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GSE114779系列 GSE114779的查询数据集
状态 2018年5月23日公开
标题 藏猪和约克郡猪全基因组DNA甲基化谱的比较
有机体 苏斯克罗法
实验类型 通过高通量测序进行甲基化分析
总结 我们利用MeDIP-seq(甲基化DNA免疫沉淀测序)技术对高海拔和低海拔饲养的藏猪和约克郡猪的心脏组织全基因组DNA甲基化数据进行了研究,以对比分析这两个品种在常氧和缺氧条件下的表观遗传调控。此外,我们旨在确定藏猪适应高海拔的关键基因和分子机制。亚硫酸氢盐测序和RT-qPCR结果表明,在MeDIP-seq中鉴定出的差异甲基化基因是可信的。我们的研究结果为猪低氧适应的分子机制和表观遗传机制提供了新的见解,并对人类低氧疾病有了更深入的了解。
 
总体设计 高海拔和低海拔饲养的藏猪和约克郡猪心脏组织全基因组DNA甲基化检测。
 
贡献者 张B,张H
引文 30867905
提交日期 2018年5月22日
上次更新日期 2019年3月20日
联系人姓名 张波(音译)
组织名称 中国农业大学
街道地址 中国农业大学动物科学技术学院圆明园西路2号,北京
西蒂 北京
邮政编码 100193
国家 中国
 
平台(1)
GPL19176型 Illumina HiSeq 2500(Sus scrofa)
样品(16)
GSM3150062标准 TH1型
GSM3150063标准 第二次
GSM3150064标准 TH3型
关系
生物项目 项目编号:472604
SRA公司 SRP148690号

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