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“我们的目标是提供一个论坛,用于快速发布低温EM领域的重要结果。我们寻求发布方法学进展以及使用低温EM和相关技术产生的新的生物学相关发现。”
Sriram Subramaniam教授
低温电子显微镜的主编辑器
S.Subramaniam公司
加拿大不列颠哥伦比亚大学医学院,温哥华,BC V6T 1Z3(电子邮件:
sriram.subramaniam@ubc.ca
)
联合编辑
E.布利特
美国马萨诸塞州波士顿市奥尔巴尼街700号波士顿大学医学院生理与生物物理系,邮编:02118-2526(电子邮件:
bulitt@bu.edu
)
杜尔布兰特
德国法兰克福马克斯·冯·劳厄街3号马克斯·普朗克生物物理研究所结构生物学系,邮编:60438(电子邮件:
werner.kuehlbrandt@biophys.mpg.de
)
S.Raunser公司
德国多特蒙德,奥托·哈恩-Str.1144227,马克斯·普朗克分子生理研究所,结构生物化学系(电子邮件:
stefan.raunser@mpi-dortmund.mpg.de
)
F.太阳
中国科学院生物物理研究所,中国科学院大学生命科学学院,中国北京朝阳区大屯路15号,邮编:100101(电子邮件:
feisun@ibp.ac.cn
)
本主题领域的文章
关于低温EM数据存档和验证的社区建议。
G.J.克莱维特
,
P.D.亚当斯
,
S.J.屠夫
,
C.L.劳森
,
A.罗侯
,
P.B.罗森塔尔
,
S.苏布拉马尼亚姆
,
M.托夫
,
S.阿博特
,
P.R.鲍德温
,
J.M.贝里斯福德
,
G.布里科内
,
P.Choudhary先生
,
T.I.克罗尔
,
R.丹涅夫
,
S.J.甘尼桑
,
T.格兰特
,
A.古特马纳斯
,
R.亨德森
,
J.B.海曼
,
J.T.惠斯科宁
,
A.伊斯特拉特
,
T.加藤
,
G.C.着陆器
,
S.-M.洛克
,
S.J.卢特克
,
G.N.穆尔舒多夫
,
R.Pye公司
,
G.D.Pintile公司
,
J.S.理查森
,
C.萨克斯
,
O.萨利赫
,
S.H.W.Scheres公司
,
G.F.施罗德
,
C.O.S.Sorzano公司
,
S.M.斯塔格
,
Z.Wang(王)
,
R.Warshamanage公司
,
J.D.韦斯特布鲁克
,
M.D.Winn博士
,
J.Y.杨
,
S.K.伯利
,
J.C.霍赫
,
G.库里苏
,
K.莫里斯
,
A.帕特沃丹
&
S.Velankar公司
(2024).
IUCrJ大学
11
,第140-151页。
C-SPAM:一种具有光激活分子的开放源代码时间分辨样品玻璃化装置。
A.蒙塔尼奥·罗梅罗
,
C.博宁
&
E.C.特沃米
(2024).
IUCrJ大学
11
, 16-22.
C2020马来西亚令吉
:对的改进
西姆迪普
和MRC图像处理程序。
J.M.肖特
,
C.M.帕尔默
,
T.伯恩利
,
M.D.Winn博士
,
Q.张
,
B.V.文卡塔兰·普拉萨德
,
S.Chen先生
,
R.A.克劳瑟
,
P.N.T.安文
&
R.亨德森
(2023).
IUCrJ大学
10
, 579-583.
`Cryo-EM’:电子冷冻显微镜、冷冻电子显微镜或其他?。
R.亨德森
&
S.哈斯奈
(2023).
IUCrJ大学
10
, 519-520.
在常规和扫描透射电子显微镜下,冰包蛋白的动态散射。
M.L.莱德尔
,
C.萨克斯
&
K.Müller-Caspary公司
(2023).
IUCrJ大学
10
, 475-486.
学习使用
托勒密
.
P.T.金
,
A.J.诺贝尔
,
A.程
&
T.贝普勒
(2023).
IUCrJ大学
10
, 90-102.
全自动多栅极冷冻电镜筛查
智能Leginon
.
