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高级研究员

翻译和功能基因组学分支

头部

基因组功能分析科

教育类

宾夕法尼亚州立大学理学学士

宾夕法尼亚州立大学博士

传记

劳拉·埃尔尼茨基(Laura Elnitski)在宾夕法尼亚州立大学(Pennsylvania State University)获得分子和细胞生物学学士学位,并从事化学工程专业研究。她还获得了宾夕法尼亚州立大学生物化学和分子生物学博士学位,同时进行首批研究非编码调控元件的多物种比较的项目之一。她因在宾夕法尼亚州立大学计算机科学与工程系进行博士后培训而获得美国国立卫生研究院颁发的Ruth L.Kirschstein国家研究服务奖(National Research Service Award)奖学金,她专注于开发和解释多物种基因组比对以检测保守调控区域。

埃尔尼茨基博士于2005年加入国家人类基因组研究所,担任终身研究员。她参与了许多基因组测序项目,包括小鼠、大鼠、奶牛和鸡,以及ENCODE联盟,以阐明人类基因组中的功能元素。她的工作专注于开发工具,以识别和辨别人类基因组中功能元件的机械作用,包括启动子、增强子、沉默子、剪接元件和表观遗传调节器。2007年,她在哈佛大学生物信息学、研究和应用国际研讨会上获得杰出研究成果奖,并于2009年被选为基因组技术国际青年研究员奖。

2013年,Elnitski博士被授予NHGRI的教师指导奖。她是美国国立卫生研究院基因组学和计算生物学研究科的常务成员。

  • 传记

    劳拉·埃尔尼茨基(Laura Elnitski)在宾夕法尼亚州立大学(Pennsylvania State University)获得分子和细胞生物学学士学位,并从事化学工程专业研究。她还获得了宾夕法尼亚州立大学生物化学和分子生物学博士学位,同时进行首批非编码调控元件的多物种比较项目之一。她因在宾夕法尼亚州立大学计算机科学与工程系进行博士后培训而获得美国国立卫生研究院颁发的Ruth L.Kirschstein国家研究服务奖(National Research Service Award)奖学金,她专注于开发和解释多物种基因组比对以检测保守调控区域。

    埃尔尼茨基博士于2005年加入国家人类基因组研究所,担任终身研究员。她参与了许多基因组测序项目,包括小鼠、大鼠、奶牛和鸡,以及ENCODE联盟,以阐明人类基因组中的功能元素。她的工作专注于开发工具,以识别和辨别人类基因组中功能元件的机械作用,包括启动子、增强子、沉默子、剪接元件和表观遗传调节器。2007年,她在哈佛大学生物信息学、研究和应用国际研讨会上获得杰出研究成果奖,并于2009年被选为基因组技术国际青年研究员奖。

    2013年,Elnitski博士被NHGRI授予教师指导奖。她是NIH基因组学和计算生物学研究部门的常务成员。

科学总结

人类基因组计划的完成是全面注释基因组内容的关键一步,为深入研究难以捉摸的功能元件打开了大门。为了确定和表征与疾病有关的非编码调节元件,埃尔尼茨基博士自2003年起一直是ENCODE联盟的成员,该联盟发起编目人类基因组调节区域的内容(参见ENCODE出版物科学类,自然美国国家科学院). 从那时起,埃尔尼茨基博士的研究开创了实验和计算方法的先河,以识别和验证人类基因组中没有特征的调节成分。例如,为了解决沉默元素在调节活性基因表达中的微妙相互作用,Elnitski博士开发了一个系统来检测人类序列中的这些元素。该结果首次表明,可以在有效的分析系统中大规模研究负作用元素(发表于基因组研究).

双向启动子是目前广泛接受的一种基因调控机制。然而,在2007年,具有这种调节结构的基本基因集,尤其是非编码基因,尚不清楚。Elnitski博士的团队在几篇同行评审的出版物中阐明了这个基因集合(包括计算生物学BMC基因组学和会议论文),显示了这种监管结构的广泛和重复发生。此外,通过在五个基因组中映射这些调控元件,她和她的团队表明双向启动子是哺乳动物转录控制中的基本调控成分,并且许多双向启动子对单个物种是特异的。这些独特出现的元素的图谱显示了物种间基因组重排的位置,并暗示了物种特异转录物的存在。从这个角度来看,该小组确定了与其他已测序哺乳动物基因组相比,人类基因组所特有的所有此类启动子区域,并确定了1000多个候选人类特定基因(发表于公共科学图书馆).

