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版本5

生物体名称：
果蝇
生物样品：
SAMN02803731号
生物项目：
项目编号13812
提交人：
FlyBase联盟/伯克利果蝇基因组项目/赛莱拉基因组
日期：
2007/10/22
装配级别：
染色体
基因组表示：
满的
GenBank组件加入：
GCA_ 000001215.2（替换）
RefSeq程序集加入：
GCF_ 000001215.2（替换）
RefSeq组件和GenBank组件相同：
否(隐藏详细信息)
  • 仅在RefSeq:染色体MT中
  • 为RefSeq版本显示的数据
WGS项目：
AABU01型

标识：368298【UID】368298[GenBank]238028[参考序列]

请参见基因组的信息黑腹果蝇

病原体检测资源

这个有机体有121个组装体

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历史（显示修订历史）

注释

该序列是来自全基因组鸟枪组装（WGS3）的有序定向序列连接的支架。序列中的间隙用估计大小的N填充。有关此序列的更多信息，包括其位置和...与其他序列的关系，请访问我们的序列存档网站(网址：http://www.ruitfly.org)或发送电子邮件至bdgp@fruitfly.berkeley.edu。由于某些连续项已被其他连续项取代，因此连续项的数量小于加入编号的数量。CON记录是FlyBase Consortium（GPID 13812）提供的带注释的异chomatin。CM000456-CM000461来自染色体臂，DS483543-DS486008是未定位（chrUn）序列。FA000001是这些未定位序列的无序集合。 更多

全球统计

序列总长度139,485,381
总未映射长度136,826,056
脚手架之间的间隙0
脚手架数量2,479
脚手架N5023,011,544
脚手架L50三
连续数3,058
康蒂格N5021,485,538
轮廓L50三
染色体和质粒总数8
组件序列数（WGS或克隆）2,502

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全局程序集定义

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装配单元名称
主要组件
非核武器
装配单元：初级装配（GCF_ 000001625.2）
分子名称GenBank序列RefSeq序列未本地化
序列计数
X染色体AE014298.4号=NC_004354.3号1
染色体2LAE014134.5号=编号_033779.41
染色体2RAE013599.4号=编号_033778.31
染色体3LAE014296.4号=NT_037436.3号1
染色体3RAE014297.2号=编号_033777.21
染色体4AE014135.3号=NC_004353.3号0
染色体Y不适用不适用不适用1
联合国FA000001.1号文件=NS_000188.1号0
未放置的不适用不适用不适用2,466

程序集统计

分子序列角色总计
长度		脚手架
计数		无间隙
长度		脚手架
N50		跨越（Spanned）
差距		未平移
差距
全部组装分子139465864个2,478136,806,53923,011,5445790
X染色体全部组装分子未定位脚手架22,626,93922,422,827204,11221122,536,83922332727个204,11222,422,82722,422,827204,112三三0000
染色体2L全部组装分子未定位脚手架23,380,41623,011,544368,87221123,309,21623,011,344297,87223,011,54423,011,544368,872422000
染色体2R全部组装分子未定位脚手架24,435,46921,146,7083,288,76121123868549个21,146,6082,721,94121,146,70821146708年3,288,76126125000
染色体3L全部组装分子未定位脚手架27,099,04824,543,5572,555,49121126,959,76524,543,4572,416,30824543557个24,543,5572,555,49120119000
染色体3R全部组装分子未定位脚手架30,422,56027,905,0532,517,50721130,169,35927,905,0532,264,30627,905,05327,905,0532,517,50714014000
染色体4组装分子1,351,85711,351,7571,351,85710
染色体Y全部组装分子未定位脚手架347038个0347,038101242,8060242,806347038个0347,03856056000
未放置的组装分子9,802,5372,4668,368,24812,8274550
分子总计
长度
线粒体MT19,517