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蒂拉·沃尔夫斯伯格博士。

副董事

生物信息学和科学编程核心

教育类

普林斯顿大学文学学士

加州大学旧金山分校博士

联系方式
BG 50 RM 5228B
50 SOUTH DR 8004南部
马里兰州贝塞斯达20892

传记

沃尔夫斯伯格博士是NHGRI生物信息学和科学编程核心的副主任。她的研究项目侧重于开发方法，以集成序列、注释和实验生成的数据，以便实验室生物学家能够快速轻松地获得大规模实验的结果。她与NHGRI研究人员合作开展了多个项目，从DNAse I超敏位点和逆转录病毒整合位点的基因组特征到栉水母基因组的注释梳状水母.

沃尔夫斯伯格博士在普林斯顿大学获得分子生物学学士学位，之后在旧金山加利福尼亚大学获得生物化学和生物物理博士学位。沃尔夫斯伯格博士通过在美国国立卫生研究院国家生物技术信息中心（NCBI）进行博士后研究，向基于计算的研究过渡。2000年加入NHGRI之前，她在NCBI担任助理科学家。

沃尔夫斯伯格博士长期致力于生物信息学教育和推广。她是NIH系列讲座的联合主席基因组分析的当前主题到目前为止，这些讲座通过在线播放已经吸引了50多万观众。她在为NHGRI员工提供的几门生物信息学课程中任教，并在年度AACR研讨会上担任生物信息学教员临床肿瘤学中的分子生物学此外，她还为两个版本的教科书编写了一章关于基因组数据库生物信息学：基因和蛋白质分析实用指南，以及有关NCBI MapViewer的一章生物信息学实验室指南和人类遗传学的当前协议.

沃尔夫斯伯格博士还曾担任威康信托-NIH博士生项目咨询委员会（NIH研究生伙伴计划的一部分）的成员，目前是威康信托博士项目竞争委员会的成员，该委员会评估信托基金资助的博士生项目。

  • 传记

    沃尔夫斯伯格博士是NHGRI生物信息学和科学编程核心的副主任。她的研究项目专注于开发整合序列、注释和实验生成数据的方法，以便实验室生物学家能够快速轻松地获得大规模实验的结果。她与NHGRI研究人员合作开展了多个项目，从DNAse I超敏位点和逆转录病毒整合位点的基因组特征到栉水母基因组的注释梳状水母.

    沃尔夫斯伯格博士在普林斯顿大学获得分子生物学学士学位，之后在旧金山加利福尼亚大学获得生物化学和生物物理博士学位。沃尔夫斯伯格博士通过在美国国立卫生研究院国家生物技术信息中心（NCBI）进行博士后研究，向基于计算的研究过渡。2000年加入NHGRI之前，她在NCBI担任助理科学家。

    沃尔夫斯伯格博士长期致力于生物信息学教育和推广。她是NIH系列讲座的联合主席基因组分析的当前主题到目前为止，这些讲座的在线观众已经超过50万。她在为NHGRI员工提供的几门生物信息学课程中任教，并在年度AACR研讨会上担任生物信息学教员临床肿瘤学中的分子生物学此外，她还为两个版本的教科书编写了一章关于基因组数据库生物信息学：基因和蛋白质分析实用指南，以及有关NCBI MapViewer的一章生物信息学实验室指南和人类遗传学的当前协议.

    沃尔夫斯伯格博士还曾担任威康信托-NIH博士生项目咨询委员会（NIH研究生伙伴计划的一部分）的成员，目前是威康信托博士项目竞争委员会的成员，该委员会评估信托基金资助的博士生项目。

科学总结

作为NHGRI生物信息学和科学编程核心的副主任，Wolfsberg博士专注于开发方法，以集成序列、注释和实验生成的数据，从而使实验室生物学家能够快速轻松地获得并解释大规模实验的结果。在可行的情况下，她的团队开发出可应用于各种项目的通用解决方案。