热图描绘了各种妇科组织和肿瘤中DNA甲基化的分层水平(分别从上到下)


由于受调控基因表达的复杂性,转录剪接是一个复杂而微妙的过程,其中的错误可能导致毁灭性疾病。Elnitski博士的团队认识到剪接信号在机械上是稳健的,并利用了一组常见的功能元件,因此开发了一种新的工具来解释未注释的剪接元件。该工具还预测了序列变异的后果,这些序列变异改变了这些调控元件的序列,从而破坏了正常的剪接结果(发表于基因组生物学). 这些工具及时出现,以支持一种新的基因组范式,在这种范式中,同义替换越来越多地被认为是调控剪接场景中的破坏性事件。Elnitski博士最近发表了一份关于新的同义词突变的报告CFTR公司,囊性纤维化的基因,可能在疾病的病因中起作用(发表于囊性纤维化杂志). 她还发表了对黑色素瘤中反复出现的同义驱动基因突变的计算评估(发表于美国国家科学院).

基因调控最有趣的组成部分之一是表观遗传密码,它通过其在DNA序列上方的位置影响基因表达。埃尔尼茨基博士的团队正在研究癌症样本的改变后的表观遗传模式,以确定受到异常调控的基因组位点。她的工作已经确定了15种不同类型癌症的上皮肿瘤中表观遗传学状态通常改变的基因组区域,为疾病的预测生物标志物提供了一个有希望的候选者(发表于表观遗传学). 在正在进行的研究中,她正在研究甲基化子表型在肿瘤中的作用,其特征是肿瘤表型的广泛甲基化。Elnitski小组在子宫内膜样亚型卵巢肿瘤中发现了甲基化表型(发表于公共科学图书馆). 具有甲基化表型的肿瘤很容易与其他亚型区分,并且通常具有显著不同的预后结果。因此,基于DNA甲基化模式的诊断可能为个性化治疗提供有效和经济的途径。此外,通过研究DNA甲基化谱,Elnitski博士将能够拼凑出正常和异常条件下负责DNA甲基化模式的功能通路的组成部分。这些相同的想法延伸到了对人类肿瘤小鼠模型的分析。例如,实验室的一个项目检测了携带PTEN-/-和APC-/-突变或PTEN-//-APC-/-及ARID1A-/-突变的两种人类子宫内膜样卵巢肿瘤的DNA甲基化模式。该项目探讨了这些肿瘤是否再现了人类表型,在这种情况下,它们应该表现出广泛的异常DNA甲基化。

这些研究项目旨在识别和理解在人类基因组测序之前无法全面解决的细胞调控机制。通过研究细胞内基因表达、DNA甲基化和DNA突变的综合图片,Elnitski博士建议建立一个全面的图片,以阐明包括因果事件在内的疾病机制。

  • 科学总结

    人类基因组计划的完成是全面注释基因组内容的关键一步,为深入研究难以捉摸的功能元件打开了大门。为了确定和表征与疾病有关的非编码调节元件,埃尔尼茨基博士自2003年起一直是ENCODE联盟的成员,该联盟发起编目人类基因组调节区域的内容(参见ENCODE出版物科学类,自然美国国家科学院). 从那时起,埃尔尼茨基博士的研究开创了实验和计算方法的先河,以识别和验证人类基因组中没有特征的调节成分。例如,为了解决沉默元素在调节活性基因表达中的微妙相互作用,Elnitski博士开发了一个系统来检测人类序列中的这些元素。该结果首次表明,可以在有效的分析系统中大规模研究负作用元件(发表于基因组研究).

