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GSE146187系列 查询GSE146187的数据集
状态 2020年5月19日公开
标题 人类眼睛和四种模式物种的水性体液流出途径细胞图谱提供了青光眼发病机制的见解[猪]
有机体 苏斯克罗法
实验类型 通过高通量测序进行表达谱分析
总结 眼压升高是青光眼的主要危险因素,青光眼是一种常见的眼病,其特征是将信息从眼睛传输到大脑的视网膜神经节细胞死亡;降低眼压是唯一经证实的延缓疾病进展的治疗策略。眼压的主要决定因素是房水生成和引流之间的平衡,而引流障碍通常被视为危险眼压升高的主要原因。引流通过眼睛前部的两条通路进行,称为常规引流和葡萄膜巩膜引流。为了深入了解构成这些通路的细胞类型,我们使用了高通量单细胞RNA测序(scRNA-seq)。从约24000个单细胞转录组中,我们用分子标记鉴定了19种细胞类型,并使用组织学方法对每种类型进行了定位。然后,我们对四种用于眼压动力学和青光眼实验研究的生物进行了类似分析:食蟹猴(猕猴)、恒河猴(猕猴桃)、猪(猪)和小鼠(小家鼠)。许多人类细胞类型在这些模型中都有对应物,但细胞类型和基因表达的差异是明显的。最后,我们确定了所有五个物种中表达与青光眼相关基因的细胞类型。总之,我们的结果为研究青光眼的发病机制以及使用模型系统评估机制和潜在干预措施提供了基础。 
 
总体设计 在这些实验中,我们解剖了眼睛的角巩膜段,并使用单细胞RNASeq转录分析了小梁网和周围区域的细胞。我们研究了人类和其他四种常用的青光眼研究动物模型的样本,即食蟹猴(束猴)、恒河猴(恒河猴)、猪(猪)和小鼠(肌肉猴)。
 
贡献者 van Zyl T公司,严伟(Yan W),麦克亚当斯A,彭Y,谢哈尔K,雷格夫A,陪审团D,桑斯JR
引文 32341164
提交日期 2020年3月2日
上次更新日期 2020年5月19日
联系人姓名 严文君
电子邮件 wey334@g.harvard.edu
组织名称 哈佛大学
部门 分子和细胞生物学系
门诊化验室 约书亚·桑斯
街道地址 牛津街52号
西蒂 剑桥
省/自治区 妈妈
邮政编码 02138
国家 美国
 
平台(1)
GPL19176型 Illumina HiSeq 2500(Sus scrofa)
样品(2)
GSM4367933标准 清管器6TM
GSM4367934标准 清管器9TM
此子系列是超级系列的一部分:
GSE146188标准 人类和四种模式物种眼睛中体液流出途径的细胞图谱为青光眼的发病机制提供了见解
关系
生物项目 PRJNA609680型
SRA公司 SRP251247号文件

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