沃尔夫斯伯格博士在解释淡海栉水母 莱迪基因组，第一个完整测序的栉水母基因组。这项工作的一个主要重点是利用各种类型的生物序列数据预测蛋白质编码基因的位置。她的团队还实现了基于网络的基因组浏览器，以查看淡海栉水母基因组组装、基因预测和其他生物相关序列数据。计算管道将在未来用于注释其他基因组，她的团队已经开始努力在水合菌属基因组计划。她对淡海栉水母基因组有助于证明栉水母是我们最古老的动物近亲，它们拥有复杂的细胞类型，如神经元和肌肉细胞；她预计水合菌属将影响我们对组织再生、异体识别和干细胞生物学的理解。

沃尔夫斯伯格博士的团队还开发了分析管道，将实验生成的序列与基因组对齐，然后将感兴趣的位置与基因组浏览器中显示的特征（如基因和转录起始位点）的坐标进行比较。他们最初开发这些注释程序来表征DNAse I超敏位点，但后来使用这种方法来表征不同类型逆转录病毒整合到哺乳动物基因组中的位点。这项工作已用于评估基因治疗研究中作为载体的逆转录病毒的疗效和安全性。最近，她的团队扩展了管道，使其能够一次处理数千个序列（使用所谓的“下一代”序列数据）。这种增强的一个应用是绘制用于灭活斑马鱼基因组中每个基因的逆转录病毒整合图，最终目标是表征产生的表型。

  • 科学总结

    作为NHGRI生物信息学和科学编程核心的副主任，Wolfsberg博士专注于开发方法，以集成序列、注释和实验生成的数据，从而使实验室生物学家能够快速轻松地获得并解释大规模实验的结果。在可行的情况下，她的团队开发出可应用于各种项目的通用解决方案。

    沃尔夫斯伯格博士在解释淡海栉水母 莱迪基因组，第一个完整测序的栉水母基因组。这项工作的一个主要重点是利用各种类型的生物序列数据预测蛋白质编码基因的位置。她的团队还实现了基于网络的基因组浏览器，以查看淡海栉水母基因组组装、基因预测和其他生物学相关的序列数据。未来，计算管道将用于注释其他基因组，她的团队已经开始在水合菌属基因组计划。她对淡海栉水母基因组有助于证明栉水母是我们最古老的动物近亲，它们拥有复杂的细胞类型，如神经元和肌肉细胞；她预计水合菌属将影响我们对组织再生、异体识别和干细胞生物学的理解。

    沃尔夫斯伯格博士的团队还开发了分析管道，将实验生成的序列与基因组对齐，然后将感兴趣的位置与基因组浏览器中显示的特征（如基因和转录起始位点）的坐标进行比较。他们最初开发这些注释程序来表征DNAse I超敏位点，但后来使用这种方法来表征不同类型的逆转录病毒整合到哺乳动物基因组中的位点。这项工作已用于评估基因治疗研究中作为载体的逆转录病毒的疗效和安全性。最近，她的团队扩展了管道，使其能够一次处理数千个序列（使用所谓的“下一代”序列数据）。这种增强的一个应用是绘制用于灭活斑马鱼基因组中每个基因的逆转录病毒整合图，最终目标是表征产生的表型。

出版物

Rudd ML、Mohamed H、Price JC、O'Hara AJ、Le Gallo M、Urick ME；NISC比较测序项目，Cruz P，Zhang S，Hansen NF，Godwin AK，Sgroi DC，Wolfsberg TG，Mullikin JC，Merino MJ，Bell DW。浆液性和透明细胞子宫内膜癌中酪氨酸激酶组的突变分析揭示了TNK2和DDR1中罕见的体细胞突变。BMC癌症, 14:884. 2014. [公共医学]

Renaud G，LaFave MC，Liang J，Wolfsberg TG，Burgess SM.trieFinder：一个注释数字基因表达（DGE）标签的高效程序。BMC生物信息学, 15:329. 2014. [公共医学]