    双向启动子是目前广泛接受的一种基因调控机制。然而,在2007年,具有这种调节结构的基本基因集,尤其是非编码基因,尚不清楚。Elnitski博士的团队在几篇同行评审的出版物中阐明了这个基因集合(包括计算生物学BMC基因组学和会议论文),显示了这种监管结构的广泛和重复发生。此外,通过在五个基因组中映射这些调控元件,她和她的团队表明双向启动子是哺乳动物转录控制中的基本调控成分,并且许多双向启动子对单个物种是特异的。这些独特出现的元素的图谱显示了物种间基因组重排的位置,并暗示了物种特异转录物的存在。从这个角度来看,该小组确定了与其他已测序哺乳动物基因组相比,人类基因组所特有的所有此类启动子区域,并确定了1000多个候选人类特定基因(发表于公共科学图书馆).

    热图描绘了各种妇科组织和肿瘤中DNA甲基化的分层水平(分别从上到下)


    由于受调控基因表达的复杂性,转录剪接是一个复杂而微妙的过程,其中的错误可能导致毁灭性疾病。Elnitski博士的团队认识到剪接信号在机械上是稳健的,并利用了一组常见的功能元件,因此开发了一种新的工具来解释未注释的剪接元件。该工具还预测了序列变异的后果,这些序列变异改变了这些调控元件的序列,从而破坏了正常的剪接结果(发表于基因组生物学). 这些工具及时出现,以支持一种新的基因组范式,在这种范式中,同义替换越来越多地被认为是调控剪接场景中的破坏性事件。Elnitski博士最近发表了一份关于新的同义词突变的报告CFTR公司,囊性纤维化的基因,可能在疾病的病因中起作用(发表于囊性纤维化杂志). 她还发表了对黑色素瘤中反复出现的同义驱动基因突变的计算评估(发表于美国国家科学院).

    基因调控最有趣的组成部分之一是表观遗传密码,它通过其在DNA序列上方的位置影响基因表达。埃尔尼茨基博士的团队正在研究癌症样本的改变后的表观遗传模式,以确定受到异常调控的基因组位点。她的工作已经确定了15种不同类型癌症的上皮性肿瘤中表观遗传状态普遍改变的基因组区域,为疾病的预测生物标记物提供了一个有希望的候选区域(发表于表观遗传学). 在正在进行的研究中,她正在研究甲基化子表型在肿瘤中的作用,其特征是肿瘤表型的广泛甲基化。Elnitski小组在子宫内膜样亚型卵巢肿瘤中发现了甲基化表型(发表于公共科学图书馆). 具有甲基化表型的肿瘤很容易与其他亚型区分,并且通常具有显著不同的预后结果。因此,基于DNA甲基化模式的诊断可以为个性化治疗提供有效和经济的途径。此外,通过研究DNA甲基化谱,Elnitski博士将能够拼凑出正常和异常条件下负责DNA甲基化模式的功能通路的组成部分。这些想法也延伸到了人类肿瘤小鼠模型的分析中。例如,实验室的一个项目检测了携带PTEN-/-和APC-/-突变或PTEN-//-APC-/-及ARID1A-/-突变的两种人类子宫内膜样卵巢肿瘤的DNA甲基化模式。该项目探讨了这些肿瘤是否再现了人类表型,在这种情况下,它们应该表现出广泛的异常DNA甲基化。

    这些研究项目旨在识别和理解在人类基因组测序之前无法全面解决的细胞调控机制。通过研究细胞内基因表达、DNA甲基化和DNA突变的综合图像,Elnitski博士建议生成一个全面的图像,以阐明包括因果事件在内的疾病机制。

出版物

Waterston RH等人,包括Elnitski L.小鼠基因组的初始测序和比较分析。自然, 420: 520-562. 2002. [公共医学]

Gibbs RA等人,包括Elnitski L.Brown Norway大鼠的基因组序列,为哺乳动物进化提供了见解。自然, 428: 493-521. 2004. [公共医学]

国际鸡基因组联合会,Hillier,LW等,包括Elnitski L.。鸡基因组的序列和比较分析为脊椎动物进化提供了独特的视角。鸡基因组的序列和比较分析为脊椎动物进化提供了独特的视角。自然, 432(7018):695-716. 2004. [公共医学]

