引用并链接到GEO数据库

Edgar R、Domrachev M、Lash AE。
基因表达综合：NCBI基因表达和杂交阵列数据仓库
《核酸研究》，2002年1月1日；30(1):207-10

Barrett T、Wilhite SE、Ledoux P、Evangelista C、Kim IF、Tomashevsky M、Marshall KA、，Phillippy KH、Sherman PM、Holko M、Yefanov A、Lee H、Zhang N、Robertson CL、Serova N、Davis S、Soboleva A。
NCBI GEO：功能基因组数据集存档——更新。
核酸研究，2013年1月；41（数据库问题）：D991-5。

更多GEO出版物»

“本出版物中讨论的数据保存在NCBI的基因中Expression Omnibus（埃德加等.，2002）和可通过GEO系列登录号GSExxx访问(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSExxx)."

我们强烈建议提交者引用他们的系列加入编号(通用电气设备xxx）因为该记录总结了实验，并包含到所有其他相关数据的链接。

除了引用上面列出的GEO数据库文件中的一份文件作为GEO的通用文件之外，如果适用，您应该引用原始论文和用于识别GEO中实验的登录号。这样，数据集的原始生成器将获得学分，并允许读者查找源。原始论文（如果可用）列在系列和数据集记录的“引文”部分下。

示例：

• “史密斯等2006年，最近进行了微阵列实验，研究神经元上的化合物X（数据可从NCBI GEO数据库（Edgar等.，2002），加入GSExxx）。"
• “2008年3月，搜索GEO Profiles数据库（Barrett等2006年）揭示了基因X因化合物Y而上调（GEO加入GDSxxx；Smith等., 2006)."

另外，请参阅免责声明.

特定GEO平台（GPLxxx）、样本（GSMxxx）或系列（GSExxx）记录可以链接如下：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSExxx个
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GPLxxx个
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSMxxx个

哪里xxx个是加入的数字部分。

我们建议链接到Series对象，因为它总结了实验并包含指向所有其他相关附件的链接。

例子：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSE6364（网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi？acc=GSE6364）

特定数据集（GDSxxx）记录的链接如下：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/GDSbrowser？acc=GDSxxx个

哪里xxx个是加入的数字部分。

例子：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/GDSbrowser？acc=GDS2737

可以使用查询词链接特定配置文件，如下所示：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles？术语=“查询词”

示例：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles？term=GDS621（网址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles？term=GDS621）+与+L13606_at
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles？term=dab2【基因+符号】+AND+人类【有机体】+AND+营养不良

可以使用查询词链接特定数据集，如下所示：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds？术语=“查询术语”

示例：

• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds？term=GDS181+AND+gds[entry+type]
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds？term=酵母菌+酿酒[生物]+AND+应激