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GSE18728系列 GSE18728的查询数据集
状态 2009年10月30日公开
标题 人类乳腺癌化疗前后的表达数据
有机体 智人
实验类型 按数组进行表达式分析
总结 新辅助化疗已被证明等同于乳腺癌术后治疗,并可用于评估化疗反应。在多西紫杉醇(T)和卡培他滨(X)新辅助化疗治疗第II/III期BC的初步试验中,我们评估了基线基因表达与肿瘤治疗反应之间的相关性,并检查了与治疗相关的基因表达变化。患者接受了4个周期的TX。从Mammotome™核心活检预处理(BL)和TX的第1周期后(C1)中获得的肿瘤组织被快速冷冻并在-70℃下保存,直到处理。基因表达分析使用Affymetrix HG-U133 Plus 2.0基因芯片阵列。RMA归一化后,使用BRB阵列工具进行统计分析。基因本体(GO)通路分析使用随机方差t检验,显著性水平为p<0.005。对于GO通路分析确定为显著的基因类别,使用单变量t检验比较这些通路中各个基因的表达水平;报道了显著性水平为p<0.05的基因。
 
总体设计 基线基因表达分析包括28名患者的基线样本:11名有应答者和17名无应答者。基因表达变化分析包括来自14名患者的配对基线和周期1后样本;其中6例为应答者,8例为无应答者。
 
贡献者 科罗拉多州,卢萨L
引文 20012355
提交日期 2009年10月26日
上次更新日期 2022年6月6日
联系人姓名 拉里萨·科尔德
组织名称 华盛顿大学
部门 医学肿瘤科
街道地址 东湖大街825号,东区G30630
西蒂 西雅图
省/自治区 华盛顿州
邮政编码 98119
国家 美国
 
平台(1)
GPL570型 [HG-U133_Plus_2]Affymetrix人类基因组U133 Plus 2.0阵列
样品(61)
GSM465183标准 pt1.c2型
GSM465184标准 pt3.桶
GSM465185型 pt3.或
关系
生物项目 项目编号121631

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