调节性膜内蛋白水解(RIP),其中靶膜蛋白在跨膜区域内特异性裂解,现在被认为是细胞信号的一种形式。由于蛋白质水解,目标膜蛋白的可溶性部分被释放出来作为信号分子。RIP是由膜内剥离蛋白酶催化的,根据催化机制,这些蛋白酶现在被分为2位点蛋白酶、菱形蛋白酶和γ-分泌酶/SPP家族。大肠杆菌具有一个位点2蛋白酶同源物RseP,它与细胞质外应激反应有关。RseP裂解跨膜抗σE蛋白RseA,从膜上释放σE,膜锚定蛋白酶DegS截断RseA的C末端周质部分,触发RseP的作用。因此,RseP感应RseA的DegS裂解一定有某种机制。RseP在周质区具有两个串联排列的PDZ结构域(PDZ串联),这两个结构域被认为参与了卵裂的调控。虽然PDZ结构域通常识别配体的C末端序列,但之前的大多数研究表明,RseP-PDZ结构区参与抑制RseA的膜内裂解。在本研究中,我们通过X射线晶体学和SAXS确定了PDZ串联的3D结构,并表明两个PDZ畴以整体“蛤状”结构排列,构成“口袋状”结构。序列分析表明,PDZ串联将正好位于膜内螯合的活性中心上方。此外,化学改性表明,在全长RseP中,笨重的试剂无法进入袋的内部。综上所述,我们提出了一个建议,即RseP通过PDZ串联的空间尺寸排除机制,而不是通过识别RseA的特定序列/基序,将截断的RseA调节到活性中心。