Moreland RT、Nguyen AD、Ryan JF、Schnitzler CE、Koch BJ、Siewert K、Wolfsberg TG、Baxevanis AD。栉水母基因组的定制门户网站梳状水母.BMC基因组学，15（1）:316。2014. [公共医学]

Lafave MC、Varshney GK、Gildea DE、Wolfsberg TG、Baxevanis AD、Burgess SM。MLV整合位点选择由强增强子和活性启动子驱动。核酸研究，42(7):4257-69. 2014. [公共医学]

Ryan JF、Pang K、Schnitzler CE、Nguyen AD、Moreland RT、Simmons DK、Koch BJ、Francis WR、Havlak P；NISC比较测序计划，Smith SA，Putnam NH，Haddock SH，Dunn CW，Wolfsberg TG，Mullikin JC，Martindale MQ，Baxevanis AD。栉水母Mnemiopsis leidyi的基因组及其对细胞类型进化的影响。科学类, 342(6164):1242592. 2013. [公共医学]

Solomon BD、Nguyen A-D、Bear KA、Wolfsberg TG。临床基因组数据库。美国国家科学院程序，110(24):9851-5. 2013. [公共医学]

Nalls MA、Duran R、Lopez G、Kurzawa-Akanbi M、McKeith IG、Chinnery PF、Morris CM、Theuns J、Crosiers D、Cras P、Engelborghs S、De Deyn PP、Van Broeckhoven C、Mann DM、Snowden J、Pickering-Brown S、Halliwell N、Davidson Y、Gibbons L、Harris J、Sheerin UM、Bras J、Hardy J、Clark L、Marder K、Honig LS、Berg D、Maetzler W、Brockmann K、Gasser T、，Novellino F、Quattrone A、Annesi G、De Marco EV、Rogaeva E、Masellis M、Black SE、Bilbao JM、Foroud T、Ghetti B、Nichols WC、Pankratz N、Halliday G、Lesage S、Klebe S、Durr A、Duyckaerts C、Brice A、Giasson BI、Trojanowski JQ、Hurtig HI、Tayebi N、Landazabal C、Knight MA、Keller M、Singleton AB、Wolfsberg TG、Sidransky E。路易体痴呆患者葡萄糖脑苷酶突变的多中心研究。JAMA Neurol公司，70（6）：727-735。2013. [公共医学]

Varshney GK、Lu J、Gildea DE、Huang H、Pei W、Yang Z、Huang-SC、Schoenfeld D、Pho NH、Casero D、Hirase T、Mosbrook-Davis D、Zhang S、Jao LE、ZhangB、Woods IG、Zimmerman S、Schier AF、Wolfsberg TG、Pellegrini M、Burgess SM、Lin S。一种大规模斑马鱼基因敲除资源，用于基因功能的全基因组研究。基因组研究, 23(4):727-35. 2013. [公共医学]

Varshney GK，Huang H，Zhang S，Lu J，Gildea DE，Yang Z，Wolfsberg TG，Lin S，Burgess SM。斑马鱼插入集合（ZInC）：一个基于网络的、可搜索的斑马鱼DNA插入突变集合。核酸研究，41（数据库问题）：D861-4。2013. [公共医学]

Bell DW、Sikdar N、Lee Y-Y、Price JC、Chatterjee R、Park H-D、Fox J、Ishiai M、Rudd ML、Pollock LM、Fogoros SF、Mohamed H、Hanigan CL、NISC、Zhang S、Cruz P、Renaud G、Hansen NF、Cherukuri PF、Borate B、McManus KJ、Stoepel J、Sipahimalani P、Godwin AK、Sgroi DC、Merino MJ、Elliot G、Elkahloun A、Vinson C、Takata M、Mullikin JC、Wolfsberg TG、，Hieter P、Lim D-S和Myung K.易患由哺乳动物Atad5的遗传和功能缺陷引起的癌症。遗传学，7（8）：e1002245。2011年[公共医学]