A.程
,
P.T.金
,
H.Kuang先生
,
J.H.门德斯
,
蔡永道(E.Y.D.Chua)
,
K.马鲁西
,
H.魏
,
A.锯
,
M.F.阿拉贡
,
V.塞族诺夫斯基
,
K.内塞鲁
,
E.T.工程
,
C.S.波特
,
B.卡拉格
,
T.贝普勒
&
A.J.诺贝尔
(2023).
IUCrJ大学
10
, 77-89.
复合物III中Rieske铁硫蛋白的构象异质性分析
2
通过低温电子显微镜。
J.-P.威弗瑞
&
杜尔布兰特
(2023).
IUCrJ大学
10
, 27-37.
实现单粒子低温电子显微镜数据采集的自动化。
C.迪尼曼
(2023).
IUCrJ大学
10
, 4-5.
酵母复合物III中Rieske铁硫蛋白的结构异质性
2
.
K.R.Vinothkumar公司
(2023).
IUCrJ大学
10
, 1-3.
低温电子显微镜和结晶学中非均匀分辨率图的分析建模。
A.乌尔珠姆塞夫
&
V.Y.Lunin先生
(2022).
IUCrJ大学
9
, 728-734.
通过局部分辨率的分析建模,在实际空间细化和评估的计算图和实验图的比较中产生涟漪。
I.乌森
(2022).
IUCrJ大学
9
, 718-719.
ACA 2022的Cryo-EM。
S.苏布拉马尼亚姆
,
A.科特查
&
J.H.戴维斯
(2022).
IUCrJ大学
9
第713-714页。
通过结合大分子的先验知识和图像处理工具,低温电子显微镜具有更高的分辨率。
E.拉米雷斯-阿波尔特拉
,
J.M.卡拉佐
&
C.O.S.Sorzano公司
(2022).
IUCrJ大学
9
, 632-638.
在200keV低温TEM上高速高分辨率数据采集。
J.V.佩克
,
J.F.费伊
&
J.D.施特劳斯
(2022).
IUCrJ大学
9
, 243-252.
通过低温电子显微镜和X射线结晶学测定的蛋白质结构中侧链分散度的比较。
A.拉维库马尔
,
M.N.Gopnarayan先生
,
S.Subramaniam公司
&
N.斯里尼瓦桑
(2022).
IUCrJ大学
9
, 98-103.
查找我的序列
:一种基于神经网络的方法,用于在X射线晶体学和冷冻电镜中识别未知蛋白质。
G.乔诺夫斯基
,
A.J.辛普金
,
D.A.莱昂纳多
,
西弗特·达维拉
,
D.E.维瓦斯·鲁伊斯
,
R.M.基根
&
D.J.里格登
(2022).
IUCrJ大学
9
, 86-97.
TRPV1和Piezo:2021年诺贝尔生理学或医学奖。
Y.Cheng先生
(2022).
IUCrJ大学
9
, 4-5.
用3D Zernike多项式逼近变形场,以分析生物大分子的连续不均匀性。
D.埃雷罗斯
,
R.R.莱德曼
,
J.克里格
,
A.吉梅内斯·莫雷诺
,
马丁内斯
,
D.米什卡
,
D.斯特雷拉克
,
J.菲利波维奇
,
I.巴哈尔
,
J.M.卡拉佐
&
C.O.S.桑切斯
(2021)。
IUCrJ大学
8
, 992-1005.
使用多层波传播对非晶辐射敏感样品进行低温TEM模拟。
B.希姆斯
&
N.格里戈里夫
(2021)。
IUCrJ大学
8
, 943-953.
沸腾氮气中玻璃化样品的高分辨率单粒子冷冻-EM。
T.Engstrom公司
,
J.A.克林格
,
K.A.Spoth公司
,
O.B.克拉克
,
D.S.Closs公司
,
R.杰恩
,
B.A.阿普克
&
R.E.索恩
(2021)。
IUCrJ大学
8
, 867-877.
耐热细菌纳米复合物的低温电磁结构。
T.威瑞曼
&
N.图尔
(2021)。
IUCrJ大学
8
, 342-350.
嗜热封装蛋白的低温电磁结构为其功能提供了线索。
J.R.卡斯顿
(2021)。
IUCrJ大学
8
, 333-334.
脱玻化减少了低温电子显微镜中束流诱导的运动。
J.-P.威弗瑞
,
D.J.Mills公司
&
杜尔布兰特
(2021)。
IUCrJ大学
8
, 186-194.
