与外部分类系统的交叉引用

许多基因本体术语与许多外部词汇表中的相应概念相互引用，包括酶委员会编号、KEGG、反应组途径和维基百科。请报告任何错误或建议替代方案GO帮助台.

使用和引用交叉引用和映射

如果您在出版物或演示文稿中使用了映射，请确保您引用了GO知识库和映射的来源（详细信息如下）。请参阅GO引文指南引用GO知识库。

交叉引用格式

标题描述生成日期和使用的GO版本，例如：

! 2018-10-05T08:40Z从本体“go”生成，数据版本：“releases/YYYY-MM-DD”
每个交叉引用都在不同的行上，格式如下：

数据库：术语标识符（id/name）>GO:GO术语名称；执行：id

例如：

EC:1.1.1.1>GO：乙醇脱氢酶（NAD）活性；去：0004022
请注意，GO映射的交叉引用可以是多对多的。

映射文件目录

可在此处直接访问映射文件目录：https://current.geneontology.org/ontology/external2go/.

GO财团维护的交叉引用

这些交互参考由GO编辑器维护。请在中报告问题GO GitHub跟踪器.

映射	映射的实体	直接访问映射文件
EC：酶委员会	EC编号	ec2go公司
EAWAG-BBD公司	酶	um-bbd_ezymeid2go
EAWAG-BBD公司	路径	um-bbd路径id2go
EAWAG-BBD公司	反应	um-bbd反应2go
KEGG：京都基因和基因组百科全书	途径和反应	kegg_动作2go
MetaCyc公司	途径和反应	元cy2go
反应途径	事件和催化剂活动	反应2go
瑞亚	生化反应	瑞格牌手表

外部团体保持的交叉引用

注：这些文件在两个月内重新生成UniProtKB-GOA版本。请在中报告问题GO GitHub跟踪器.

映射	直接访问映射文件
HAMAP：微生物蛋白质组家族的高质量自动化和手动注释由UniProtKB团队 PMID:18849571	哈马普2go
InterPro-蛋白质家族、结构域和功能位点由InterPro公司团队 PMID:18940856	interpro2go公司
Pfam域由InterPro公司团队 PMID:18940856	pfam2go型
PIRSF-蛋白质超家族由InterPro公司团队 PMID:18940856	pirsf2go公司
打印-域由InterPro公司团队 PMID:18940856	pirsf2go公司
ProDom-域由InterPro公司团队 PMID:18940856	prodom2go公司
ProSite-域由InterPro公司团队电话：18940856	散文2go
Rfam-RNA家族	rfam2go公司
SMART-域由InterPro公司团队项目管理标识号：29040681	智能2go
UniProt关键字将GO术语映射到UniProt知识库关键字。由UniProt公司和UniProtKB GOA公司电话：25378336	uniprotkb_kw2go
UniProt亚细胞定位 GO术语到UniProt亚细胞定位术语的映射。由UniProt公司和UniProtKB-GOA公司项目管理标识号：25378336	uniprotkb_sl2go
UniRules公司 GO术语到UniProt亚细胞定位术语的映射。由UniProt公司团队	唯一2go

存档的交互参考

映射	上次更新时间	直接访问映射文件
COG-功能类别同源群簇（COG）由Michael Ashburner和Jane Lomax建造	2004年6月	齿轮2go
EGAD：表达基因解剖学数据库由Michael Ashburner建造	2000年10月	egad2go公司
GenProtEC：大肠杆菌基因组和蛋白质组功能类别由Heather Butler和Michael Ashburner建造	2000年12月	发电机保护2go
TIGRFAM:JCVI蛋白家族 JCVI（TIGRFAM）蛋白家族由Michelle Gwinn和其他TIGR员工建造	不适用	老虎枪2go
JCVI角色 JCVI角色由Michael Ashburner建造	2004年1月	老虎2
MIPS FunCat公司 MIPS功能目录（FunCat）由Michael Ashburner和Midori Harris建造	不适用	mips2go
MultiFun单元功能分配模式分类由Michael Ashburner、Jane Lomax和Margrethe Hauge Serres建造	2005年12月	多联2go