Sidransky E、Nalls MA、Aasly JO、Aharon-Peretz J、Annesi G、Barbosa ER、Bar-Shira A、Berg D、Bras J、Brice A、Chen CM、Clark LN、Condroyer C、De Marco EV、Dürr A、Eblan MJ、Fahn S、Farrer MJ、Fung HC、Gan-Or Z、Gasser T、Gershoni-Baruch R、Giladi N、Griffith A、Gurevich T、Januario C、Kropp P、Lang AE、Lee-Chen GJ、Lesage S、Marder K马塔IF，Mirelman A、Mitsui J、Mizuta I、Nicoletti G、Oliveira C、Ottman R、Orr-Urtreger A、Pereira LV、Quattrone A、Rogaeva E、Rolfs A、Rosenbaum H、Rozenberg R、Samii A、Samaddar T、Schulte C、Sharma M、Singleton A、Spitz M、Tan EK、Tayebi N、Toda T、Troiano AR、Tsuji S、Wittstock M、Wolfsberg TG、Wu YR、Zabetian CP、Zhao Y和Ziegler SG。帕金森病葡萄糖脑苷酶突变的多中心分析。N英格兰J医学, 361:1651-61. 2009年[公共医学]

Kim YJ、Kim YS、Larochelle A、Renaud G、Wolfsberg TG、Adler R、Donahue RE、Hematti P、Hong BK、Roayaei J、Akagi K、Riberdy JM、Nienhuis AW、Dunbar CE和Persons DA。用SIV慢病毒载体转导的CD34+细胞自体移植恒河猴4年后，维持高水平的多克隆造血标记和转基因表达。血液, 113(22):5434-43. 2009年[公共医学]

Grice EA、Kong HH、Renaud G、Young AC、NISC比较测序项目、Bouffard GG、Blakesley RW、Wolfsberg TG、Turner ML、Segre JA。人类皮肤微生物群的多样性概况。基因组研究，18:1043-1050. 2008. [公共医学]

Crawford GE、Davis S、Scacheri PC、Renaud G、Halawi MJ、Erdos MR、Green R、Meltzer PS、Wolfsberg TG、Collins FS。DNase-chip：一种使用平铺微阵列识别DNAase I超敏位点的高分辨率方法。自然方法, 3:503-509. 2006. [公共医学]

Crawford GE、Holt IE、Whittle J、Webb BD、Tai D、Davis S、Margulies EH、Chen Y、Bernat JA、Ginsburg D、Zhou D、Luo S、Vasicek TJ、Wolfsberg TG和Collins FS。使用大规模并行签名测序（MPSS）对DNA酶超敏位点进行全基因组定位。基因组研究，16:123-131。2006. [公共医学]

Hematti P、Hong BK、Ferguson C、Adler R、Hanawa H、Sellers S、Holt IE、Eckfeldt CE、Sharma Y、Schmidt M、von Kalle C、Persons DA、Billings EM、Verfaillie CM、Nienhuis AW、Wolfsberg TG、Dunbar CE和Calmels B。灵长类造血干细胞和祖细胞中MLV和SIV载体的独特基因组整合。公共科学图书馆生物学，2:2183-2190. 2004. [公共医学]

教学录像

2014年基因组分析系列的当前主题
基因组尺度序列分析

书籍章节和指南

Wolfsberg T.G.、Wetterstrand K.A.、Guyer M.S.、Collins F.S.和Baxevanis A.D.人类基因组II用户指南。自然遗传学：补充35:1-79。2003. [全文]

  • 出版物

    Rudd ML、Mohamed H、Price JC、O'Hara AJ、Le Gallo M、Urick ME；NISC比较测序项目，Cruz P，Zhang S，Hansen NF，Godwin AK，Sgroi DC，Wolfsberg TG，Mullikin JC，Merino MJ，Bell DW。浆液性和透明细胞子宫内膜癌中酪氨酸激酶组的突变分析揭示了TNK2和DDR1中罕见的体细胞突变。BMC癌症, 14:884. 2014. [公共医学]

