可视化反应体生物途径并与之交互
合并路径标识符映射,过度表达与表达分析
旨在发现与癌症和其他类型疾病相关的途径和网络模式
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[2024年4月15日]在《毒理学与应用药理学》12月刊上,Zhang等人(2023)使用R包,ReactomePA(于和,2016)为了确定对第二种呼吸毒物尼古丁引起的镍诱导的转录记忆变化的丰富反应途径。尼古丁暴露上调了先前暴露于镍的细胞中的一个特定基因亚群,确定了一种强烈的激活干扰素信号是许多慢性肺部疾病相关炎症的驱动因素。
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Reactome是一个免费、开源、经过管理和同行评审的路径数据库。我们的目标是为路径知识的可视化、解释和分析提供直观的生物信息学工具,以支持基础研究、基因组分析、建模、系统生物学和教育。
Reactome的开发得到了美国国立卫生研究院(U24 HG012198)和欧洲分子生物学实验室的资助。
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