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关于ToL导航图片

我们收到了很多关于生命之树图片的查询我们的主页。值得注意的是图片是为了帮助ToL网站的访问者快速导航到一些主要生物类群的页面。为了服务这个目的,我们必须使用一个大大简化的树表示生命的意义。

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生命之树图片©2007生命之树网络项目。玫瑰图©1999尼克·库赞科。环节虫图片©2001年格雷格·劳斯。如果您想使用此图像,看见在下面.

以下是一些解释图像的指南,解释科学事实在图像中表示,以及应该得出什么结论不能从中吸取教训。

地球上的生命有着共同的遗传历史和复杂的起源
我们的图片显示地球上所有生物都有一个共同的基因历史。生物世系以分支多样化为代表当树从底部生长时(代表生命的起源)到尖端(代表当今生活的物种)。生命的早期历史被故意掩盖。最近证据表明,不是从单一的“原始细胞”,可能是第一批在环境中进化的生物体以结构松散的细胞组织和频繁的个体间遗传物质的交换(参见生命的根源是复杂的). 即使在区分之后遗传谱系建立,遗传物质在远缘生物(也称为水平或横向基因转移)继续,这在我们的照片中有所体现通过连接生命之树遥远枝条的线条。水平时基因转移显然是基因组进化的一个重要特征在真核生物中,这一过程的重要性进化就不那么清晰了。然而,人们普遍认为真核生物获得了重要的细胞器,如线粒体和叶绿体吞噬并保留某些共生细菌。
不要对不同种类的生物体。
虽然我们的照片暗示了早期生活的多样化我们今天看到的数以百万计的不同生物,它没有提供相对多样性的良好表现(即物种数量)不同组的。如果这是我们的目标,图像就会以节肢动物分支为主。考虑到最近群体中有待描述物种数量的预测像细菌、原生生物、真菌和线虫一样,这些分支会用脊椎动物和植物填充了图表的其余部分几乎看不见。当然,这样的图像不会很有用作为ToL web项目的导航工具。因此,我们创建了更能代表人们兴趣的图表以及他们对ToL项目的报道。如果你对这种功利主义的自由感到不舒服,想象一下从聚焦角度观察三维图像一些不太显眼的类群,如植物和脊椎动物,例如,大多数真细菌多样性是隐藏的在背景中。
不要将相对分支长度解释为指示器进化“进步”的水平。
还需要注意的是图片下方的真细菌和太古宙分支没有意味着这些生物在任何方面都更“原始”或“古代”。我们将这些分支缩短并降级将它们移到图像的角落,以便为在树的其他部分展示大型、艳丽的生物。全部当然,树梢的生物中有许多现在还活着因此,应以相同的时间级别显示。此外,任何现存的两种生物,例如真杆菌和青蛙,共同祖先。只是它们的进化史他们进入了截然不同的方向。
今天活着的生物不代表任何生物的祖先其他生物。
出于实际原因,我们放置了一条现存(活的)环节虫就在我们树的中间。当然,这条蠕虫不是故意的代表树上较高层次生物的祖先;相反,它是动物的代表。最多节肢动物和脊椎动物最近的共同祖先是某种关于蠕虫,但它肯定不是环节动物;事实上,没有人知道这个生物可能长什么样。

目前,人们对开发视觉表现感兴趣生命之树作为一个整体。然而,总结整个树在一张图片中是相当具有挑战性的,因为有大量物种(已描述约180万种,但已知更多存在),许多群体之间的关系尚待建立断然的。看看丽贝卡·沙普利的作品可视化生命之树了解当前制作表示的工作普通观众都能看到的生命之树。也,如果你正在寻找生命之树的挂图,大卫·M。Hillis、Derrick Zwickl和Robin Gutell(德克萨斯大学)生成一个pdf文件,其中包含一棵树的图像(基于rRNA序列数据),包括约3000种物种。你可以得到一份文件来自希利斯&Bull Lab下载页面还有一张高分辨率的图片基于全基因组分析的树(Ciccarelli&al.2006)可从海德堡欧洲分子生物学实验室获得完整的系统发育基因组:数据仓库.

生命之树导航图片根据知识共享署名-无衍生作品许可证-3.0版.你可以下载较大的JPEG版本或a高的分辨率TIFF版本文件的。感谢Nick Kurzenko ,格雷格劳斯 、和这个美国。美国鱼类和野生动物局用于制作可用图像这张图中的生物。

请注意您不能修改ToL导航形象.你只能按原样使用。但是,如果要创建生命树图形,使用您自己的有机体图像,您可以使用基本树图像.

工具书类

Ciccarelli,F.D.,T.Doerks,C.von Mering,C.J.Creevey,B.Snel和P.Bork,2006年。实现高分辨率树的自动重建生命的意义。《科学》311(5765):1283-1287。

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