    Renaud G，LaFave MC，Liang J，Wolfsberg TG，Burgess SM.trieFinder：一个注释数字基因表达（DGE）标签的高效程序。BMC生物信息学, 15:329. 2014. [公共医学]

    Moreland RT、Nguyen AD、Ryan JF、Schnitzler CE、Koch BJ、Siewert K、Wolfsberg TG、Baxevanis AD。栉水母基因组的定制门户网站梳状水母.BMC基因组学, 15(1):316. 2014. [公共医学]

    Lafave MC、Varshney GK、Gildea DE、Wolfsberg TG、Baxevanis AD、Burgess SM。MLV整合位点选择由强增强子和活性启动子驱动。核酸研究，42(7):4257-69. 2014. [公共医学]

    Ryan JF、Pang K、Schnitzler CE、Nguyen AD、Moreland RT、Simmons DK、Koch BJ、Francis WR、Havlak P；NISC比较测序计划，Smith SA，Putnam NH，Haddock SH，Dunn CW，Wolfsberg TG，Mullikin JC，Martindale MQ，Baxevanis AD。栉水母Mnemiopsis leidyi的基因组及其对细胞类型进化的影响。科学类, 342(6164):1242592. 2013. [公共医学]

    Solomon BD、Nguyen A-D、Bear KA、Wolfsberg TG。临床基因组数据库。美国国家科学院院刊，110(24):9851-5. 2013. [公共医学]

    Nalls MA、Duran R、Lopez G、Kurzawa-Akanbi M、McKeith IG、Chinnery PF、Morris CM、Theuns J、Crosiers D、Cras P、Engelborghs S、De Deyn PP、Van Broeckhoven C、Mann DM、Snowden J、Pickering-Brown S、Halliwell N、Davidson Y、Gibbons L、Harris J、Sheerin UM、Bras J、Hardy J、Clark L、Marder K、Honig LS、Berg D、Maetzler W、Brockmann K、Gasser T、，Novellino F、Quattrone A、Annesi G、De Marco EV、Rogaeva E、Masellis M、Black SE、Bilbao JM、Foroud T、Ghetti B、Nichols WC、Pankratz N、Halliday G、Lesage S、Klebe S、Durr A、Duyckaerts C、Brice A、Giasson BI、Trojanowski JQ、Hurtig HI、Tayebi N、Landazabal C、Knight MA、Keller M、Singleton AB、Wolfsberg TG、Sidransky E。路易体痴呆患者葡萄糖脑苷酶突变的多中心研究。JAMA Neurol公司, 70(6):727-735. 2013. [公共医学]

    Varshney GK、Lu J、Gildea DE、Huang H、Pei W、Yang Z、Huang-SC、Schoenfeld D、Pho NH、Casero D、Hirase T、Mosbrook-Davis D、Zhang S、Jao LE、ZhangB、Woods IG、Zimmerman S、Schier AF、Wolfsberg TG、Pellegrini M、Burgess SM、Lin S。一种大规模斑马鱼基因敲除资源，用于基因功能的全基因组研究。基因组研究, 23(4):727-35. 2013. [公共医学]

    Varshney GK，Huang H，Zhang S，Lu J，Gildea DE，Yang Z，Wolfsberg TG，Lin S，Burgess SM。斑马鱼插入集合（ZInC）：一个基于网络的、可搜索的斑马鱼DNA插入突变集合。核酸研究，41（数据库问题）：D861-4。2013. [公共医学]

    Bell DW、Sikdar N、Lee Y-Y、Price JC、Chatterjee R、Park H-D、Fox J、Ishai M、Rudd ML、Pollock LM、Fogoros SF、Mohamed H、Hanigan CL、NISC、Zhang S、Cruz P、Renaud G、Hansen NF、Cherukuri PF、Borate B、McManus KJ、Stoepel J、Sipahimalani P、Godwin AK、Sgroi DC、Merino MJ、Elliot G、Elkahloun A、Vinson C、Takata M、Mullikin JC、Wolfsberg TG、，Hieter P、Lim D-S和Myung K.易患由哺乳动物Atad5的遗传和功能缺陷引起的癌症。遗传学，7（8）：e1002245。2011年[公共医学]

