单药新辅助试验的肿瘤表达数据
有机体 智人
实验类型 按数组分析表达式
总结 证据表明,BRCA1突变相关肿瘤对顺铂等DNA损伤剂的敏感性增加。散发性三阴性乳腺癌(TNBC)与BRCA1肿瘤有许多表型相似性,并且可能对顺铂有类似的敏感性。我们在一项单臂新辅助试验中对28例TNBC患者进行了顺铂单药治疗的疗效测试,结果通过Miller-Payne量表量化的病理治疗反应来衡量。
我们使用微阵列基因表达谱来确定每个试验肿瘤样本的肿瘤亚型,并测试各种表达特征与顺铂病理反应的相关性。
 
总体设计 临床试验中的预处理肿瘤样本(N=24,组织充足)用于RNA提取、线性扩增、生物素标记和Affymetrix U133+2.0阵列杂交。以类似的方式处理代表所有乳腺癌亚型的51个原发性乳腺肿瘤的参考集,包括线性扩增,并与Affymetrix阵列杂交。
 
贡献者 理查森AL,Eklund空调
引文 20100965,20098429,20189874
提交日期 2009年11月3日
上次更新日期 2019年3月25日
联系人姓名 Aron C Eklund公司
组织名称 丹麦技术大学
部门 生物序列分析中心
街道地址 Kemitorvet,208号楼
城市 灵比
邮政编码 2800
国家 丹麦
 
平台(1)
GPL570型 [HG-U133_Plus_2]Affymetrix人类基因组U133 Plus 2.0阵列
样品(84)
GSM467523 患者1
GSM467524标准 患者2
GSM467525标准 患者3
关系
生物项目 项目编号121115

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