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注释

硫化：蛋白质：采用了一个标准的命名法，以便直系同源物具有相同的名称。功能信息可能来自其他腺病毒物种。蛋白质编码区：每个CDS的起始密码子都有同样的可信度...尽可能地。CDS可能是从所有腺病毒的最后一个共同祖先遗传而来，表示为属-共有，而所有其他CDS则表示为属特异性。在一个或多个基因组中具有同源序列的CDS被列为命名家族的成员。E3和E4的进化历史是复杂的，经常涉及全部或部分副录的产生或丢失，伴随着快速的序列分化。在E3中，这在编码跨膜蛋白的一组串联排列的CDS中很明显。所有这些都被列为MP家族的成员，无论序列保守性是否可检测。转录物：在乳腺病毒中，转录来自早期基因（E1A、E1B、E2A、E2B、E3和E4）、中间基因（IX和IVa2）和晚期基因（L、U和E2A-L）。某些转录特征得到了一些腺病毒（特别是人类腺病毒C）中一些基因的实验数据的支持。所有未标记为实验支持的转录特征都是根据CDS表达的保守性和相关性做出的预测。每个预测的置信度取决于所考虑的特征。在灵长类腺病毒中，对E3、E4以及E2A和E2B的5'-区的预测通常是最不确定的。在非原发性乳腺腺病毒中，这种趋势更加明显，以至于E3和E4中的内含子的预测无法提供，E2A、E2B和IVa2的5'-区以及分离33K蛋白编码外显子的内含子预测尤其不确定。在人类腺病毒C中，来自晚期基因（L1-L5）的右向转录物在五个位置（pIIIa、pX、蛋白酶、控制蛋白E3 12.5K和纤维CDS的3'端）和来自E3基因（E3A和E3B）的多聚腺苷酸化信号的下游附近发生多聚腺苷酸化位于两个位置（膜蛋白E3 CR1-beta和控制蛋白E3 14.7K CDS的3'端）。在所有乳腺病毒中，只有L3、E3B和L5的多聚腺苷化信号是保守的，而L1和L2的多聚腺化信号在大多数乳腺病毒中是保守的。此外，在一些乳腺病毒，特别是那些含有非主要宿主的乳腺病毒中，在戊糖基、pVII、V、pVI和纤维2 CDS的3’末端存在潜在的额外多聚腺苷化信号；相应的基因分别列为L1A、L1B、L1C、L2A和L5A。在缺乏E3A多聚腺苷酸化信号的基因组中，与E3B相对应的基因称为E3。在某些情况下，如果TATA信号不明显（尤其是对于E2A/E2B），则会进行临时赋值并标记为标称。 更多

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