    Sidransky E、Nalls MA、Aasly JO、Aharon-Peretz J、Annesi G、Barbosa ER、Bar-Shira A、Berg D、Bras J、Brice A、Chen CM、Clark LN、Condroyer C、De Marco EV、Dürr A、Eblan MJ、Fahn S、Farrer MJ、Fung HC、Gan-Or Z、Gasser T、Gershoni-Baruch R、Giladi N、Griffith A、Gurevich T、Januario C、Kropp P、Lang AE、Lee-Chen GJ、Lesage S、Marder K马塔IF，Mirelman A、Mitsui J、Mizuta I、Nicoletti G、Oliveira C、Ottman R、Orr-Urtreger A、Pereira LV、Quattrone A、Rogaeva E、Rolfs A、Rosenbaum H、Rozenberg R、Samii A、Samaddar T、Schulte C、Sharma M、Singleton A、Spitz M、Tan EK、Tayebi N、Toda T、Troiano AR、Tsuji S、Wittstock M、Wolfsberg TG、Wu YR、Zabetian CP、Zhao Y和Ziegler SG。帕金森病葡萄糖脑苷酶突变的多中心分析。N英格兰J医学, 361:1651-61. 2009年[公共医学]

    Kim YJ、Kim YS、Larochelle A、Renaud G、Wolfsberg TG、Adler R、Donahue RE、Hematti P、Hong BK、Roayaei J、Akagi K、Riberdy JM、Nienhuis AW、Dunbar CE和Persons DA。用SIV慢病毒载体转导的CD34+细胞自体移植恒河猴4年后，维持高水平的多克隆造血标记和转基因表达。血液, 113(22):5434-43. 2009年[公共医学]

    Grice EA、Kong HH、Renaud G、Young AC、NISC比较测序项目、Bouffard GG、Blakesley RW、Wolfsberg TG、Turner ML、Segre JA。人类皮肤微生物群的多样性概况。基因组研究，18:1043-1050。2008. [公共医学]

    Crawford GE、Davis S、Scacheri PC、Renaud G、Halawi MJ、Erdos MR、Green R、Meltzer PS、Wolfsberg TG、Collins FS。DNase-chip：一种使用平铺微阵列识别DNAase I超敏位点的高分辨率方法。自然方法, 3:503-509. 2006. [公共医学]

    Crawford GE、Holt IE、Whittle J、Webb BD、Tai D、Davis S、Margulies EH、Chen Y、Bernat JA、Ginsburg D、Zhou D、Luo S、Vasicek TJ、Wolfsberg TG和Collins FS。使用大规模并行签名测序（MPSS）对DNA酶超敏位点进行全基因组定位。基因组研究，16:123-131. 2006. [公共医学]

    Hematti P、Hong BK、Ferguson C、Adler R、Hanawa H、Sellers S、Holt IE、Eckfeldt CE、Sharma Y、Schmidt M、von Kalle C、Persons DA、Billings EM、Verfaillie CM、Nienhuis AW、Wolfsberg TG、Dunbar CE和Calmels B。灵长类造血干细胞和祖细胞中MLV和SIV载体的独特基因组整合。公共科学图书馆生物学，2:2183-2190. 2004. [公共医学]

    教学录像

    2014年基因组分析系列的当前主题
    基因组尺度序列分析

    书籍章节和指南

    Wolfsberg T.G.、Wetterstrand K.A.、Guyer M.S.、Collins F.S.和Baxevanis A.D.人类基因组用户指南II。自然遗传学：补充35:1-79。2003. [全文]

上次更新时间：2022年3月24日