ENCODE项目联盟。ENCODE(DNA元素百科全书)项目。科学类, 306:636-640. 2004. [公共医学]

Giardine,B.,Riemer,C.,Hardison,R.C.,Burhans,R.,Elnitski,L.,Shah,P.,Zhang,Y.,Blankenberg,D.,Albert,I.,Taylor,J.,Miller,W.,Kent,W.J.,Nekrutenko,A.Galaxy:交互式大规模基因组分析平台。基因组研究, 15:1451-5. 2005. [公共医学]

Elnitski,L.,Jin,V.X.,Farnham,P.J.,Jones,S.J.定位哺乳动物转录因子结合位点:计算和实验技术的调查。基因组研究, 16:1455-1464. 2006. [公共医学]

Petrykowska,H.M,Vockley,C.M.和Elnitski,L.大鼠体内沉默剂和增强子阻滞剂的检测和表征CFTR公司轨迹。基因组研究, 18(8):1238-46. 2008. [公共医学]

Elsik CG等人,包括Elnitski L.牛磺酸牛的基因组序列:反刍动物生物学和进化的窗口。科学,324: 522-528. 2009年[公共医学]

Piontkivska H,Yang MQ,Larkin DM,Lewin HA,Reecy J,Elnitski L.双向启动子的交叉特异性映射能够预测未注释的5'UTR并鉴定物种特异性转录物。BMC基因组学, 10:189. 2009年[公共医学]

牛基因组测序和分析协会、Elsik CG、Tellam RL、Worley KC、Gibbs RA、Muzny DM、Weinstock GM、Adelson DL、Eichler EE、Elnitski L等。牛磺酸牛的基因组序列:反刍动物生物学和进化的窗口。科学类, 324:522-8. 2009年[公共医学]

Woolfe A、Mullikin JC、Elnitski L.定义调控剪接的外显子变体的基因组特征。基因组生物学,11(2):R20。2010. [公共医学]

Kolbe DL,DeLoia JA,Porter-Gill P,Strange M,Guirguis A,Krivak TC,Brody LC,Elnitski L.原发性上皮性卵巢癌和卵巢子宫内膜转移瘤中位点特异性DNA甲基化模式的基因组分析。公共科学图书馆,7:e32941。2012. [公共医学]

Scott,A,Petrykowska HM,Gotea V,Hefferon T,Elnitski L.预测影响剪接的同义替换的功能分析CFTR公司基因。J.囊性纤维化时间:11:511-517。(2012年4月至6月下载量最大的前25篇论文。)2012. [公共医学]

ENCODE项目联盟,包括Elnitski L.人类基因组中DNA元素的综合百科全书。自然489: 57-74. 2012. [公共医学]

Laflamem K,Owen AN,Devlin EE,Yang MQ,Wong C,Steiner LA,Garrett LJ,Elnitski L,Gallagher PG,Bodine DM。人类锚蛋白基因(ANK-1)启动子内一个新的顺式调节区的功能分析。分子细胞生物学, 30:3493-502. 2010. [公共医学]

ENCODE项目联盟等,包括Elnitski,L.DNA元素百科全书(ENCODE)用户指南。公共科学图书馆生物,9:e1001046。2011年[公共医学]

Gotea V、Petrykowska HM、Elnitski L.双向启动子是物种特异转录物出现的重要驱动因素。公共科学图书馆一号,8:e57323。2013. [公共医学]

Parker SCJ、Prickett TD Dutton Regester K、Stitzel ML、Lin JC、Davis S、Simhadri VL、Jha S、Katagiri N、Gotea V、Teer JK、Xiaomu W、Morken MA、Bhanot UK、NISC比较测序程序、Chen G、Elnitski LL、Davies MA、Gershenwald JE、Carter H、Karchin R、Robinson W、Robinson S、Rosenberg SA、Francis S.Collins FS、Parmigiani G、Komar AA、,Kimchi-Sarfaty C、Hayward N、Margulies EH和Samuels Y。全基因组测序确定了黑色素瘤中反复发生的功能性同义突变。国家科学院程序, 110:13481-6. 2013. [PUbMed公司]

