NeedlemanUnsch相似性

NeedlemanWunsch相似性[u个,v（v）]

给出了一个代表Needleman的数字–字符串、载体或生物分子序列之间的Wunsch相似性u个和v（v）.

详细信息和选项

  • NeedlemanWunsch相似性[u个,v（v）]在以下元素之间找到最佳全局对齐u个和v（v），并返回单元素匹配的数量。
  • 对于字符串，设置选项忽略案例->真的制造NeedlemanWunsch相似性将小写字母和大写字母视为等效字母。
  • 使用默认设置相似性规则->自动，两个字符之间的每个匹配都有助于相似度总得分，而每一个不匹配、插入或删除都有助于.
  • 选项差距惩罚指定从任何插入或删除操作的相似性得分中减去的额外成本。

示例

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基本示例  (3)

尼德曼–两个字符串之间的Wunsch相似性：

尼德曼–两个向量之间的Wunsch相似性：

尼德曼–两个生物分子序列之间的Wunsch相似性：

选项  (1)

相似性规则  (1)

这个“相似退化基”设置允许在生物分子序列中匹配退化项时具有更高的相似性：

Wolfram Research（2008），NeedlemanWunsch相似性，Wolfram语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html（2020年更新）。

文本

Wolfram Research（2008），NeedlemanWunsch相似性，Wolfram语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html（2020年更新）。

CMS公司

沃尔夫拉姆语言。2008年，“NeedlemanWunsch相似性”，Wolfram语言与系统文档中心。Wolfram研究。上次修改时间2020年。https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html。

亚太地区

沃尔夫拉姆语言。(2008). NeedlemanWunsch相似性。Wolfram语言与系统文档中心。检索自https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html

BibTeX公司

@misc｛reference.wolfram_2024_needlemanunschsimilarity，author=“wolfram Research”，title=“｛NeedlemanUnshSimilarity｝”，year=“2020”，howpublished=“\url｛https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanUnshSimilarity.html｝”，note=[访问时间：2024年6月20日]}

BibLaTeX公司

@online{reference.wolfram_2024_needlemanwunschsimilarity，organization={wolfram Research}，title={needlemanwunschsimilarity}，year={2020年}，url={https://reference.jolfram.com/language/ref/NeedlemanWunscheSimilarity.html}，note=[访问时间：2024年6月20日]}