在低温电子显微镜结构测定中利用生物大分子的先验知识。
D.基马尼乌斯
,
G.扎克特
,
T.纳卡内
,
J.阿德勒
,
S.Lunz公司
,
C.-B.舍恩利布
,
O.Öktem公司
&
S.H.W.Scheres公司
(2021)。
IUCrJ大学
8
,60-75。
使用200度光束图像偏移的高分辨率低温电子显微镜
keV。
J.N.现金
,
S.卡恩斯
,
Y.Li(李彦宏)
&
M.A.Cianfrocco先生
(2020).
IUCrJ大学
7
, 1179-1187.
利用卷积神经网络提高低温电子显微镜图像的信噪比并生成对比度。
E.帕洛夫卡
,
D.阿萨诺
,
M.G.坎贝尔
,
Z.Yu先生
&
Y.Cheng先生
(2020).
IUCrJ大学
7
, 1142-1150.
SARS-CoV-2尖峰预融合结构的连续灵活性分析。
R.梅勒罗
,
C.O.S.Sorzano公司
,
B.福斯特
,
J.-L.维拉斯
,
马丁内斯
,
R.马拉比尼
,
E.拉米雷斯-阿波尔特拉
,
R.桑切斯·加西亚
,
D.埃雷罗斯
,
L.del Caño村
,
P.洛萨纳
,
Y.C.丰塞卡-雷纳
,
P.科内萨
,
D.包装
,
P.查孔
,
J.S.麦克莱伦
,
H.D.塔加雷
&
J.-M.卡拉佐
(2020).
IUCrJ大学
7
, 1059-1069.
利用改进的傅里叶壳相关进行可靠的低温电磁分辨率估计。
P.A.Penczek先生
(2020).
IUCrJ大学
7
, 995-1008.
深度学习使冷冻电镜能够确定Fanconi贫血核心复合体的原子结构。
D.P.法雷尔
,
一、阿尼什琴科
,
S.沙克尔
,
A.劳科
,
洛杉矶帕斯莫尔
,
D.贝克
&
F.迪迈奥
(2020).
IUCrJ大学
7
, 881-892.
电子事件表示数据能够在充分保持空间和时间分辨率的情况下实现高效的低温电磁文件存储。
H.郭
,
E.弗兰肯
,
Y.邓
,
S.Benlekbir公司
,
G.辛格拉·莱兹卡诺
,
B.詹森
,
L.Yu先生
,
Z.A.里普斯坦
,
Y.Z.Tan先生
&
J.L.鲁宾斯坦
(2020).
IUCrJ大学
7
, 860-869.
胆碱能突触后膜的蛋白质-脂质结构。
N.安文
(2020).
IUCrJ大学
7
, 852-859.
电子接受电子事件表示的个别处理。
R.丹涅夫
(2020).
IUCrJ大学
7
, 780-781.
低温电子显微镜中粒子拾取的自我监督工作流程。
D.M.McSweeney博士
,
S.M.麦克斯韦
&
Q.刘
(2020).
IUCrJ大学
7
, 719-727.
评估JEOL CRYO ARM 300在多用户环境中的高通量自动单粒子低温电子显微镜。
M.鱼类
,
A.V.Shkumatov公司
,
A.Stroobants公司
&
R.G.埃弗雷莫夫
(2020).
IUCrJ大学
7
, 707-718.
α200β-半乳糖苷酶的1.8位拆分结构
kV CRYO ARM电子显微镜。
A.默克
,
T.福村
,
X.朱
,
J.E.达林
,
R.Grisshammer公司
,
J.奥格尼诺维奇
&
S.Subramaniam公司
(2020).
IUCrJ大学
7
, 639-643.
新型冠状病毒肺炎和冷冻电镜。
S.Subramaniam公司
(2020).
IUCrJ大学
7
, 575-576.
快速准确的离焦调制可提高低温电子显微镜实验的可调性。
R.丹涅夫
,
H.饭岛
,
M.松崎
&
S.Motoki公司
(2020).
IUCrJ大学
7
, 566-574.
由数字定义的纳米晶区域确定的原子结构。
M.加拉赫-琼斯
,
K.C.Bustillo公司
,
C.眼镜蛇
,
L.S.理查兹
,
J.西斯顿
,
S.李
,
A.M.小调
&
J.A.罗德里格斯
(2020).
IUCrJ大学
7
, 490-499.
