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调查人员

基因组学和数据科学研究中心

头部

系统生物学和基因组工程科

教育类

B.S.加州理工学院

加州大学伯克利分校博士

科学总结

系统生物学和基因组工程科的目标是系统地了解遗传差异的表型结果。通过研究遗传多样性的功能效应,例如个体之间或物种之间的自然变异,或我们创造的新的遗传变化,部门研究人员致力于理解遗传和表型变异之间的联系原则。由于潜在遗传变异的空间巨大,本节设计了并行研究大量遗传差异的策略。这些策略利用了CRISPR技术的优势、大规模寡核苷酸合成、酵母模型系统的威力以及高通量表型和基因分型,以生成和研究数千种独特的遗传变异的影响。除了应用现有的基因组工程方法外,本节还旨在通过开发新的强有力的方法来研究遗传多样性,从而进一步扩大基因组学的范围。

选定出版物

Weller CA、Andreev I、Chambers MJ、Park M;NISC比较测序计划;Bloom JS、Sadhu MJ。高度完整的长读基因组揭示了酵母表型多样性背后的泛基因组变异.基因组研究。33(5):729-740. 2023

Andreev I、Laidlaw KME、Giovanetti SM、Urtecho G、Shriner D、Bloom JS、MacDonald C、Sadhu MJ。发现一种快速进化的酵母防御因子KTD1,对抗分泌型杀伤毒素K28.美国国家科学院.120(8):e2217194120。2023

舒伯特OT、布鲁姆JS、萨杜MJ、克鲁格利亚克L。全基因组碱基编辑器屏幕识别酵母中蛋白质丰度的调节器。 电子生活2022年11月3日;11:e79525。doi:10.7554/eLife.79525。2022

Boocock J、Sadhu MJ、Durvasula A、Bloom JS、Kruglyak L。古代的平衡选择保持了酵母中半乳糖途径的不相容版本。 科学类. 22;371(6527):415-419. 2021

Bloom JS、Boocock J、Treusch S、Sadhu MJ、Day L、Oates-Barker H、Kruglyak L。罕见的变异对酵母数量性状变异的贡献不成比例。 电子生活. 24;8:e49212。doi:10.7554/寿命49212。2019

Sadhu MJ、Bloom JS、Day L、Siegel JJ、Kosuri S、Kruglyak L。利用CRISPR-Cas9进行高度并行的基因组变异工程.自然基因. 50(4):510-514. 2018

Forsberg SK、Bloom JS、Sadhu MJ、Kruglyak L、Carlborg。考虑遗传相互作用改进了酵母个体数量性状表型的建模.自然基因. 49(4):497-503. 2017

Sadhu MJ、Bloom JS、Day L、Kruglyak L。CRISPR定向有丝分裂重组无需交叉就能进行基因定位.科学。352(6289):1113-6. 2016

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系统生物学和基因组工程科工作人员

西蒙·乔瓦内蒂
西蒙·乔瓦内蒂
  • 实验室经理
  • 系统生物学和基因组工程科
钱明健
钱明健
  • 研究生
  • 系统生物学和基因组工程科
穆达比尔·阿卜杜拉
Mudabir Abdullah博士。
  • 博士后研究员
  • 系统生物学和基因组工程科
安妮特·伊特拉尔德
安妮特·伊特拉尔德
  • 毕业后研究员
  • 系统生物学和基因组工程科
索菲·斯科贝尔
索菲·斯科贝尔
  • 毕业后研究员
  • 系统生物学和基因组工程科
迪妮·郑
迪妮·郑
  • 毕业后研究员
  • 系统生物学和基因组工程科

校友

  • 科里·韦勒;博士后(2019-2022);NIH阿尔茨海默病和相关痴呆症中心-研究科学家

  • 阿波瓦·拉维桑卡;博士后(2020-2022);亚马逊——研究科学家

  • 莫莉·蒙格;Postbac(2021-2023年);Weill Cornell,Rockefeller,密歇根州立大学医学博士,博士生

  • 伊利亚·安德列夫;Postbac(2019-2021);麻省理工学院生物学博士生

传记

梅鲁·萨杜(Meru Sadhu)是美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)系统生物学和基因组工程科科长,伯爵·斯塔德曼(Earl Stadtman)研究员。他在加州理工学院获得学士学位,然后在加州大学伯克利分校与贾斯珀·莱恩一起攻读博士学位。在博士后阶段,萨杜博士加入了加州大学洛杉矶分校Leonid Kruglyak的实验室,以补充他在古典遗传学方面的背景和在数量遗传学方面的培训。他开发了将CRISPR技术应用于定量遗传学问题的方法,包括使用CRISPR-直接重组,以及平行检查数千种特定遗传变异的影响。2018年,他来到NIH,成立了系统生物学和基因组工程科,在那里他使用高通量方法解决遗传学中的重要问题。

 

2019年研讨会

 

上次更新时间:2023年10月15日