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状态 |
2009年10月30日公开 |
标题 |
人类乳腺癌化疗前后的表达数据 |
有机体 |
智人 |
实验类型 |
按数组进行表达式分析
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总结 |
新辅助化疗已被证明等同于乳腺癌术后治疗,并可用于评估化疗反应。在多西紫杉醇(T)和卡培他滨(X)新辅助化疗治疗第II/III期BC的初步试验中,我们评估了基线基因表达与肿瘤治疗反应之间的相关性,并检查了与治疗相关的基因表达变化。患者接受了4个周期的TX。从Mammotome™核心活检预处理(BL)和TX的第1周期后(C1)中获得的肿瘤组织被快速冷冻并在-70℃下保存,直到处理。基因表达分析使用Affymetrix HG-U133 Plus 2.0基因芯片阵列。RMA归一化后,使用BRB阵列工具进行统计分析。基因本体(GO)通路分析使用随机方差t检验,显著性水平为p<0.005。对于GO通路分析确定为显著的基因类别,使用单变量t检验比较这些通路中各个基因的表达水平;报道了显著性水平为p<0.05的基因。
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总体设计 |
基线基因表达分析包括28名患者的基线样本:11名有应答者和17名无应答者。基因表达变化分析包括来自14名患者的配对基线和周期1后样本;其中6例为应答者,8例为无应答者。
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贡献者 |
科罗拉多州,卢萨L |
引文 |
20012355 |
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提交日期 |
2009年10月26日 |
上次更新日期 |
2022年6月6日 |
联系人姓名 |
拉里萨·科尔德 |
组织名称 |
华盛顿大学
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部门 |
医学肿瘤科
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街道地址 |
东湖大街825号,东区G30630
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西蒂 |
西雅图 |
省/自治区 |
华盛顿州 |
邮政编码 |
98119 |
国家 |
美国 |
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平台(1) |
GPL570型 |
[HG-U133_Plus_2]Affymetrix人类基因组U133 Plus 2.0阵列 |
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样品(61)
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关系 |
生物项目 |
项目编号121631 |