间日疟原虫
人类己糖激酶具有相似的活性位点,但显示出不同的四级结构。
S.S.斯利瓦斯塔瓦
,
J.E.达林
,
J.苏亚迪
,
J.C.莫里斯
,
M.E.Drew先生
&
S.Subramaniam公司
(2020).
IUCrJ大学
7
, 453-461.
存在实质性像差的高分辨率冷冻电镜重建。
R.Bromberg公司
,
Y.Guo先生
,
D.博莱克
&
Z.奥特温诺夫斯基
(2020).
IUCrJ大学
7
,445-452。
低温电子显微术中束流诱导运动机制的假设。
R.E.索恩
(2020).
IUCrJ大学
7
, 416-421.
喹诺酮类依赖性一氧化氮还原酶的活性形式
脑膜炎奈瑟菌
是二聚体。
M.A.M.贾马利
,
C.C.戈帕拉辛根
,
R.M.约翰逊
,
T.托沙
,
K.穆拉莫托
,
S.P.Muench公司
,
S.V.Antonyuk公司
,
Y.Shiro先生
&
S.S.哈斯奈
(2020).
IUCrJ大学
7
, 404-415.
从低温电子显微镜数据集估计高阶像差和各向异性放大率
RELION公司
-3.1.
J.齐瓦诺夫
,
T.纳卡内
&
S.H.W.Scheres公司
(2020).
IUCrJ大学
7
, 253-267.
低温EM中的分辨率革命需要高质量的样品制备:酵母脂肪酸合成酶高分辨率图谱的快速管道。
M.Joppe先生
,
E.D'Impima公司
,
N.Salustros公司
,
K.S.Paithanar公司
,
J.冯克
,
M.格林格
&
杜尔布兰特
(2020).
IUCrJ大学
7
, 220-227.
液氮和液氦冷却的单粒子低温电子显微镜的比较研究。
O.Pfeil-Gardiner(奥菲尔·加德纳)
,
D.J.Mills公司
,
J.冯克
&
W.库尔布兰特
(2019).
IUCrJ大学
6
,1099-1105。
CryoEM为100
keV:一个示范和前景。
K.奈德诺娃
,
G.麦克马伦
,
M.J.皮特
,
Y.Lee先生
,
P.C.爱德华兹
,
S.Chen先生
,
E.莱希
,
S.Scotcher公司
,
R.亨德森
&
C.J.Russo公司
(2019).
IUCrJ大学
6
, 1086-1098.
DeepRes公司
:一种新的基于深度学习和方面的电子显微镜地图局部分辨率方法。
E.拉米雷斯-阿波尔特拉
,
J.莫塔
,
P.科内萨
,
J.M.卡拉佐
&
C.O.S.Sorzano公司
(2019).
IUCrJ大学
6
, 1054-1063.
用于时间分辨结构研究的低温电子显微镜网格制备装置。
D.Kontziampasis博士
,
D.P.Klebl博士
,
M.G.Iadanza先生
,
C.A.斯卡夫
,
F.科普夫
,
F.索伯特
,
D.C.F.蒙泰罗
,
M.特雷宾
,
S.P.Muench公司
&
H.D.白色
(2019).
IUCrJ大学
6
, 1024-1031.
下一代直接电子探测器的吞吐量和分辨率。
J.H.门德斯
,
A.梅赫拉尼
,
P.伦道夫
&
S.斯塔格
(2019).
IUCrJ大学
6
,第1007-1013页。
单粒子低温电子显微镜的电位差。
P.B.罗森塔尔
(2019).
IUCrJ大学
6
, 988-989.
MicroED与Falcon III直接电子探测器。
J.哈特尼
,
M.W.Martynowycz先生
,
P.A.Penczek先生
&
T.戈恩
(2019).
IUCrJ大学
6
, 921-926.
CFA/I菌毛棒的冷冻电镜结构。
W.Zheng先生
,
M.安德森
,
N.Mortezaei公司
,
E.布利特
&
E.埃格曼
(2019).
IUCrJ大学
6
, 815-821.
低温电磁结构
粗糙脉孢菌
呼吸复合物IV。
T.鲍瑟文
,
S.Nussberger公司
&
杜尔布兰特
(2019).
IUCrJ大学
6
, 773-780.
纳姆迪纳托
–自动分子动力学——将结构模型灵活地拟合到低温电子显微镜和结晶学实验图中。
R.T.基莫斯
,
J.朱尔
,
P.尼森
,
T.博森
,
J.L.卡尔森
&
B.P.佩德森
(2019).