Sánchez-Vega F、Gotea V、Petrykowska HM、Margolin G、Krivak TC、DeLoia JA、Bell DW、Elnitski L.(2013)在广泛的人类实体上皮肿瘤和癌细胞系中,ZNF154、CASP8和VHL启动子中DNA甲基化的复发模式。表观遗传学, 8:1355-72. [公共医学]

Kellis M、Wold B、Snyder议员、Bernstein BE、Kundaje A、Marinov GK、Ward LD、Birney E、Crawford GE、Dekker J、Dunham I、Elnitski LL、Farnham PJ、Feingold EA、Gerstein M、Giddings MC、Gilbert DM、Gingeras TR、Green ED、Guigo R、Hubbard T、Kent J、Lieb JD、Myers RM、Pazin MJ、Ren B、Stamatoyannopoulos JA、Weng Z、White KP、Hardison RC。定义人类基因组中的功能DNA元素。国家科学院程序, 111:6131-8. 2014. [公共医学]

Gotea V,Elnitski L.通过弱到强突变热点确定受GC-biased基因转换影响的区域。基因组学, 103(5-6):349-56. 2014. [公共医学]

Gotea V、Gartner JJ、Qutob N、Elnitski L、Samuels Y。黑色素瘤和其他癌症中体细胞同义突变的功能相关性。色素细胞黑素瘤研究,doi:10.1111/pcmr.12413。2015. [公共医学]

Sánchez-Vega F,Gotea V,Margolin G,Elnitski L.(2015)人类实体上皮性肿瘤和癌细胞系的泛癌分层揭示了CpG岛甲基化表型的共性和组织特异性特征。表观遗传学染色质, 8:14. 2015. [公共医学]

Margolin G,Petrykowska HM,Jameel N,Bell DW,Young AC,Elnitski L.使用基于血液的诊断开发的硅胶模型对ZNF154作为泛癌基因座的DNA超甲基化进行稳健检测。J Mol诊断, (15)00274-3. 2016年[公共医学]

书籍章节

Yang,M.Q.和Elnitski,L.L.人类基因组双向启动子的特征表征和测试——在人类基因组研究中的意义和应用。中的第19章生物信息学中的机器学习,张燕青(Yan-Qing Zhang)和贾加特·拉贾帕克塞(Jagath C.Rajapakse),主编约翰·威利(John Wiley&Sons),2007年。

Yang,M.Q.和Elnitski,L.人类基因组双向启动子的计算研究。生物信息学研究与应用,Zhang,Y.,编辑,海德堡,第361-371页。2007

Yang,M.Q.和Elnitski,L.《双向启动子的正畸学》使我们能够使用多类预测因子来区分人类基因组中的功能元件。2007年生物信息学和计算生物学国际会议论文集。Arabnia,Yang,M.Q.和Yang,J.Y.编辑,第218-228页。2007

Yang,M.Q.,Taylor,J.和Elnitski,L.脊椎动物中直系双向启动子的严格定位。生物信息学和生物科学计算学报。BMC生物信息学补充版。第115-122页。2008

Elnitski L,Burhans R,Riemer C,Hardison R,Miller W.MultiPipMaker:多个DNA序列的比较比对服务器。生物信息学的当前协议。威利父子公司,第10.4.1-10.4.14页。2010

Welch LR,Koehly LM,Elnitski L.人类DNA修复基因启动子中的共同调控基序。DNA修复/第4册,Inna Kruman(编辑),InTech出版社。2011

  • 出版物

    Waterston RH等人,包括Elnitski L.小鼠基因组的初始测序和比较分析。自然, 420: 520-562. 2002. [公共医学]

    Gibbs RA等人,包括Elnitski L.Brown Norway大鼠的基因组序列,为哺乳动物进化提供了见解。自然, 428: 493-521. 2004. [公共医学]

    国际鸡基因组联合会,Hillier,LW等,包括Elnitski L.序列和鸡基因组的比较分析,为脊椎动物进化提供了独特的视角。鸡基因组的序列和比较分析为脊椎动物进化提供了独特的视角。自然, 432(7018):695-716. 2004. [公共医学]

