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| 状态 |
2020年9月14日公开 |
| 标题 |
成年斑马鱼肠道神经系统的表达分析 |
| 有机体 |
达尼奥·雷里奥 |
| 实验类型 |
通过高通量测序进行表达谱分析
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| 总结 |
肠道神经系统（ENS）包括胃肠道（GI）固有的神经胶质网络，对消化功能和肠道内环境稳定至关重要。为了研究斑马鱼的ENS，我们对通过FACS（荧光激活细胞分选）纯化的细胞核进行了批量RNA测序，该细胞核代表Tg（sox10:Cre；Cherry）斑马鱼肠道的Cherry+（ENS）和Cherry-（非ENS）外肌层细胞群。
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| 总体设计 |
将平滑肌层和相关的肌间神经丛从成人肠道上皮层分离出来，并进行Dounce均质处理。在过滤匀浆以去除大碎片后，将样品在1000 x G下在4°C下离心10分钟，以获得含有外肌层细胞核的颗粒。在流式细胞术分析中，应用双分辨门控技术排除聚集的细胞核，并通过后续门控DAPI强度的面积和高度确定完整的细胞核。樱桃+（ENS）和樱桃-（非ENS）核种群直接收集到含有Trizol LS试剂的1.5mL试管中。对于每一次复制，来自平均30个成人肠道的分选细胞被汇集在一起，包含大约30000个樱桃+或樱桃核群体。
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| 贡献者 |
希努埃·T,波音S,帕奇尼斯五世 |
| 引文 |
32851974 |
| 提交日期 |
2020年2月25日 |
| 上次更新日期 |
2020年11月3日 |
| 联系人姓名 |
瓦西里斯·帕奇尼斯 |
| 电子邮件 |
瓦西里斯.Pachnis@crick.ac.uk
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| 电话 |
+442037961556
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| 组织机构名称 |
弗朗西斯·克里克研究所
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| 部门 |
神经系统实验室的发展与平衡
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| 门诊化验室 |
帕奇尼斯
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| 街道地址 |
米德兰路1号
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| 城市 |
伦敦 |
| 省/自治区 |
伦敦 |
| 邮政编码 |
NW1 1AT公司 |
| 国家 |
大不列颠联合王国 |
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| 平台（1） |
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| 样品（10）
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| 关系 |
| 生物项目 |
PRJNA608660型 |
| SRA公司 |
SRP250666号文件 |