IUCrJ大学
6
, 526-531.
Cryo-EM揭示了鱿鱼血蓝蛋白的不对称组装。
田中Y
,
S.加藤
,
M.斯塔布林
,
S.Raunser公司
,
松井(T.Matsui)
&
C.加特索加尼斯
(2019).
IUCrJ大学
6
,第426-437页。
来自冰核蛋白InaZ的肽重复序列的同手性和外消旋MicroED结构。
C.泽伊
,
C.格林
,
M.加拉赫-琼斯
,
J.苗
,
C.G.圣地亚哥
,
D.卡西奥
,
T.戈恩
,
M.R.Sawaya先生
&
J.A.罗德里格斯
(2019).
IUCrJ大学
6
, 197-205.
纳米束预处理辅助三维电子衍射揭示了鸡蛋白溶菌酶的一种新的多晶型。
A.兰扎
,
E.角膜缘炎
,
E.穆格奈奥利
,
V.卡佩罗
,
G.加劳
&
M.杰米
(2019).
IUCrJ大学
6
, 178-188.
通过错误发现率控制对低温电子显微镜密度图进行阈值化。
M.贝克斯
,
A.J.雅各比
&
C.萨克斯
(2019).
IUCrJ大学
6
, 18-33.
低温电子显微镜单粒子分析中束流诱导运动校正的贝叶斯方法。
J.齐瓦诺夫
,
T.纳卡内
&
S.H.W.Scheres公司
(2019).
IUCrJ大学
6
, 5-17.
解释低温电磁图。
P.B.罗森塔尔
(2019).
IUCrJ大学
6
, 3-4.
低温电磁革命:为下一阶段提供燃料。
S.Subramaniam公司
(2019).
IUCrJ大学
6
, 1-2.
深度共识
这是一种基于深度学习的方法,用于低温电子显微镜中的粒子修剪。
R.桑切斯·加西亚
,
J.塞古拉
,
D.马卢恩达
,
J.M.卡拉佐
&
C.O.S.索扎诺
(2018).
IUCrJ大学
5
, 854-865.
使用冷冻电子显微镜图谱进行X射线结构测定。
曾丽萍(L.Zeng)
,
W.丁
&
Q.郝
(2018).
IUCrJ大学
5
, 382-389.
实验静电势图中离子的识别。
J.Wang(王)
,
Z.刘
,
J.弗兰克
&
P.B.摩尔
(2018).
IUCrJ大学
5
, 375-381.
组成生物分子的原子的离子散射因子。
K.Yonekura公司
,
R.松冈
,
Y.Yamashita公司
,
T.亚马内
,
池口先生
,
A.基德拉
&
S.Maki-Yonekura公司
(2018).
IUCrJ大学
5
, 348-353.
抑制剂结合细胞色素的X射线和低温电镜结构
公元前
1
用于基于结构的药物发现的复合物。
K.Amporndanai公司
,
R.M.约翰逊
,
P.M.奥尼尔
,
C.W.G.鱼钩
,
A.H.贾姆森
,
S.劳森
,
S.P.Muench公司
,
S.S.哈斯奈
&
S.V.Antonyuk公司
(2018).
IUCrJ大学
5
, 200-210.
氯核糖体的冷冻电镜重建为3.2
24以内的分辨率
小时。
B.O.Forsberg公司
,
S.艾巴拉
,
D.基曼尼斯
,
B.保罗
,
E.林达尔
&
A.娱乐
(2017).
IUCrJ大学
4
, 723-727.
使用分类对齐(ABC)的单片低温电子显微镜:结构
陆生蚯蚓
血红蛋白。
P.阿法纳西耶夫
,
C.西尔·林纳梅尔
,
R.B.G.拉维利
,
R.马塔登
,
圣德卡洛
,
B.阿列文斯
,
R.V.葡萄牙
,
N.S.潘努
,
M.Schatz先生
&
M.van鞋跟
(2017).
IUCrJ大学
4
, 678-694.
冷冻电镜观察乙酰胆碱受体通道附近脂质的分离。
N.安文
(2017).
IUCrJ大学
4
, 393-399.
CryoEM公司
IUCrJ大学
:一个新时代。
S.Subramaniam公司
,
杜尔布兰特
&
R.亨德森
(2016).
IUCrJ大学
三
, 3-7.
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