    ENCODE项目联盟。ENCODE(DNA元素百科全书)项目。科学类, 306:636-640. 2004. [公共医学]

    Giardine,B.,Riemer,C.,Hardison,R.C.,Burhans,R.,Elnitski,L.,Shah,P.,Zhang,Y.,Blankenberg,D.,Albert,I.,Taylor,J.,Miller,W.,Kent,W.J.,Nekrutenko,A.Galaxy:交互式大规模基因组分析平台。基因组研究, 15:1451-5. 2005. [公共医学]

    Elnitski,L.,Jin,V.X.,Farnham,P.J.,Jones,S.J.定位哺乳动物转录因子结合位点:计算和实验技术综述。基因组研究, 16:1455-1464. 2006. [公共医学]

    Petrykowska,H.M,Vockley,C.M.和Elnitski,L.大鼠体内沉默剂和增强子阻滞剂的检测和表征CFTR公司轨迹。基因组研究, 18(8):1238-46. 2008. [公共医学]

    Elsik CG等人,包括Elnitski L.牛磺酸牛的基因组序列:反刍动物生物学和进化的窗口。科学,第324页:第522-528页。2009年[公共医学]

    Piontkivska H,Yang MQ,Larkin DM,Lewin HA,Reecy J,Elnitski L.双向启动子的交叉特异性映射能够预测未注释的5'UTR并鉴定物种特异性转录物。BMC基因组学, 10:189. 2009年[公共医学]

    牛基因组测序和分析协会、Elsik CG、Tellam RL、Worley KC、Gibbs RA、Muzny DM、Weinstock GM、Adelson DL、Eichler EE、Elnitski L等。牛磺酸牛的基因组序列:反刍动物生物学和进化的窗口。科学类, 324:522-8. 2009年[公共医学]

    Woolfe A、Mullikin JC、Elnitski L.定义调控剪接的外显子变体的基因组特征。基因组生物学,11(2):R20。2010. [公共医学]

    Kolbe DL,DeLoia JA,Porter-Gill P,Strange M,Guirguis A,Krivak TC,Brody LC,Elnitski L.原发性上皮性卵巢癌和卵巢子宫内膜转移瘤中位点特异性DNA甲基化模式的基因组分析。公共科学图书馆,7:e32941。2012. [公共医学]

    Scott,A,Petrykowska HM,Gotea V,Hefferon T,Elnitski L.预测影响剪接的同义替换的功能分析CFTR公司基因。J.囊性纤维化, 11:511-517. (2012年4月至6月下载量最大的前25篇论文。)2012. [公共医学]

    ENCODE项目联盟,包括Elnitski L.人类基因组中DNA元素的综合百科全书。自然489: 57-74. 2012. [公共医学]

    Laflamem K,Owen AN,Devlin EE,Yang MQ,Wong C,Steiner LA,Garrett LJ,Elnitski L,Gallagher PG,Bodine DM。人类锚蛋白基因(ANK-1)启动子内一个新的顺式调节区的功能分析。分子细胞生物学, 30:3493-502. 2010. [公共医学]

    ENCODE项目联盟等,包括Elnitski,L.DNA元素百科全书(ENCODE)用户指南。公共科学图书馆生物,9:e1001046。2011. [公共医学]

    Gotea V、Petrykowska HM、Elnitski L.双向启动子是物种特异转录物出现的重要驱动因素。公共科学图书馆一号,8:e57323。2013. [公共医学]

    Parker SCJ、Prickett TD Dutton Regester K、Stitzel ML、Lin JC、Davis S、Simhadri VL、Jha S、Katagiri N、Gotea V、Teer JK、Xiaomu W、Morken MA、Bhanot UK、NISC比较测序程序、Chen G、Elnitski LL、Davies MA、Gershenwald JE、Carter H、Karchin R、Robinson W、Robinson S、Rosenberg SA、Francis S.Collins FS、Parmigiani G、Komar AA、,Kimchi-Sarfaty C、Hayward N、Margulies EH和Samuels Y。全基因组测序确定了黑色素瘤中反复发生的功能性同义突变。国家科学院程序, 110:13481-6. 2013. [PUbMed公司]

