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| 状态 |
2021年7月22日公开 |
| 标题 |
玻璃化冷冻后猪克隆合子胚胎发育过程中mRNA和长非编码RNA的转录组分析 |
| 有机体 |
苏斯克罗法 |
| 实验类型 |
通过高通量测序进行表达谱分析
通过高通量测序进行非编码RNA分析
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| 总结 |
本研究旨在通过转录组测序获得来自玻璃化猪克隆合子的2细胞、4细胞和囊胚的mRNA和长非编码RNA（lncRNA）图谱。我们在2细胞期鉴定出167个差异表达（DE）mRNA和516个DE lncRNA，在4细胞期鉴定了469个DE mRNA和565个lncRNAs，在囊胚期鉴定出389个DE-mRNA和816个DE-lncRNA。功能富集分析表明，DE-mRNAs在胚胎发育过程中参与了许多与细胞周期、细胞增殖、凋亡、代谢等相关的调控机制。此外，DE-lncRNAs在三个胚胎阶段的靶基因还富集在许多关键GO术语或通路中，如“防御反应”、“亚油酸代谢过程”、“胚胎轴规范”、“蛋白质neddylation负调控”等，本研究提供了玻璃化猪克隆合子不同发育阶段mRNA和lncRNA的全面转录组数据，有助于进一步了解胚胎发育受损的潜在低温损伤机制。
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| 总体设计 |
本研究旨在通过转录组测序获得来自玻璃化猪克隆合子的2细胞、4细胞和胚泡的mRNA和长非编码RNA（lncRNA）图谱。
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| 贡献者 |
向D,吴庚（Wu G） |
| 引文 |
34976007 |
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| 提交日期 |
2021年7月15日 |
| 上次更新日期 |
2022年1月10日 |
| 联系人姓名 |
德才香 |
| 电子邮件 |
askalm@sina.com
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| 组织名称 |
云南省畜牧兽医研究所
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| 街道地址 |
青龙山
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| 西蒂 |
昆明 |
| 邮政编码 |
650224 |
| 国家 |
中国 |
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| 平台（1） |
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| 样品（18）
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| 关系 |
| 生物项目 |
PRJNA747042型 |
| SRA公司 |
SRP328592号机组 |
