传记
伯纳德·莫雷特出生于瑞士维维学士学位拉丁语希腊语和拉丁语数学,然后在EPFL获得电气工程文凭。在为Omega和Swiss Timing开发运动应用实时操作系统工作了两年后,他前往美国。1980年,他获得田纳西州大学电气工程博士学位,并加入了计算机科学系秋季在新墨西哥大学(UNM)学习。1991年至1993年,他担任系主任,并于2006年夏天退休,加入EPFL计算机与通信科学学院。(你可以在他的(存档)上阅读他在UNM的工作个人的和实验室UNM的网页。)他被任命为瑞士生物信息学研究所系统发育学小组组长(SIB公司). 从2009年到退休,他还负责计算机科学理学学士和硕士课程以及教育副院长。他创建了ACM实验算法杂志(JEA)担任编辑长7年;他还帮助找到了IEEE/ACM计算生物学和生物信息学汇刊(TCBB)2008年之前,他一直担任副编辑。他创办了年度生物信息学算法研讨会并担任其指导委员会主席,他是算法工程与实验研讨会(ALENEX)直到2008年夏天,他一直担任生物数据管理和分析(脑脊髓炎)美国国立卫生研究院(NIH)研究部;现在他是NIH评审员学院的特许会员。他领导了一个由50多名生物学家、计算机科学家和数学家组成的团队CIPRES公司(系统发育研究的网络基础设施)项目,由美国国家科学基金会(NSF)在5年内出资1200万美元。在美国国家科学基金会、阿尔弗雷德·斯隆基金会、IBM公司、美国国家卫生研究院、瑞士国家科学基金和SystemsX.ch的资助下,他发表了近150篇计算生物学论文国际计算生物学学会.他的厄德斯数到2020年,他的h指数为48。
过去的Postdocs
在EPFL:Daniel Doerr(博士后,U.Bielefeld)、Wei Xu(圣迭戈Illumina研究员)、,亚历山大·斯塔马塔基斯(卡尔斯鲁厄技术学院和海德堡理论研究学院教授)在UNM: 坦尼亚·伯格尔·沃尔夫(U.Illinois-Chicago教授),蒂凡尼·威廉姆斯(德克萨斯州农工大学助理教授)
过去的博士生
在EPFL:
Min Ye(柏林迅达股份公司高级数据科学家)、Mingfu Shao(宾夕法尼亚州立大学助理教授)、Cristina Ghiurcuta(苏黎世Highpoint Solutions高级副顾问)、Nishanth Nair(马里兰州国立卫生研究院博士后)、Yu Lin(澳大利亚国立大学助理教授。)、Yann Christina(日内瓦大学临床生物信息学家)、Vaibhav Rajan(国立卫生研究所助理教授。新加坡)、张秀伟(佐治亚理工学院副教授)、克里斯特·斯文森(美国蒙彼利埃大学CNRS高级组长)
在UNM:
Nicholas Pattengale(杰出MTS,Sandia National Laboratories)、Monique Morin(美国新墨西哥州洛斯阿拉莫斯分校教授)、Michael Collins(MTS,桑迪亚国家实验室)、Jijun Tang(美国南卡罗来纳州和中国天津大学教授)、Srinivas Doddi、Ali Boroujerdi(退职)、Ali Kooshesh(美国索诺玛州教授)、Mark Hoover、Chea-Tin Tseng(退职人员)
过去的MS和夏季@EPFL学生
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教学
我们主要教授计算生物学和第一门研究生算法课程。这些课程的材料(光标、参考资料、课程笔记、家庭作业和带解决方案表的测试)可在LCBB网页下获得,使用的URL格式为
http://lcbb.epfl.ch/algsxx/高级算法课程,以及
http://lcbb.epfl.ch/compbioxx/对于计算分子生物学课程,
其中xx是一年(alg为09、10、11、12、13、14和16,compbio为07、08、09、11、12,14和16)。
研究兴趣
我们实验室的主要研究兴趣是算法设计和高性能算法工程,特别是当它们应用于计算分子生物学和生物信息学时。当前项目包括:- 基因组进化模型及其用于系统发育重建和比较基因组学的算法。
- 网状进化模型及其用于系统发育重建的算法。
- 大规模(生命树)系统发育重建的快速准确算法。
- 研究监管网络演变的模型和算法。
- 利用系统发育关系来改进对其他数据的推断。