    Sánchez-Vega F、Gotea V、Petrykowska HM、Margolin G、Krivak TC、DeLoia JA、Bell DW、Elnitski L.(2013)在广泛的人类实体上皮肿瘤和癌细胞系中,ZNF154、CASP8和VHL启动子中DNA甲基化的复发模式。表观遗传学, 8:1355-72. [公共医学]

    Kellis M、Wold B、Snyder议员、Bernstein BE、Kundaje A、Marinov GK、Ward LD、Birney E、Crawford GE、Dekker J、Dunham I、Elnitski LL、Farnham PJ、Feingold EA、Gerstein M、Giddings MC、Gilbert DM、Gingeras TR、Green ED、Guigo R、Hubbard T、Kent J、Lieb JD、Myers RM、Pazin MJ、Ren B、Stamatoyannopoulos JA、Weng Z、White KP、Hardison RC。定义人类基因组中的功能性DNA元素。国家科学院程序, 111:6131-8. 2014. [公共医学]

    Gotea V,Elnitski L.通过弱到强突变热点确定受GC-biased基因转换影响的区域。基因组学, 103(5-6):349-56. 2014. [公共医学]

    Gotea V、Gartner JJ、Qutob N、Elnitski L、Samuels Y。黑色素瘤和其他癌症中体细胞同义突变的功能相关性。色素细胞黑素瘤研究,doi:10.1111/pcmr.12413。2015. [公共医学]

    Sánchez-Vega F,Gotea V,Margolin G,Elnitski L.(2015)人类实体上皮性肿瘤和癌细胞系的泛癌分层揭示了CpG岛甲基化表型的共性和组织特异性特征。表观遗传学染色质, 8:14. 2015. [公共医学]

    Margolin G,Petrykowska HM,Jameel N,Bell DW,Young AC,Elnitski L.使用基于血液的诊断开发的硅胶模型对ZNF154作为泛癌基因座的DNA超甲基化进行稳健检测。J Mol诊断, (15)00274-3. 2016. [公共医学]

    书籍章节

    Yang,M.Q.和Elnitski,L.L.人类基因组双向启动子的特征表征和测试——在人类基因组研究中的意义和应用。中的第19章生物信息学中的机器学习,张燕青(Yan-Qing Zhang)和贾加特·拉贾帕克塞(Jagath C.Rajapakse),主编约翰·威利(John Wiley&Sons),2007年。

    Yang,M.Q.和Elnitski,L.人类基因组双向启动子的计算研究。生物信息学研究与应用,Zhang,Y.,编辑,海德堡,第361-371页。2007

    Yang,M.Q.和Elnitski,L.《双向启动子的正畸学》使我们能够使用多类预测因子来区分人类基因组中的功能元件。2007年生物信息学和计算生物学国际会议论文集。Arabnia,Yang,M.Q.和Yang,J.Y.编辑,第218-228页。2007

    Yang,M.Q.,Taylor,J.和Elnitski,L.脊椎动物中直系双向启动子的严格定位。生物信息学和生物科学计算学报。BMC生物信息学补充版。第115-122页。2008

    Elnitski L、Burhans R、Riemer C、Hardison R、Miller W.MultiPipMaker:多DNA序列的比较比对服务器。生物信息学的当前协议。威利父子公司,第10.4.1-10.4.14页。2010

    Welch LR,Koehly LM,Elnitski L.人类DNA修复基因启动子中的共同调控基序。DNA修复/第4册,Inna Kruman(编辑),InTech出版社。2011

基因组功能分析科工作人员

Valer Gotea公司
Valer Gotea博士。
  • 职员科学家
  • 基因组功能分析科
萨拉·邦·克里斯滕森
Sara Bang Christensen博士。
  • 博士后研究员
  • 基因组功能分析科
苏西尔·贾斯瓦尔
Sushil K.Jaiswal博士。
  • 博士后研究员
  • 基因组功能分析科

上次更新时间:2023年11月8日