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肽结合蛋白

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4个月

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			蛋白质链

					公元87年。

			配体

					ARG-HIS-PRO-THR公司- 塞尔维亚语


					PRO-THR-SER-ILE公司- 国际照明局


					高尔夫球 ×3

			水域 ×178

PDB id：

4个月

链接

姓名：

肽结合蛋白

标题：

与肽h-ical36（ansrhptsii）结合的Cftr相关配体（cal）pdz结构域

结构：

高尔基体相关的pdz和线圈-线圈基序蛋白。链：a，b.片段：cal pdz域。工程设计：是的。H-ical36肽。链条：c、d。工程设计：是

资料来源：

智人。人类。有机体_出租车：9606。基因：gopc，cal，figure表达于：大肠杆菌。表达式_系统_最大值：469008。合成：是

分辨率：

1.47Å

R系数：

0.177

无R：

0.204

作者：

J.F.Amacher、D.R.Madden

密钥参考：

J.F.阿马赫等人。(2014).立体化学偏好调节结合CFTR的五个PDZ结构域之间的亲和力和选择性：比较结构和序列分析。结构,22,82-93.PubMed编号：24210758 内政部：2016年10月10日/j.str.2013.09.019

日期：

2013年3月18日

发布日期：

2014年1月22日

PROCHECK检查

	标题

	参考文献

蛋白质链

^?

Q9HD26型 （GOPC_HUMAN）-智人高尔基体相关PDZ和线圈基序蛋白

序号：
结构：公元462年。
公元87年。

密钥： PfamA域二级结构 CATH域

DOI编号：2016年10月10日/j.str.2013.09.019 结构 22:82-93(2014)

PubMed编号：24210758

立体化学偏好调节结合CFTR的五个PDZ结构域之间的亲和力和选择性：比较结构和序列分析。

J.F.阿马赫， P.R.库欣， L.Brooks， P.Boisguerin， D.R.马登。

摘要

PDZ结构域相互作用参与信号传导和贩运途径协调关键的细胞过程。基于对齐的PDZ绑定图案在肽的某些位置确定少数最有利的残基骨干。然而，结合CAL（CFTR相关配体）PDZ的序列域只揭示了一个退化的基序，它过度预测了高亲和力相互作用物。在这里，我们结合了扩展的肽阵列基序用生化技术分析表明，非基序“调节剂”残基影响CAL结合。结晶学13个CAL的结构：肽复合物显示出明确但可调节的非基序位置的立体化学环境，反映在多序列替代阵列所揭示的调制器偏好。这些偏好有助于识别高亲和力CAL结合序列和差异影响CAL和NHERF PDZ结合。因此，它们也有帮助确定管制贩运的PDZ域网络的特殊性CFTR在心尖膜的表达。